3.2.Gestion des gènes d'hyperovulation en Lacaune Ovitest
3.2.Gestion des gènes d'hyperovulation en Lacaune Ovitest
3.2.Gestion des gènes d'hyperovulation en Lacaune Ovitest
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Objectif<br />
GESTION DES GENES<br />
D ’ HYPERPROLIFICITE DANS<br />
LE SCHEMA DE SELECTION<br />
LACAUNE VIANDE OVITEST<br />
<strong>en</strong> collaboration avec l ’INRA et l’Institut de l’Elevage :<br />
B. Astruc, L. Bodin, B. Giral-Viala, J. Hallauer, J. Raoul<br />
FRANCE GENETIQUE ELEVAGE<br />
Journées Techniques Ovins Allaitants<br />
ST AFFRIQUE 12 et 13 AVRIL 2011<br />
LE SCHEMA OVITEST VIANDE<br />
Améliorer le rev<strong>en</strong>u de l ’atelier ovin par la productivité<br />
Donc améliorer :<br />
- la prolificité naturelle / la valeur laitière<br />
- les critères bouchers<br />
- la maîtrise sanitaire<br />
1976 : Mise <strong>en</strong> place d ’un programme de sélection avec testage<br />
sur <strong>des</strong>c<strong>en</strong>dances à la demande d ’un groupe d ’éleveurs<br />
1
%<br />
220<br />
210<br />
200<br />
190<br />
180<br />
170<br />
160<br />
150<br />
140<br />
130<br />
120<br />
110<br />
138<br />
124<br />
152<br />
166<br />
135<br />
154<br />
169<br />
144<br />
177 180<br />
157<br />
Evolution de la prolificité<br />
Elevages <strong>en</strong> sélection<br />
173<br />
200<br />
178<br />
191<br />
187<br />
174<br />
202<br />
197<br />
183<br />
204<br />
198<br />
191 192 193<br />
175<br />
176<br />
172<br />
196 195<br />
184<br />
175 171<br />
100<br />
75 , , 80 82 84 86 88 90 92 94 95 96 97 98 99 00 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10<br />
Brebis MN + IA Agnelles MN<br />
LES ETAPES<br />
1992 : Observation « d ’anomalies » sur index<br />
prolificité père / fils et une augm<strong>en</strong>tation de<br />
portées surnuméraires<br />
1996 : Plafonnem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> index asc<strong>en</strong>dances <strong>des</strong><br />
futurs reproducteurs du testage<br />
Protocole de recherche avec l’Inra<br />
- brebis hyper-prolifiques<br />
- mise <strong>en</strong> testage de 3 béliers supposés<br />
porteurs<br />
du gène majeur<br />
192<br />
180<br />
2
LES ETAPES<br />
1996-1999 : Mesure <strong>des</strong> taux d ’ovulation <strong>des</strong><br />
filles<br />
1999 : Mise <strong>en</strong> évid<strong>en</strong>ce de la prés<strong>en</strong>ce d ’un<br />
gène majeur<br />
2000 : Repérage du gène BMP 15 dans la<br />
population <strong>Lacaune</strong> Viande et<br />
d ’un gène spécifique <strong>Lacaune</strong> <strong>Ovitest</strong><br />
2002 : Début du génotypage <strong>des</strong> béliers du CIA<br />
et <strong>des</strong> futurs reproducteurs<br />
LES ETAPES<br />
2007 : Localisation de la mutation par marqueur<br />
bipolaire LAC-3<br />
2009 : Analyse <strong>en</strong> routine d sur marqueur Lac-3<br />
Chiffrage de l ’effet du gène sur la<br />
prolificité<br />
2010 : Début du génotypage Lac-3 <strong>des</strong> agnelles de<br />
la base de sélection et <strong>des</strong> mâles de MN<br />
3
Les <strong>gènes</strong> d'ovulation <strong>en</strong> <strong>Lacaune</strong><br />
Viande <strong>Ovitest</strong><br />
La mutation BMP15<br />
portée Sur par le chromosome le chromosome X X<br />
Fréqu<strong>en</strong>ce du gène : 2002 ± 6% (femelles)<br />
2010 < 1 % (mâles)<br />
Nom<strong>en</strong>clature X*<br />
La mutation BMP15<br />
portée par le chromosome X<br />
Caractéristiques :<br />
Hyper-ovulation à l’état hétérozygote<br />
Stérilité à l’état homozygotea<br />
arrêt du développem<strong>en</strong>t de l'ovaire à un stade<br />
très précoce<br />
Transmis d’un père à toutes ses filles<br />
à aucun de ses fils<br />
1 seul ancêtre commun : 12.110.149.74.0674<br />
4
La mutation BMP15<br />
portée par le chromosome X<br />
Choix de la coopérative :<br />
. Eradication de la mutation<br />
Les <strong>gènes</strong> d'ovulation <strong>en</strong> <strong>Lacaune</strong><br />
Viande <strong>Ovitest</strong><br />
Le gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />
Nom<strong>en</strong>clature : LL . L+ . ++<br />
5
Nom<strong>en</strong>clature<br />
Les <strong>gènes</strong> d'ovulation <strong>en</strong> <strong>Lacaune</strong> Viande<br />
<strong>Ovitest</strong><br />
Non porteurs<br />
Hypothèse <strong>des</strong> distributions<br />
++<br />
Hétérozygotes<br />
