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LA MODÉLISATION CONCEPTUELLE DES DONNÉES - Ouranos

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Essai de développement<br />

d'une méthode de<br />

cartographie du risque de<br />

présence de l'herbe à poux<br />

au Québec par télédétection<br />

Centre - Eau Terre Environnement<br />

Roland Ngom & Pierre Gosselin<br />

5eme symposium <strong>Ouranos</strong> 19 novembre 2012


P<strong>LA</strong>N<br />

A. Problématique et objectifs<br />

B. Étapes réalisées<br />

C. Étapes à venir<br />

D. Discussion et perspectives<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


A. Problématique et objectifs<br />

Un problème de santé publique susceptible d’être exacerbé par les<br />

changements climatiques<br />

Nom français : Petite herbe à poux<br />

Nom botanique : Ambrosia<br />

artemisiifolia L.<br />

Famille botanique : Composées<br />

Ensoleillement : Plein soleil<br />

Milieu de croissance : Sols pauvres ou<br />

perturbés = plante envahissante<br />

Figure 1: Herbe à poux sur l’Ile de Montréal<br />

Au Québec, une personne sur 6 est allergique au pollen de l’herbe à poux. Il<br />

serait responsable de près de 75 % des allergies saisonnières. C'est l'une des<br />

principales causes de la rhinite allergique et contribue à la prévalence de<br />

l’asthme<br />

En 2005, le gouvernement du Québec a estimé à plus de 155 millions de dollars<br />

les coûts de santé directement reliés à l’herbe à poux<br />

Changements climatiques = plus de pollen dans l’air pendant plus longtemps et<br />

sur plus d’espace (nord du Québec)<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


A. Problématique et objectifs<br />

Contrôler sa distribution spatiale pour mieux intervenir<br />

Méthodes de repérage et de cartographie artisanales vers des méthodes semi<br />

automatisées ou automatisées basées sur la télédétection optique<br />

Différente des méthodes de cartographie<br />

basées sur la localisation GPS suivant les<br />

critères écologiques et l’historique de<br />

repérage (lors des fauches/arrachages):<br />

• Prospection extrêmement aléatoire et<br />

incomplète des territoires<br />

• Probabilité de présence non quantifiée<br />

• Impossibilité d’optimiser les ressources<br />

humaines disponibles<br />

Différente des méthodes de cartographie basées sur la distribution du pollen:<br />

• Aléas dus aux facteurs climatiques (vents)<br />

• Localise partiellement le pollen, mais pas la source du pollen = intervention<br />

limitée<br />

• Utilise des méthodes d’interpolation = Plus forte imprécision<br />

Mais peuvent être complémentaires<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


A. Problématique et objectifs<br />

Contrôler sa distribution spatiale pour mieux intervenir<br />

Méthodes de repérage et de cartographie semi automatisées ou automatisées<br />

basées sur la télédétection optique<br />

Optimiser la gestion territoriale et des ressources pour les municipalités et les<br />

autorités compétentes =<br />

• Une approche prospective de son extension<br />

(notamment vers le nord)<br />

Figure 2: Extension de l’herbe à poux au Québec suivant les<br />

observations dans les cultures herbier<br />

• Une représentation graduelle<br />

du risque<br />

1<br />

0 1<br />

Probabilité nulle de<br />

présence de l’herbe à poux<br />

Probabilité optimale<br />

de présence de<br />

l’herbe à poux<br />

Figure 3: Une probabilité de présence<br />

graduelle<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


B. Étapes réalisées<br />

Préalables: Considérer des critères d’ordre techniques et opérationnels<br />

Capteurs avec<br />

caractéristiques<br />

différentes<br />

Résolution spatiale<br />

Résolution spectrale<br />

Couverture/Portée<br />

Fréquences de<br />

revisites<br />

Coût<br />

Figure 4: Worldview 2 Figure 5: Rapid Eye Figure 6: Spot 4 HRVIR<br />

1,8 m 5 m 10 m<br />

Inclut des nouveaux<br />

spectres dans le rouge<br />

et l’infrarouge<br />

notamment<br />

Inclut des nouveaux<br />

spectres dans le rouge<br />

notamment (point<br />

d’inflexion rouge)<br />

Inclut une bande<br />

infrarouge plus étendue<br />

(Moyen infrarouge)<br />

16,4 km 77 km 80 km<br />

3,7 jours ( Off nadir) 5,5 jours (nadir) 26 jours<br />

1200$/37km2<br />

1340$/1000km2 $ 2250/1200km 2<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


