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3.2.Gestion des gènes d'hyperovulation en Lacaune Ovitest

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Objectif<br />

GESTION DES GENES<br />

D ’ HYPERPROLIFICITE DANS<br />

LE SCHEMA DE SELECTION<br />

LACAUNE VIANDE OVITEST<br />

<strong>en</strong> collaboration avec l ’INRA et l’Institut de l’Elevage :<br />

B. Astruc, L. Bodin, B. Giral-Viala, J. Hallauer, J. Raoul<br />

FRANCE GENETIQUE ELEVAGE<br />

Journées Techniques Ovins Allaitants<br />

ST AFFRIQUE 12 et 13 AVRIL 2011<br />

LE SCHEMA OVITEST VIANDE<br />

Améliorer le rev<strong>en</strong>u de l ’atelier ovin par la productivité<br />

Donc améliorer :<br />

- la prolificité naturelle / la valeur laitière<br />

- les critères bouchers<br />

- la maîtrise sanitaire<br />

1976 : Mise <strong>en</strong> place d ’un programme de sélection avec testage<br />

sur <strong>des</strong>c<strong>en</strong>dances à la demande d ’un groupe d ’éleveurs<br />

1


%<br />

220<br />

210<br />

200<br />

190<br />

180<br />

170<br />

160<br />

150<br />

140<br />

130<br />

120<br />

110<br />

138<br />

124<br />

152<br />

166<br />

135<br />

154<br />

169<br />

144<br />

177 180<br />

157<br />

Evolution de la prolificité<br />

Elevages <strong>en</strong> sélection<br />

173<br />

200<br />

178<br />

191<br />

187<br />

174<br />

202<br />

197<br />

183<br />

204<br />

198<br />

191 192 193<br />

175<br />

176<br />

172<br />

196 195<br />

184<br />

175 171<br />

100<br />

75 , , 80 82 84 86 88 90 92 94 95 96 97 98 99 00 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10<br />

Brebis MN + IA Agnelles MN<br />

LES ETAPES<br />

1992 : Observation « d ’anomalies » sur index<br />

prolificité père / fils et une augm<strong>en</strong>tation de<br />

portées surnuméraires<br />

1996 : Plafonnem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> index asc<strong>en</strong>dances <strong>des</strong><br />

futurs reproducteurs du testage<br />

Protocole de recherche avec l’Inra<br />

- brebis hyper-prolifiques<br />

- mise <strong>en</strong> testage de 3 béliers supposés<br />

porteurs<br />

du gène majeur<br />

192<br />

180<br />

2


LES ETAPES<br />

1996-1999 : Mesure <strong>des</strong> taux d ’ovulation <strong>des</strong><br />

filles<br />

1999 : Mise <strong>en</strong> évid<strong>en</strong>ce de la prés<strong>en</strong>ce d ’un<br />

gène majeur<br />

2000 : Repérage du gène BMP 15 dans la<br />

population <strong>Lacaune</strong> Viande et<br />

d ’un gène spécifique <strong>Lacaune</strong> <strong>Ovitest</strong><br />

2002 : Début du génotypage <strong>des</strong> béliers du CIA<br />

et <strong>des</strong> futurs reproducteurs<br />

LES ETAPES<br />

2007 : Localisation de la mutation par marqueur<br />

bipolaire LAC-3<br />

2009 : Analyse <strong>en</strong> routine d sur marqueur Lac-3<br />

Chiffrage de l ’effet du gène sur la<br />

prolificité<br />

2010 : Début du génotypage Lac-3 <strong>des</strong> agnelles de<br />

la base de sélection et <strong>des</strong> mâles de MN<br />

3


Les <strong>gènes</strong> d'ovulation <strong>en</strong> <strong>Lacaune</strong><br />

Viande <strong>Ovitest</strong><br />

La mutation BMP15<br />

portée Sur par le chromosome le chromosome X X<br />

Fréqu<strong>en</strong>ce du gène : 2002 ± 6% (femelles)<br />

2010 < 1 % (mâles)<br />

Nom<strong>en</strong>clature X*<br />

La mutation BMP15<br />

portée par le chromosome X<br />

Caractéristiques :<br />

Hyper-ovulation à l’état hétérozygote<br />

Stérilité à l’état homozygotea<br />

arrêt du développem<strong>en</strong>t de l'ovaire à un stade<br />

très précoce<br />

Transmis d’un père à toutes ses filles<br />

à aucun de ses fils<br />

1 seul ancêtre commun : 12.110.149.74.0674<br />

4


La mutation BMP15<br />

portée par le chromosome X<br />

Choix de la coopérative :<br />

. Eradication de la mutation<br />

Les <strong>gènes</strong> d'ovulation <strong>en</strong> <strong>Lacaune</strong><br />

Viande <strong>Ovitest</strong><br />

Le gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />

Nom<strong>en</strong>clature : LL . L+ . ++<br />

5


Nom<strong>en</strong>clature<br />

Les <strong>gènes</strong> d'ovulation <strong>en</strong> <strong>Lacaune</strong> Viande<br />