porteurs<br />
L+<br />
Le gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />
Estimations <strong>des</strong> fréqu<strong>en</strong>ces et<br />
performances par génotype<br />
Fréqu<strong>en</strong>ce<br />
Mâles Femelles<br />
Prolificité<br />
induite<br />
Homozygotes<br />
porteurs<br />
LL<br />
Index Prolificité<br />
Effet du<br />
gène sur<br />
la<br />
prolificité<br />
++ 56% 60% 156% 0,00<br />
L+ 39% 35% 215% 0,20<br />
LL 6% 5% 260% 0,30<br />
6
Gestion du gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />
Effet de la mutation <strong>Lacaune</strong> sur la prolificité<br />
<strong>des</strong> brebis<br />
Etude Eté 2010<br />
Effet de la mutation <strong>Lacaune</strong> sur la prolificité<br />
<strong>des</strong> brebis<br />
• Bilan 1985-2009 sur la prolificité et la mortalité<br />
• Génotypage d’un échantillon de la population sur le<br />
marqueur Lac3<br />
– Brebis appart<strong>en</strong>ant à la base de sélection et ayant au<br />
moins 4 mises-bas sur œstrus naturel (soit 315<br />
animaux)<br />
• Enquête auprès d ’un groupe de sélectionneurs<br />
7
Distribution de la prolificité sur monte naturelle<br />
<strong>en</strong> fonction <strong>des</strong> génotypes<br />
176%<br />
217%<br />
++<br />
L+<br />
Effet de la mutation <strong>Lacaune</strong> sur la prolificité<br />
<strong>des</strong> brebis <strong>en</strong> monte naturelle<br />
Prolificité moy<strong>en</strong>ne <strong>des</strong> ++ = 1,76 (n=245)<br />
Prolificité moy<strong>en</strong>ne <strong>des</strong> L+ = 2,17 (n=65)<br />
60%<br />
50%<br />
40%<br />
30%<br />
20%<br />
10%<br />
0%<br />
1 2 3 4<br />
Taille <strong>des</strong> portées<br />
Brebis ++<br />
Brebis L+<br />
+14,6 % de portées triples et -12,4 % de portées simples pour les L+<br />
+ 0,41 agneau / MB pour<br />
les brebis L+<br />
Distribution<br />
<strong>des</strong> tailles de<br />
portées <strong>en</strong><br />
fonction du<br />
génotype<br />
8
Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />
• L’échantillon étudié<br />
– 12 sélectionneurs participant au bureau de suivi<br />
du programme viande OVI-TEST<br />
– 2 sélectionneurs pour tester le questionnaire<br />
• Questionnaire d’<strong>en</strong>quête composé de 38 questions<br />
– Prolificité / carrières <strong>des</strong> brebis<br />
– Gestion <strong>des</strong> portées triples<br />
– Gestion <strong>des</strong> réformes<br />
– Mortalité et tailles de portées<br />
– Gestion et intérêt de la mutation <strong>Lacaune</strong><br />
Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />
1 - Jugem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> éleveurs <strong>en</strong>quêtés sur la prolificité :<br />
Prolificité idéale moy<strong>en</strong>ne = 2,1 agneaux/mise bas<br />
9
Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />
2 - Le jugem<strong>en</strong>t sur la distribution <strong>des</strong> tailles de portées<br />
Proportion acceptable de portées simples : 15%<br />
Proportion acceptable de portées triples : 25%<br />
Distributions <strong>des</strong> tailles de portées <strong>en</strong> fonction <strong>des</strong><br />
génotypes<br />
1 agneau 2 agneaux 3 agneaux<br />
4 agneaux<br />
et plus<br />
Distribution <strong>des</strong> brebis ++ 34% 56% 9% 1%<br />
Distribution <strong>des</strong> brebis L+ 22% 47% 24% 7%<br />
Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />
Bilan sur les <strong>en</strong>quêtes<br />
3 - L’intérêt de la mutation <strong>Lacaune</strong> dans le<br />
programme de sélection<br />
Tous les sélectionneurs <strong>en</strong>quêtés estim<strong>en</strong>t que la<br />
mutation est intéressante dans les élevages <strong>en</strong> sélection<br />
Quelques sélectionneurs estim<strong>en</strong>t que cette mutation<br />
n’est pas intéressante pour les acheteurs d’agnelles<br />
10
Point de vue <strong>des</strong> éleveurs sur la prolificité<br />
Bilan sur les <strong>en</strong>quêtes<br />
• Les sélectionneurs appréci<strong>en</strong>t les portées triples et<br />
souhait<strong>en</strong>t <strong>en</strong> avoir plus<br />
• Ils estim<strong>en</strong>t à l’inverse avoir trop de portées<br />
simples et souhait<strong>en</strong>t voir leur nombre diminuer<br />
• Les performances souhaitées par les éleveurs sont<br />
proches de celles obt<strong>en</strong>ues par les brebis L+<br />
Gestion du gène autosomal <strong>Lacaune</strong><br />
Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />
- Système actuel<br />
- Projet mis <strong>en</strong> place<br />
- Perspectives<br />
11
Actuellem<strong>en</strong>t<br />
• Définir un seuil de prolificité<br />
au <strong>des</strong>sus du seuil : accouplem<strong>en</strong>t avec mâles ++<br />
<strong>en</strong> <strong>des</strong>sous : accouplem<strong>en</strong>t avec mâles LL ou L+<br />
dans un premier temps utiliser <strong>des</strong> mâles L+<br />
pour augm<strong>en</strong>ter le seuil tout <strong>en</strong> générant moins de LL<br />
• Utilisation de prédictions à partir de généalogies<br />
•Génotypage <strong>des</strong> reproducteurs mâles d ’IA<br />
Actuellem<strong>en</strong>t<br />
Système sans génotypage de femelles<br />
Système sans génotypage de femelles<br />
ΓL+<br />
boucherie<br />
Ε ++<br />
Ε L+<br />
Ε ++<br />
Ε ++<br />
Ε L+<br />
Ε LL<br />
Ε L+<br />
Ε ++<br />
Ε ++<br />
Ε L+<br />
Γ ++<br />
r<strong>en</strong>ouvellem<strong>en</strong>t<br />
Prolificité<br />
12
• Objectifs :<br />
Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />
– Améliorer la productivité <strong>des</strong> brebis par<br />
l’utilisation de la mutation <strong>Lacaune</strong> (femelles<br />
L+)<br />
– Éviter la procréation d’agnelles LL dont la<br />
prolificité est trop élevée<br />
– Schéma simple – pas d’<strong>en</strong>treti<strong>en</strong> de béliers LL<br />
– Limiter le nombre de génotypages<br />
– Maximiser le pot<strong>en</strong>tiel de diffusion d’agnelles<br />
Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />
13
Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />
Avantages de la stratégie 50% L+ et 50% ++<br />
• Augm<strong>en</strong>tation du nombre d’agneaux produits par<br />
augm<strong>en</strong>tation de la fréqu<strong>en</strong>ce de l’allèle L<br />
• R<strong>en</strong>dem<strong>en</strong>t <strong>en</strong> génotypage : seuls les animaux LL<br />
seront éliminés<br />
• Nombre de candidats à la sélection maximum<br />
• Pot<strong>en</strong>tiel de diffusion d’agnelles sécurisé<br />
Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />
Avantages de la stratégie 50% L+ et 50% ++<br />
• Evolution modérée et progressive <strong>des</strong> fréqu<strong>en</strong>ces<br />
génotypiques dans la population<br />
– Acceptation <strong>des</strong> éleveurs<br />
– Possibilité de fonctionnem<strong>en</strong>t adapté à chaque<br />
élevage<br />
• Connaissance de la structure génotypique de la<br />
population<br />
– = gestion fine de la mutation + indexation<br />
pr<strong>en</strong>ant <strong>en</strong> compte l’effet du génotype (Progrès<br />
génétique indép<strong>en</strong>damm<strong>en</strong>t de la mutation)<br />
14
La mise <strong>en</strong> place<br />
Stratégie de gestion <strong>des</strong> accouplem<strong>en</strong>ts<br />
• Génotypage de tous les reproducteurs mâles (Lac3<br />
et BMP15)<br />
• Génotypage <strong>des</strong> agnelles de r<strong>en</strong>ouvellem<strong>en</strong>t<br />
• Accouplem<strong>en</strong>ts <strong>en</strong> fonction <strong>des</strong> génotypes :<br />
– I.A. : accouplem<strong>en</strong>ts croisés<br />
– MN : accouplem<strong>en</strong>ts avec <strong>des</strong> mâles ++<br />
• Accouplem<strong>en</strong>ts sans connaissance du génotype :<br />
– Accouplem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> brebis avec <strong>des</strong> index<br />
extrêmes à <strong>des</strong> mâles non-porteurs<br />
Premiers résultats issus <strong>des</strong> génotypages et<br />
perspectives<br />
Résultats génotypages 2011<br />
• 1425 agnelles, 23 élevages<br />
• 31,5% de brebis avec la mutation (dont 29%<br />
simple-porteuses)<br />
• De 7 à 42% <strong>en</strong> fonction <strong>des</strong> élevages<br />
15
Perspectives :<br />
Premiers résultats issus <strong>des</strong> génotypages et<br />
perspectives<br />
• A court-terme :<br />
– Fin du plafonnem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> index<br />
– Sélection <strong>des</strong> mâles intra-génotype<br />
• A moy<strong>en</strong>-terme :<br />
– Amélioration de la connaissance de l’effet de<br />
la mutation sur les performances : analyse<br />
<strong>des</strong> données <strong>des</strong> brebis génotypées.<br />
– Evolution du modèle d’indexation : prise <strong>en</strong><br />
compte de l’effet du génotype.<br />
16