La phosphatase alcaline en milieu marin: ses caractéristiques, son ...

tel-00641975, version 1 - 17 Nov 2011
Ainsi, le biovolume des cellules d’une espèce phytoplanctonique donnée, exprimée en µm 3
est :
V = Vi * N
Avec : Vi = biovolume d’une cellule de l’espèce phytoplanctonique, exprimée en µm 3 .
N = nombre de cellules d’une même espèce phytoplanctonique.
La biomasse se calcule à partir des biovolumes en supposant que la densité algale est voisine
de 1. Il existe une relation entre le biovolume et la biomasse des cellules phytoplanctoniques,
telle que : 1.10 6 µm 3 = 1 µg.
La biomasse B d’une espèce phytoplanctonique donnée, exprimée en µg.l -1 est donc :
B = (V) / (V’ * 1.10 6 )
Avec : V = biovolume des cellules de l’espèce phytoplanctonique, exprimée en µm 3 .
V’ = volume d’eau de mer échantillonné, en litres.
Dosage des Protéines
Afin de déterminer la teneur en protéines associée aux diverses classes de taille du matériel
particulaire planctonique, nous avons réalisé des filtrations successives (Taft et al., 1977 ;
Stewart et Wetzel, 1982 ; Chrost et al., 1984, 1989 ; Chrost et Overbeck, 1987 ; Currie et al.,
1986 ; Boon, 1993). Pour cela, des échantillons d’eau de mer de 1 à 10 litres selon la densité
planctonique, ont été filtrés sur des membranes SEFAR de mailles décroissantes : 90 µm,
50 µm, 6 µm, 1 µm et sur des filtres GELMAN de maille 0,45 µm en ester de cellulose. Ces
filtrations sont réalisées dès l’arrivée des échantillons au laboratoire. Les filtres sont ensuite
placés dans des fioles de 20ml et congelés sans eau à -80°C. Ces échantillons après
resuspension dans de l’eau distillée et sonication, serviront à réaliser la mesure de l’activité
des différentes fractions particulaires.
La méthode de Lowry (Lowry et al., 1951) a été retenue pour sa bonne sensibilité vis à vis
des protéines du plancton.
L’acide phosphotungstomolybdique contenu dans le réactif (Folin) est réduit par les protéines.
On obtient ainsi plusieurs produits ayant une coloration bleue caractéristique dont
l’absorbance à 660 nm sera mesurée au spectrophotomètre.
Les résidus de la tyrosine, du tryptophane et, dans une moindre mesure, ceux de la cystéine,
de la cystine et de l’histidine interviennent dans la réaction. La liaison peptidique est aussi
impliquée.
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