B. Étapes réalisées<br />

Préalables: Considérer des critères d’ordre techniques et opérationnels<br />

Zones test avec une géographie différente<br />

Figure 7: Ile de Montréal<br />

Collecte terrain au GPS (données d’archives)<br />

Figure 8: Valleyfield<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


B. Étapes réalisées<br />

Données terrain et série étendue d’indices issues des images satellites<br />

Corrections<br />

atmosphériques<br />

Images originales<br />

orthorectifiées<br />

Points GPS<br />

localisant<br />

l’Ambroisie<br />

Extractions<br />

Points GPS avec valeurs des bandes<br />

standardisées et indices calculés<br />

Analyses statistiques<br />

(Corrélations)<br />

et selection des variables<br />

significatives<br />

Calculs<br />

d’indices<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


B. Étapes réalisées<br />

Affinage par classification orientée objet et logique floue<br />

Segmentation et<br />

classification<br />

orientée objet<br />

Pas satisfaisant<br />

à cette étape<br />

Images originales<br />

orthorectifiées<br />

Image classifiée incluant<br />

vegetation pertutrbée<br />

Segmentation et<br />

classification<br />

orientée objet<br />

Image classifiée incluant<br />

Végétation perturbée et<br />

herbe à poux<br />

Application d’une<br />

fonction monotone<br />

de croissance<br />

Cartes prédictives<br />

de l’ambroisie<br />

échantillonnage<br />

de l’herbe à<br />

poux<br />

Points GPS avec valeurs des bandes<br />

standardisées et indices calculés<br />

Calcul des<br />

intervalles de<br />

confiances<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


C. Résultats<br />

Figure 7: (a) Carte de<br />

prédiction prédiction d’A. artemisiifolia<br />

selon selon la composante 3 3 de<br />

l’Analyse en Composante<br />

Principale de Worldview 2 de<br />

l’île de Montréal, (b) Zoom sur<br />

la zone nord Est<br />

(a)<br />

La couleur rouge<br />

indique une plus<br />

grande certitude de la<br />

présence de l’herbe l’herbe à<br />

poux, sur une échelle<br />

de de 0 à 1<br />

(b)<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

Zoom fait à partir de la carte 18 (a)<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. P. Gosselin


Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. P. Gosselin


C. Résultats<br />

Moins bonne performance<br />

Pour les les images à<br />

résolution spatiale moins<br />

fine ( spot 4)<br />

Figure 9: Carte de prédiction<br />

d’A. artemisiifolia selon la<br />

bande verte de Spot 4 de<br />

l’île l’île de de Montréal Montréal<br />

*Issu de la méthode de la logique floue<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. P. Gosselin


B. Étapes réalisées<br />

La bande verte et la composante non humide: un meilleur potentiel<br />

discriminant<br />

Seuils Seuil minimum =0,1* Seuil minimum = 0,5**<br />

Variables Sensibilité Spécificité Sensibilité Spécificité<br />

PCA 3 (Worldview 2) 98% 3% 70% 96%<br />

bande 3 (vert) (Worldview 2) 93% 8% 61% 52%<br />

bande 2 (vert) Rapid Eye 61% 70% 56% 95%<br />

PCA 1 (Rapid Eye) 58% 68% 54% 82%<br />

bande 2 (vert) Spot 4 59% 58%<br />

Tableau 1: Performances des variables les plus constantes, significativement et positivement<br />

corrélées à la présence d’A. artemisiifolia lorsqu’appliquées aux points géopositionnés<br />

La bande verte = toujours des bonnes prédictions supérieures à 50%<br />

caractérisée par une proximité spectrale avec la végétation perturbée= confusion<br />

probable avec d’autres espèces envahissantes. Toutefois, l’herbe à poux est parmi<br />

les mauvaises herbes les plus fréquentes, et pouvant constituer jusqu’à 70% par<br />

transect (Vincent et Bergeron 1985)<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


B. Étapes à réaliser<br />

Possibilités d’automatisation<br />

Commande prioritaire<br />

Application de la<br />

fonction monotone<br />

de croissance<br />

Cartes prédictives<br />

Évaluation<br />

positive<br />

Automatisation<br />

Images Rapid Eye orthorectifiées et<br />

atmosphériquement corrigées<br />

Variables les plus prometteuses<br />

recement identifiées<br />

Évaluation<br />

Intervalles de<br />

confiances<br />

optimisés<br />

Évaluation<br />

négative<br />

Évaluation<br />

En Synchronie<br />

Mesures GPS<br />

des plants d’herbe à poux<br />

Recalcul des<br />

Intervalles de<br />

confiances<br />

Nouveaux sets<br />

en logique floue<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


C. Discussion et perspectives<br />

Une aide précieuse à l’optimisation des ressources<br />

Les cartes issues des prédictions pourraient aider à localiser avec une bonne<br />

probabilité les secteurs les plus infestés= optimisation des ressources (temps et<br />

