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Contributions à l'étude de la classification spectrale et applications

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158 Extraction <strong>de</strong> connaissances appliquée <strong>à</strong> <strong>la</strong> biologie <strong>et</strong> l’imagerie médicale<br />

niques <strong>de</strong> seuil<strong>la</strong>ges pourraient être envisagées toujours dans le but <strong>de</strong> réduire les coûts. De même, le<br />

coût numérique lié au calcul <strong>de</strong>s vecteurs propres <strong>et</strong> <strong>de</strong>s valeurs propres peut être réduit <strong>à</strong> l’ai<strong>de</strong> <strong>de</strong><br />

métho<strong>de</strong>s <strong>de</strong> Lanczos <strong>et</strong> d’Arnoldi par exemple. L’aspect "réduit" ou même re<strong>la</strong>tivement "cubique"<br />

<strong>de</strong>s sous-domaines <strong>de</strong> calcul n’est pas pris en compte <strong>et</strong> pourrait orienter plus précisément le choix<br />

es algorithmes <strong>à</strong> employer. Par ailleurs, un lien avec <strong>la</strong> recherche d’une interprétation du spectral<br />

clustering comme approximation d’un problème spectral <strong>de</strong> chaleur avec conditions <strong>de</strong> Neumann,<br />

l’introduction a priori <strong>de</strong>s information sur les vecteurs propres recherchés perm<strong>et</strong>traient <strong>de</strong> simplifier<br />

les calculs (limitation <strong>de</strong> l’espace <strong>de</strong> recherche <strong>de</strong>s vecteurs propres ou utilisation <strong>de</strong> métho<strong>de</strong>s <strong>de</strong><br />

projection adaptées,..).<br />

Enfin, en ce qui concerne les <strong>applications</strong> <strong>à</strong> <strong>la</strong> biologie <strong>et</strong> <strong>à</strong> l’imagerie médicale introduites, <strong>de</strong>ux<br />

pistes d’améliorations se détachent.<br />

Tout d’abord, <strong>la</strong> confrontation avec le mon<strong>de</strong> génomique a montré qu’un pré-traitement <strong>de</strong>s<br />

données via une normalisation perm<strong>et</strong> d’améliorer considérablement les résultats. Le mo<strong>de</strong> expérimental<br />

propre aux biopuces nous pousse <strong>à</strong> considérer les erreurs issues <strong>de</strong> l’hybridation <strong>de</strong>s son<strong>de</strong>s.<br />

Ainsi envisager une métho<strong>de</strong> <strong>de</strong> spectral clustering avec <strong>de</strong>s données par intervalles pourrait définir<br />

<strong>de</strong>s clusters avec une marge d’erreur.<br />

Finalement, dans le cadre <strong>de</strong> l’imagerie TEP, il serait intéressant d’étudier dans quelle mesure<br />

l’eff<strong>et</strong> <strong>de</strong>s volumes partiels biaisent, dans <strong>la</strong> théorie, les résultats du spectral clustering. En outre,<br />

<strong>la</strong> stratégie parallèle reste <strong>à</strong> appliquer dans le cas <strong>de</strong> voxels. Enfin, dans ces <strong>de</strong>ux domaines, nous<br />

avons traité <strong>de</strong>s données temporelles. Il serait intéressant d’incorporer c<strong>et</strong>te information d’évolution<br />

dans le fonctionnement <strong>de</strong> <strong>la</strong> métho<strong>de</strong> <strong>et</strong> dans <strong>la</strong> définition du paramètre <strong>de</strong> l’affinité gaussienne. De<br />

même, <strong>la</strong> stratégie parallèle reposant sur une décomposition en sous-domaines, un problème serait<br />

<strong>de</strong> savoir comment inclure l’information en amont sur l’ensemble <strong>de</strong>s données d’un sous-domaine.

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