<strong>Ovitest</strong><br />

Non porteurs<br />

Hypothèse <strong>des</strong> distributions<br />

++<br />

Hétérozygotes<br />

porteurs<br />

L+<br />

Le gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />

Estimations <strong>des</strong> fréqu<strong>en</strong>ces et<br />

performances par génotype<br />

Fréqu<strong>en</strong>ce<br />

Mâles Femelles<br />

Prolificité<br />

induite<br />

Homozygotes<br />

porteurs<br />

LL<br />

Index Prolificité<br />

Effet du<br />

gène sur<br />

la<br />

prolificité<br />

++ 56% 60% 156% 0,00<br />

L+ 39% 35% 215% 0,20<br />

LL 6% 5% 260% 0,30<br />

6


Gestion du gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />

Effet de la mutation <strong>Lacaune</strong> sur la prolificité<br />

<strong>des</strong> brebis<br />

Etude Eté 2010<br />

Effet de la mutation <strong>Lacaune</strong> sur la prolificité<br />

<strong>des</strong> brebis<br />

• Bilan 1985-2009 sur la prolificité et la mortalité<br />

• Génotypage d’un échantillon de la population sur le<br />

marqueur Lac3<br />

– Brebis appart<strong>en</strong>ant à la base de sélection et ayant au<br />

moins 4 mises-bas sur œstrus naturel (soit 315<br />

animaux)<br />

• Enquête auprès d ’un groupe de sélectionneurs<br />

7


Distribution de la prolificité sur monte naturelle<br />

<strong>en</strong> fonction <strong>des</strong> génotypes<br />

176%<br />

217%<br />

++<br />

L+<br />

Effet de la mutation <strong>Lacaune</strong> sur la prolificité<br />

<strong>des</strong> brebis <strong>en</strong> monte naturelle<br />

Prolificité moy<strong>en</strong>ne <strong>des</strong> ++ = 1,76 (n=245)<br />

Prolificité moy<strong>en</strong>ne <strong>des</strong> L+ = 2,17 (n=65)<br />

60%<br />

50%<br />

40%<br />

30%<br />

20%<br />

10%<br />

0%<br />

1 2 3 4<br />

Taille <strong>des</strong> portées<br />

Brebis ++<br />

Brebis L+<br />

+14,6 % de portées triples et -12,4 % de portées simples pour les L+<br />

+ 0,41 agneau / MB pour<br />

les brebis L+<br />

Distribution<br />

<strong>des</strong> tailles de<br />

portées <strong>en</strong><br />

fonction du<br />

génotype<br />

8


Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />

• L’échantillon étudié<br />

– 12 sélectionneurs participant au bureau de suivi<br />

du programme viande OVI-TEST<br />

– 2 sélectionneurs pour tester le questionnaire<br />

• Questionnaire d’<strong>en</strong>quête composé de 38 questions<br />

– Prolificité / carrières <strong>des</strong> brebis<br />

– Gestion <strong>des</strong> portées triples<br />

– Gestion <strong>des</strong> réformes<br />

– Mortalité et tailles de portées<br />

– Gestion et intérêt de la mutation <strong>Lacaune</strong><br />

Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />

1 - Jugem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> éleveurs <strong>en</strong>quêtés sur la prolificité :<br />

Prolificité idéale moy<strong>en</strong>ne = 2,1 agneaux/mise bas<br />

9


Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />

2 - Le jugem<strong>en</strong>t sur la distribution <strong>des</strong> tailles de portées<br />

Proportion acceptable de portées simples : 15%<br />

Proportion acceptable de portées triples : 25%<br />

Distributions <strong>des</strong> tailles de portées <strong>en</strong> fonction <strong>des</strong><br />

génotypes<br />

1 agneau 2 agneaux 3 agneaux<br />

4 agneaux<br />

et plus<br />

Distribution <strong>des</strong> brebis ++ 34% 56% 9% 1%<br />

Distribution <strong>des</strong> brebis L+ 22% 47% 24% 7%<br />

Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />

Bilan sur les <strong>en</strong>quêtes<br />

3 - L’intérêt de la mutation <strong>Lacaune</strong> dans le<br />

programme de sélection<br />

Tous les sélectionneurs <strong>en</strong>quêtés estim<strong>en</strong>t que la<br />

mutation est intéressante dans les élevages <strong>en</strong> sélection<br />

Quelques sélectionneurs estim<strong>en</strong>t que cette mutation<br />

n’est pas intéressante pour les acheteurs d’agnelles<br />

10


Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />

Bilan sur les <strong>en</strong>quêtes<br />

• Les sélectionneurs appréci<strong>en</strong>t les portées triples et<br />

souhait<strong>en</strong>t <strong>en</strong> avoir plus<br />

• Ils estim<strong>en</strong>t à l’inverse avoir trop de portées<br />

simples et souhait<strong>en</strong>t voir leur nombre diminuer<br />

• Les performances souhaitées par les éleveurs sont<br />

proches de celles obt<strong>en</strong>ues par les brebis L+<br />

Gestion du gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />

Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />

- Système actuel<br />

- Projet mis <strong>en</strong> place<br />

- Perspectives<br />

11


Actuellem<strong>en</strong>t<br />

• Définir un seuil de prolificité<br />

au <strong>des</strong>sus du seuil : accouplem<strong>en</strong>t avec mâles ++<br />