énergie) et meilleure efficacité des fauches (Prévention des rhinites)<br />

Intégrer dans une analyse multicritère<br />

Zones prioritaires<br />

Localisation (identification) par<br />

zonage cadastral et/ou calculs<br />

des rayons pertinents-(Solutions<br />

SIG)<br />

Intervention ciblée<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


Merci pour votre attention<br />

Questions?<br />

Bibliographie<br />

Contacts:<br />

Roland Ngom<br />

roland_pierre.ngom@ete.inrs.ca<br />

Pierre Gosselin<br />

pierre.gosselin@inspq.qc.ca<br />

Centre - Eau Terre Environnement<br />

Remerciements à <strong>Ouranos</strong>, Audrey Smargiarssi et Sophie Gaudreau de la Direction de la santé publique de<br />

l’île de Montréal et à Diane Lyse Benoit de Agriculture et Agroalimentaire Canada pour les données<br />

terrain. Remerciements au Ministère des Ressources naturelles et de la Faune pour les images Spot 4.<br />

Auda et coll. (2008 a ) détection des plantes invasives par télédetection : un cas d’étude, l’ambroisie en région Rhône Alpes, France. International Journal of Remote Sensing. Vol 29, No 4,<br />

1109-1124.<br />

Auda et coll. (2008 b ) Enjeux et perspectives de la télédétection multi temporelle à Très Haute Résolution Spatiale. XIèmes Journées Scientifiques Madagascar 2008<br />

Bassett IJ., Crompton CW. (1975) The biology of Canadian weeds Ambrosia artemisiifolia L. and A. psilostachya DC. Canadian Journal of Plant Science 55:463–476.<br />

Bannari A., Morin D., He DC. (1997) Caractérisation de l’environnement urbain à l’aide des indices de végétation dérivés des données de hautes résolutions spatiale et spectrale.<br />

Télédétection des milieux urbains et périurbains. Éd. AUPELF-UREF. p, 47-64<br />

Chavez PS. (1996). Image-based atmospheric corrections - Revisited and Improved. Photogrammetric Engineering and Remote Sensing 62 (9): 1025-1036.<br />

Joly M., Bertrand P., Gbangou RY., White MC., Dubé J., Lavoie C. (2011) Paving the Way for Invasive Species: Road 1 Type and the Spread of Common Ragweed 2 (Ambrosia<br />

artemisiifolia). Environmental Management Volume: 48, Issue: 3, Pages: 514-522. PubMed: 21710219<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


Maupin P., et Apparicio P. (2004) Relationships between Ambrosia artemisiifolia sites and the physical and social environments of Montreal (Canada). 0-7803-8742-<br />

2/04/$20.00 (C) IEEE.<br />

Maupin P., et Boivin MC. (2001) Reconnaissance des populations d’Ambrosia artemisiifolia sur l’ile de l’île de Montréal à l’aide d’un capteur hyperspectral. Étude des propriétés<br />

spectrales et de l’écologie végétale (L’île de Montréal Canada : direction de la santé publique de l’île de Montréal)<br />

Nádor G., et coll. (2011) Ragweed identification by worldview2 data. Remote Sensing Directorate Institute of Geodesy, Cartography and Remote Sensing.<br />

http://dgl.us.neolane.net/res/img/aa0472a0cae3a1509de171a78a820f29.pdf. Accédé le 16 décembre 2011<br />

Ngom, R., Berrang Ford L., Hongoh, V. (2011). Fuzzy-Logic vs. logistic regression and maximum entropy to predict habitat suitability of relevant vector species in Canada<br />

(Submitted).<br />

Simard MJ., Benoit DL. (2010) Distribution and abundance of an allergenic weed, common 26 ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.), in rural settings of southern Québec, Canada.<br />

27 Canadian Journal of Plant Science 90:549–557<br />

Tanré D., Deroo C., Duhaut P., Herman M., Morcrette J.J., Perbos J. et Deschamps PY. (1986) Simulation of the Satellite Signal in the Solar Spectrum (5S), Document Laboratoire<br />

d’Optique Atmosphérique, 265 p.<br />

G. Vincent and Y. Bergeron, (1985) Weed synecology and dynamics in urban environment. Urban Ecology, vol. 9, no. 2, pp. 161–176.<br />

