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Comprendre et réaliser les tests statistiques à l'aide de R - Pages ...

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Gaël Millot<br />

<strong>Comprendre</strong> <strong>et</strong> <strong>réaliser</strong><br />

<strong>les</strong> <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong> <strong>à</strong> l’ai<strong>de</strong> <strong>de</strong> R<br />

Manuel <strong>de</strong> biostatistique<br />

2 e édition<br />

R


<strong>Comprendre</strong> <strong>et</strong> <strong>réaliser</strong><br />

<strong>les</strong> <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong><br />

<strong>à</strong> <strong>l'ai<strong>de</strong></strong> <strong>de</strong> R<br />

2 ème édition<br />

"Aucun chercheur – sauf s'il est assuré d'avoir du<br />

génie <strong>et</strong>, en outre, beaucoup <strong>de</strong> chance – ne peut plus<br />

ignorer la métho<strong>de</strong> statistique"<br />

(Schwartz, 1963)


2 Avant-propos


Avant-propos 3


4 Avant-propos


Particularités <strong>de</strong> la <strong>de</strong>uxième édition 5


6 Précisions


Sommaire 7


8 Sommaire


Sommaire 9


10 Sommaire


Sommaire 11


12 Sommaire


Sommaire 13


414 Chapitre 5. Les <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong>


5.13. Le test t <strong>de</strong> Stu<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> comparaison <strong>de</strong> moyennes 415


416 Chapitre 5. Les <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong>


5.13. Le test t <strong>de</strong> Stu<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> comparaison <strong>de</strong> moyennes 417


418 Chapitre 5. Les <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong>


5.13. Le test t <strong>de</strong> Stu<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> comparaison <strong>de</strong> moyennes 419


420 Chapitre 5. Les <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong>


5.13. Le test t <strong>de</strong> Stu<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> comparaison <strong>de</strong> moyennes 421


422 Chapitre 5. Les <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong>


5.13. Le test t <strong>de</strong> Stu<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> comparaison <strong>de</strong> moyennes 423


424 Chapitre 5. Les <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong>


5.13. Le test t <strong>de</strong> Stu<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> comparaison <strong>de</strong> moyennes 425


426 Chapitre 5. Les <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong>


5.13. Le test t <strong>de</strong> Stu<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> comparaison <strong>de</strong> moyennes 427


758 In<strong>de</strong>x


In<strong>de</strong>x 759


760 In<strong>de</strong>x


In<strong>de</strong>x 761


762 In<strong>de</strong>x


In<strong>de</strong>x 763


764 In<strong>de</strong>x


In<strong>de</strong>x 765


766 In<strong>de</strong>x


In<strong>de</strong>x 767


Ce livre s’adresse aux étudiants,<br />

mé<strong>de</strong>cins <strong>et</strong> chercheurs désirant<br />

<strong>réaliser</strong> <strong>de</strong>s <strong>tests</strong> alors qu’ils<br />

débutent en statistique.<br />

Une approche simple <strong>et</strong> détaillée<br />

Illustré par 74 figures <strong>et</strong> accompagné d’exercices<br />

avec correction, l’ouvrage abor<strong>de</strong> la statistique <strong>de</strong> la<br />

manière la plus simple qui soit, sans démonstration<br />

mathématique, mais en insistant sur <strong>les</strong> détails,<br />

afin <strong>de</strong> bien maîtriser toutes <strong>les</strong> subtilités <strong>de</strong>s <strong>tests</strong>.<br />

Des notions essentiel<strong>les</strong> traitées en<br />

profon<strong>de</strong>ur<br />

L’ouvrage explore <strong>de</strong>s points fondamentaux en<br />

statistique : la check-list <strong>à</strong> effectuer avant <strong>de</strong><br />

