Curriculum Vitae - APC - Université Paris Diderot-Paris 7

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28.06.2013 Views

Mon séjour devrait me permettre d’obtenir de nombreuses données sur la migration de cellules cancéreuses dans des matrices en 3 dimensions et sur leurs interactions avec des cellules de cette matrice, que nous pourrons exploiter à mon retour, au sein du laboratoire IMNC. Nous pourrons développer un modèle tout d’abord discret, bien adapté aux expériences de biologie cellulaire, puis en passant à la limite continue, extrapoler à un grand nombre de cellule pour prévoir l’effet sur une tumeur entière. De plus, j’établirai une nouvelle collaboration internationale pour l’équipe, et je devrais continuer à obtenir de nouvelles données même après mon retour. Plus personnellement, une année de CRCT me permettrait de renforcer la double compétence expérimentale et théorique que j’avais acquise durant mon doctorat sur les moteurs moléculaires. Pour une modélisatrice, l’immersion dans les expérimentations est en effet primordiale non seulement pour acquérir des données indispensables à la confrontation du modèle avec la réalité biologique mais également pour utiliser les modélisations comme force de proposition pour de nouvelles expérimentations. Ainsi, je devrais acquérir des savoir-faire dans des expériences de migration de cellules tumorales (fabrication de sphéroïdes, implantation dans des gels de collagène, imagerie optique etc…) qui vont me permettre de renouer avec les expériences d’une part et éventuellement à terme, de développer un nouvel axe de recherche expérimental, en collaboration avec l’équipe Imagerie per-opératoire du laboratoire. J’ai fait la demande également d’une année de délégation CNRS et de CRCT au CNU. Pour l’instant, je n’ai pas eu de réponse, mais bien sûr, je vous informerai si j’obtiens l’un ou l’autre, pour 6 mois ou pour un an. Cordialement Mathilde Badoual

Recherche Depuis 2004, je travaille sur deux thèmes de recherche: - la modélisation de croissance de tumeurs - la modélisation de croissance de colonies de bactéries Avec Basile Grammaticos, nous avons encadré la thèse de Marine Aubert (septembre 2005juin 2008) sur la modélisation de la migration de cellules tumorales. Nous disposions de données expérimentales sur la migration de cellules tumorales issues de gliomes, en 2D et en 3D, sur différents substrats (collaboration: Christo Christov, hopital Henri Mondor). Nous avons développé un modèle basé sur un automate cellulaire, qui reprduisant bien les resultants expérimentaux. Notamment, nous avons mis en valeur grace au modèle, l’aspect d’adhésion mal connu des junctions communicantes qui se forment entre les cellules tumorales en migration, mais également entre cellules tumorales et cellules de meme type, saines, dans le subtrat. Cette adhésion avec les cellules saines du substrat semble favoriser la migration des cellules tumorales. Notre modèle prévoit que l’inhibition de ces junctions permettrait de réduire l’invasion à l’échelle d’une tumeur et donc d’augmenter l’espérance de vie des patients. Nous avons poursuivi nos activités dans ce domaine par une étude plus clinique, en collaboration avec des médecins de l’Hopital Sainte-Anne à Paris avec la thèse de Chloé Gerin (octobre 2009-septembre 2012). Nous modélisons les gliomes de bas-grade par une equation de diffusion-prolifération. Ce modèle prévoit une vitesse constante d’expansion du rayon de la tumeur à temps long, ce qui est cliniquement observé. Nous avons utilisé ce modèle pour remonter à la date de naissance de ces tumeurs. Nous en avons déduit l’age moyen des patients au moment de l’apparition de la tumeur. Nous avons mis en évidence deux populations de tumeurs : une première dont la vitesse de croissance radiale est très faible (entre 0.5 et 2 mm/an), qui apparaissent vers 15 ans et une seconde dont la vitesse est entre 2 et 4 mm/an), qui apparaissent vers 20 ans. Il serait maintenant intéressant d’étudier si ces deux populations correspondent à deux types de tumeurs de tumeurs biologiquement différents (par exemple avec des mutations différentes) et qui pourraient répondre à des traitements différents par exemple. Nous analysons également des lames histologiques provenant de biopsies étagées de patients atteints de gliomes de bas-grade, afin mieux comprendre quels sont les profils de densité cellulaire, de prolifération, d’oedème associés à ces tumeurs. Plusieurs stagiaires (Patrick Derbez, stagiaire L3; Xavier Mézanges, stagiaire M2) ont travaillé sur le thème de la croissance de colonies de bactéries. L’objectif est de déveloper des modèles biophysiques de migration et de proliferation des bactéries, permettant de reproduire des résultats expérimentaux comme le diagramme morphologique: les colonies de bactéries ont des formes très différentes lorsque l’on fait varier la concentration d’agar du milieu ainsi que la concentration en nutriments. Cinq formes ont notamment été identifiées (forme compact, en anneaux, diffuse, branches fines et branches épaisses). Aucun modèle n’avait jusqu’à present réussi à reproduire de manière satisfaisante les cinq formes du diagramme. Activités administratives:

Mon séjour devrait me permettre d’obtenir de nombreuses données sur la migration de<br />

cellules cancéreuses dans des matrices en 3 dimensions et sur leurs interactions avec des<br />

cellules de cette matrice, que nous pourrons exploiter à mon retour, au sein du laboratoire<br />

IMNC. Nous pourrons développer un modèle tout d’abord discret, bien adapté aux<br />

expériences de biologie cellulaire, puis en passant à la limite continue, extrapoler à un grand<br />

nombre de cellule pour prévoir l’effet sur une tumeur entière.<br />

De plus, j’établirai une nouvelle collaboration internationale pour l’équipe, et je devrais<br />

continuer à obtenir de nouvelles données même après mon retour.<br />

Plus personnellement, une année de CRCT me permettrait de renforcer la double compétence<br />

expérimentale et théorique que j’avais acquise durant mon doctorat sur les moteurs<br />

moléculaires. Pour une modélisatrice, l’immersion dans les expérimentations est en effet<br />

primordiale non seulement pour acquérir des données indispensables à la confrontation du<br />

modèle avec la réalité biologique mais également pour utiliser les modélisations comme force<br />

de proposition pour de nouvelles expérimentations. Ainsi, je devrais acquérir des savoir-faire<br />

dans des expériences de migration de cellules tumorales (fabrication de sphéroïdes,<br />

implantation dans des gels de collagène, imagerie optique etc…) qui vont me permettre de<br />

renouer avec les expériences d’une part et éventuellement à terme, de développer un nouvel<br />

axe de recherche expérimental, en collaboration avec l’équipe Imagerie per-opératoire du<br />

laboratoire.<br />

J’ai fait la demande également d’une année de délégation CNRS et de CRCT au CNU. Pour<br />

l’instant, je n’ai pas eu de réponse, mais bien sûr, je vous informerai si j’obtiens l’un ou<br />

l’autre, pour 6 mois ou pour un an.<br />

Cordialement<br />

Mathilde Badoual

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