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Laboratoire de Sophia-Antipolis - Anses

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<strong>Laboratoire</strong> <strong>de</strong><br />

<strong>Sophia</strong>-<strong>Antipolis</strong><br />

apport d’activité<br />

2011<br />

Le laboratoire <strong>de</strong> <strong>Sophia</strong>-<strong>Antipolis</strong>, compte<br />

près <strong>de</strong> 40 personnes et comprend <strong>de</strong>ux<br />

unités <strong>de</strong> recherche : l’unité pathologie <strong>de</strong>s<br />

ruminants et l’unité pathologie <strong>de</strong> l’abeille.<br />

Ses recherches portent principalement<br />

sur la fièvre Q, la rhinotrachéite infectieuse<br />

bovine (IBR), les pestiviroses <strong>de</strong>s ruminants,<br />

ainsi que sur les principales maladies et les<br />

phénomènes d’intoxications <strong>de</strong>s abeilles.


Chiffres clés<br />

2 étudiants<br />

en thèses<br />

<strong>de</strong> doctorat<br />

d’université<br />

21 publications<br />

Dates clés<br />

> Mars : session <strong>de</strong> formation aux diagnostics<br />

en pathologie apicole.<br />

> Avri : démarrage <strong>de</strong>s activités du laboratoire<br />

<strong>de</strong> référence <strong>de</strong> l’Union européenne chargé<br />

<strong>de</strong> la santé <strong>de</strong>s abeilles.<br />

> Mai : réunion du réseau <strong>de</strong> laboratoires d’analyses<br />

impliqués en pathologie apicole.<br />

> Juillet : premier meeting du réseau <strong>de</strong> laboratoires<br />

européens en santé <strong>de</strong>s abeilles à Bruxelles.<br />

> Septembre : mise en place <strong>de</strong> la surveillance pilote <strong>de</strong>s<br />

troubles et maladies <strong>de</strong>s abeilles dans le département<br />

<strong>de</strong> la Drôme.<br />

> Novembre : participation aux journées vétérinaires <strong>de</strong><br />

Blida (Algérie).<br />

5 essais interlaboratoires<br />

d’aptitu<strong>de</strong> (EILA)<br />

dont 14 dans <strong>de</strong>s journaux<br />

internationaux à comité <strong>de</strong> lecture<br />

> Décembre : journée d’échange sur les activités<br />

<strong>de</strong> références avec le CODA CERVA.<br />

7 stagiaires<br />

Plus <strong>de</strong><br />

10 000<br />

analyses<br />

Le LAboRAtoiRe<br />

en queLqueS motS<br />

Il contribue à améliorer la santé <strong>de</strong>s moutons, <strong>de</strong>s chèvres, <strong>de</strong>s<br />

bovins et <strong>de</strong>s abeilles. Il étudie leurs principales maladies et<br />

leur mo<strong>de</strong> <strong>de</strong> transmission à partir d’observation sur le terrain.<br />

Il met au point <strong>de</strong>s outils diagnostiques et élabore <strong>de</strong>s moyens<br />

<strong>de</strong> prévention. <strong>Laboratoire</strong> <strong>de</strong> référence pour plusieurs maladies<br />

et les pestici<strong>de</strong>s, il fournit un appui scientifique et technique<br />

aux services vétérinaires : analyse <strong>de</strong> prélèvements, fourniture<br />

<strong>de</strong> réactifs <strong>de</strong> référence, suivi <strong>de</strong> la qualité <strong>de</strong>s analyses <strong>de</strong>s<br />

laboratoires <strong>de</strong> terrain, expertise d’outils <strong>de</strong> diagnostic du<br />

commerce…<br />

LeS gRAnDeS ÉvoLutionS<br />

en 2011<br />

En 2011, le laboratoire a renforcé ses missions d’appui scientifique<br />

et technique aux tutelles dans le cadre <strong>de</strong>s différents mandats<br />

qu’il détient.<br />

En pathologie <strong>de</strong> l’abeille, en tant que laboratoire <strong>de</strong> référence<br />

européen pour la santé <strong>de</strong>s abeilles (LR-UE santé <strong>de</strong> l’abeille)<br />