<strong>réaliser</strong> un test, la gestion <strong>de</strong>s individus extrêmes,<br />

l’origine <strong>de</strong> la p value, la puissance ou la conclusion<br />

d’un test. Il explique comment choisir un test <strong>à</strong><br />

partir <strong>de</strong> ses propres données. Il décrit 35 <strong>tests</strong><br />

<strong>statistiques</strong> sous forme <strong>de</strong> fiches, dont 24 non<br />

paramétriques, ce qui couvre la plupart <strong>de</strong>s <strong>tests</strong><br />

<strong>à</strong> une ou <strong>de</strong>ux variab<strong>les</strong> observées. Il traite<br />

a La 2 e édition <strong>de</strong> la référence dans le domaine <strong>de</strong>s <strong>tests</strong><br />

<strong>statistiques</strong> <strong>et</strong> <strong>de</strong> R<br />

a Accessible aux débutants : aucun pré-requis nécessaire<br />

en mathématique ou en informatique<br />

a Nombreux exemp<strong>les</strong> d’application <strong>et</strong> exercices corrigés<br />

Conception graphique : Primo&Primo®<br />

illu : © Tiero<br />

ISBN : 978-2-8041-6365-5<br />

9 782804 163655<br />

RETESTA<br />

Gaël Millot<br />

<strong>Comprendre</strong> <strong>et</strong> <strong>réaliser</strong><br />

<strong>les</strong> <strong>tests</strong> <strong>statistiques</strong> <strong>à</strong> l’ai<strong>de</strong> <strong>de</strong> R<br />

Manuel <strong>de</strong> biostatistique<br />

<strong>de</strong> toutes <strong>les</strong> subtilités <strong>de</strong>s <strong>tests</strong>, comme <strong>les</strong><br />

corrections <strong>de</strong> continuité, <strong>les</strong> corrections <strong>de</strong> Welch<br />

pour le test t <strong>et</strong> l’anova, ou <strong>les</strong> corrections <strong>de</strong><br />

p value lors <strong>de</strong>s comparaisons multip<strong>les</strong>. Il propose<br />

un exemple d’application <strong>de</strong> chaque test <strong>à</strong> l’ai<strong>de</strong><br />

<strong>de</strong> R, en incluant toutes <strong>les</strong> étapes du test,<br />

<strong>et</strong> notamment l’analyse graphique <strong>de</strong>s données.<br />

R, le logiciel <strong>de</strong> référence<br />

L’originalité <strong>de</strong> ce manuel est <strong>de</strong> proposer non<br />

seulement une explication très détaillée sur l’utilisation<br />

<strong>de</strong>s <strong>tests</strong> <strong>les</strong> plus classiques, mais aussi<br />

la possibilité <strong>de</strong> <strong>réaliser</strong> ces <strong>tests</strong> <strong>à</strong> l’ai<strong>de</strong> <strong>de</strong> R,<br />

logiciel <strong>de</strong> référence en statistique, gratuit,<br />

disponible sur Intern<strong>et</strong> <strong>et</strong> compatible avec<br />

Windows, Mac OS <strong>et</strong> Linux. Ce livre parlera également<br />

<strong>à</strong> ceux qui ne souhaitent pas utiliser R,<br />

car tous <strong>les</strong> exemp<strong>les</strong> d’application <strong>de</strong>s <strong>tests</strong> sont<br />

réalisés <strong>à</strong> partir d’un même fichier <strong>de</strong> données,<br />

qui peut facilement être adapté <strong>à</strong> un autre logiciel<br />

<strong>de</strong> statistique.<br />

Gaël MILLOT, Docteur en Génétique Humaine,<br />

Maître <strong>de</strong> Conférences en Génétique <strong>et</strong><br />

Biostatistique <strong>à</strong> l'Université Pierre <strong>et</strong> Marie Curie<br />

(Paris VI) / Institut Curie.<br />

L’auteur reverse la moitié <strong>de</strong> ses droits d’auteur <strong>à</strong><br />

l’Institut Curie pour la lutte contre le cancer.<br />

www.<strong>de</strong>boeck.com

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