Ressources internet<br />

Worldview 2: http://worldview2.digitalglobe.com/<br />

Rapid Eye: http://www.rapideye.net/index.html<br />

Spot 4: http://spot4.cnes.fr/spot4_gb/satellit.htm<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


C. Analyses<br />

Standardiser les données brutes<br />

Capteurs Données brutes Réflectances<br />

Worldview 2<br />

Rapid eye<br />

Spot 4<br />

12 bits (0-2260)<br />

11 bits (0-60382)<br />

8 bits (0-255)<br />

Comparaison entre données issues de<br />

capteurs différents et de zones d’études<br />

différentes<br />

Obtenir une information robuste qui soit<br />

reproductible et extrapolable<br />

0-1<br />

0-1<br />

0-1<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


C. Résultats<br />

Confusion spectrale entre végétation dégradée et l’ambroisie<br />

(a) Bande rouge Rapid<br />

Eye (630-685 nm)<br />

(b) Bande proche<br />

infrarouge Rapid Eye<br />

(760-850nm)<br />

(c) ACP 3 Wv2<br />

(d) Bande proche<br />

infrarouge 1 Wv2 (770-<br />

895nm)<br />

(e) Bande proche<br />

infrarouge 2 Wv2<br />

(860-1040nm)<br />

(f) WDVI Wv2<br />

(g) Bande point<br />

d’inflexion rouge Wv2<br />

(705-745nm)<br />

Figure 6: Analyse du degré de croisement entre A. artemisiifolia (en noir) et la végétation perturbée (en<br />

bleu) : (a) Bande rouge Rapid Eye; (b) Bande proche infrarouge Rapid Eye; (c) Composante 3 de l’analyse<br />

ACP de Wordlview 2; (d) Bande proche infrarouge 1 Wordlview 2; (e) Bande proche infrarouge 2 Wv2 ;(f)<br />

Weighed Difference Vegetation Index (WDVI) de Wordlview 2; (g) Bande point d’inflexion rouge de<br />

Wordlview 2.<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


Construction des indices de végétation<br />

Une variété d’indices de végétation adaptés à différents milieux écologiques<br />

Indice Définition<br />

Variable indépendante dans le<br />

calcul du profil du sol intégré<br />

Appliqué au produit<br />

NDVI Normalized Difference Vegetation Index Wv2, Rapid Eye, Spot 4<br />

TVI Transformed vegetation Index Wv2, Rapid Eye, Spot 4<br />

TTVI Thiam's Transformed Vegetation Index Wv2, Rapid Eye, Spot 4<br />

Ratio Ratio Wv2, Rapid Eye<br />

MSAVI1 Modified Soil-Adjusted vegetation Index 1 Wv2, Rapid Eye<br />

MSAVI 2 Modified Soil-Adjusted vegetation Index 2 Wv2, Rapid Eye<br />

TSAVI1 Transformed soil Adjusted vegetation Index 1 Rouge, point d’inflexion rouge Wv2, Rapid Eye<br />

TSAVI2 Transformed soil Adjusted vegetation Index 2 Rouge, point d’inflexion rouge Wv2, Rapid Eye<br />

RVI Ratio Vegetation Index Wv2, Rapid Eye, Spot 4<br />

NRVI Normalized Ratio Vegetation Index Wv2, Rapid Eye, Spot 4<br />

PVI Perpendicular Vegetation Index Proche infrarouge 1 et 2 Wv2, Rapid Eye<br />

PVI1 Perpendicular Vegetation Index1 Proche infrarouge 1 et 2 Wv2, Rapid Eye<br />

PVI2 Perpendicular Vegetation Index2 Rouge, point d’inflexion rouge Wv2, Rapid Eye<br />

PVI3 Perpendicular Vegetation Index3 Rouge, point d’inflexion rouge Wv2, Rapid Eye<br />

DVI Difference Vegetation Index Wv2, Rapid Eye<br />

WDVI Weighed Difference Vegetation Index Proche infrarouge 1 et 2 Wv2, Rapid Eye<br />

CTVI Corrected Transformed Vegetation Index Wv2, Rapid Eye, Spot 4<br />

AVI Ashburn Vegetation Index Wv2, Rapid Eye<br />

SAVI Soil Adjusted vegetation Index Wv2, Rapid Eye<br />

DVI Difference Vegetation Index Proche infrarouge 1 et 2 Wv2, Rapid Eye<br />

Tableau 1: Liste des indices de végétation calculés<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin


Figure 6: Fonction d’appartenance à croissance monotone (Ngom et coll., 2011).<br />

Centre - Eau Terre<br />

Environnement<br />

23 novembre 2012<br />

R. Ngom<br />

P. Gosselin

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