<strong>en</strong> <strong>des</strong>sous : accouplem<strong>en</strong>t avec mâles LL ou L+<br />

dans un premier temps utiliser <strong>des</strong> mâles L+<br />

pour augm<strong>en</strong>ter le seuil tout <strong>en</strong> générant moins de LL<br />

• Utilisation de prédictions à partir de généalogies<br />

•Génotypage <strong>des</strong> reproducteurs mâles d ’IA<br />

Actuellem<strong>en</strong>t<br />

Système sans génotypage de femelles<br />

Système sans génotypage de femelles<br />

ΓL+<br />

boucherie<br />

Ε ++<br />

Ε L+<br />

Ε ++<br />

Ε ++<br />

Ε L+<br />

Ε LL<br />

Ε L+<br />

Ε ++<br />

Ε ++<br />

Ε L+<br />

Γ ++<br />

r<strong>en</strong>ouvellem<strong>en</strong>t<br />

Prolificité<br />

12


• Objectifs :<br />

Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />

– Améliorer la productivité <strong>des</strong> brebis par<br />

l’utilisation de la mutation <strong>Lacaune</strong> (femelles<br />

L+)<br />

– Éviter la procréation d’agnelles LL dont la<br />

prolificité est trop élevée<br />

– Schéma simple – pas d’<strong>en</strong>treti<strong>en</strong> de béliers LL<br />

– Limiter le nombre de génotypages<br />

– Maximiser le pot<strong>en</strong>tiel de diffusion d’agnelles<br />

Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />

13


Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />

Avantages de la stratégie 50% L+ et 50% ++<br />

• Augm<strong>en</strong>tation du nombre d’agneaux produits par<br />

augm<strong>en</strong>tation de la fréqu<strong>en</strong>ce de l’allèle L<br />

• R<strong>en</strong>dem<strong>en</strong>t <strong>en</strong> génotypage : seuls les animaux LL<br />

seront éliminés<br />

• Nombre de candidats à la sélection maximum<br />

• Pot<strong>en</strong>tiel de diffusion d’agnelles sécurisé<br />

Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />

Avantages de la stratégie 50% L+ et 50% ++<br />

• Evolution modérée et progressive <strong>des</strong> fréqu<strong>en</strong>ces<br />

génotypiques dans la population<br />

– Acceptation <strong>des</strong> éleveurs<br />

– Possibilité de fonctionnem<strong>en</strong>t adapté à chaque<br />

élevage<br />

• Connaissance de la structure génotypique de la<br />

population<br />

– = gestion fine de la mutation + indexation<br />

pr<strong>en</strong>ant <strong>en</strong> compte l’effet du génotype (Progrès<br />

génétique indép<strong>en</strong>damm<strong>en</strong>t de la mutation)<br />

14


La mise <strong>en</strong> place<br />

Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />

• Génotypage de tous les reproducteurs mâles (Lac3<br />

et BMP15)<br />

• Génotypage <strong>des</strong> agnelles de r<strong>en</strong>ouvellem<strong>en</strong>t<br />

• Accouplem<strong>en</strong>ts <strong>en</strong> fonction <strong>des</strong> génotypes :<br />

– I.A. : accouplem<strong>en</strong>ts croisés<br />

– MN : accouplem<strong>en</strong>ts avec <strong>des</strong> mâles ++<br />

• Accouplem<strong>en</strong>ts sans connaissance du génotype :<br />

– Accouplem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> brebis avec <strong>des</strong> index<br />

extrêmes à <strong>des</strong> mâles non-porteurs<br />

Premiers résultats issus <strong>des</strong> génotypages et<br />

perspectives<br />

Résultats génotypages 2011<br />

• 1425 agnelles, 23 élevages<br />

• 31,5% de brebis avec la mutation (dont 29%<br />

simple-porteuses)<br />

• De 7 à 42% <strong>en</strong> fonction <strong>des</strong> élevages<br />

15


Perspectives :<br />

Premiers résultats issus <strong>des</strong> génotypages et<br />

perspectives<br />

• A court-terme :<br />

– Fin du plafonnem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> index<br />

– Sélection <strong>des</strong> mâles intra-génotype<br />

• A moy<strong>en</strong>-terme :<br />

– Amélioration de la connaissance de l’effet de<br />

la mutation sur les performances : analyse<br />

<strong>des</strong> données <strong>des</strong> brebis génotypées.<br />

– Evolution du modèle d’indexation : prise <strong>en</strong><br />

compte de l’effet du génotype.<br />

16

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