<strong>de</strong>puis avril 2011, le laboratoire a apporté son appui à la<br />

commission européenne afin <strong>de</strong> proposer <strong>de</strong>s lignes directrices<br />

pour la mise en place d’un programme pilote <strong>de</strong> surveillance <strong>de</strong>s<br />

maladies <strong>de</strong>s abeilles dans les états membres. Dans le même<br />

temps le laboratoire a participé, en lien avec la Direction générale<br />

<strong>de</strong> l’alimentation (DGAL), à la mise en place d’un programme<br />

pilote en France, dans le département <strong>de</strong> la Drôme, et a assuré<br />

l’animation d’un réseau <strong>de</strong> laboratoires d’analyses.<br />

À la <strong>de</strong>man<strong>de</strong> <strong>de</strong> la DGAL, le laboratoire a également contribué à<br />

la constitution d’un réseau <strong>de</strong> laboratoires d’analyses officielles,<br />

dans le cadre d’un dispositif pilote <strong>de</strong> surveillance syndromique<br />

<strong>de</strong> la fièvre Q ayant pour objectif un meilleur contrôle <strong>de</strong> cette<br />

maladie zoonotique dans les élevages <strong>de</strong> ruminants.


LeS ACtivitÉS en 2011<br />

Les travaux réalisés<br />

Unité Pathologie <strong>de</strong> l’abeille<br />

Un projet initié en 2010 avec la collaboration <strong>de</strong> la BNEVP<br />

(Briga<strong>de</strong> Nationale d’Enquête Vétérinaire et Phytosanitaire)<br />

s’est poursuivi en 2011 afin d’étudier la présence <strong>de</strong> résidus<br />

<strong>de</strong> pestici<strong>de</strong>s et <strong>de</strong> pathogènes <strong>de</strong> l’abeille dans <strong>de</strong>s colonies<br />

surveillées en situation <strong>de</strong> production sur le terrain.<br />

Les travaux <strong>de</strong> recherche sur le virus <strong>de</strong> la paralysie chronique<br />

<strong>de</strong> l’abeille ont permis <strong>de</strong> décrire <strong>de</strong>ux protéines virales et<br />

le pouvoir infectieux <strong>de</strong>s ARNs viraux a été démontré. Ces<br />

résultats ouvrent <strong>de</strong>s perspectives très intéressantes pour<br />

le développement <strong>de</strong> nouveaux outils diagnostiques et pour<br />

l’étu<strong>de</strong> du virus et <strong>de</strong> son pouvoir pathogène. Les travaux ont<br />

également porté sur la validation <strong>de</strong> métho<strong>de</strong>s analytiques<br />

selon la nouvelle norme Afnor XP U47-600 pour la mise en<br />

œuvre <strong>de</strong> la PCR en santé animale : quantification du virus<br />

<strong>de</strong> la paralysie chronique <strong>de</strong> l’abeille, ainsi que détection<br />

et i<strong>de</strong>ntification du petit coléoptère <strong>de</strong> la ruche par PCR.<br />

Plusieurs métho<strong>de</strong>s ont été nouvellement accréditées par<br />

le COFRAC.<br />

Unité Pathologie <strong>de</strong>s ruminants<br />

Amélioration du diagnostic <strong>de</strong> l’IBR<br />

En raison <strong>de</strong> la possible interférence diagnostique avec<br />

d’autres alphaherpes virus <strong>de</strong> ruminants, une technique <strong>de</strong><br />

neutralisation virale croisée permettant <strong>de</strong> distinguer entre<br />

une infection par plusieurs virus proches du virus <strong>de</strong> l’IBR a<br />

été mise au point. Parallèlement, <strong>de</strong>s actions <strong>de</strong> recherche<br />

sont engagées pour la mise en place d’outils moléculaires<br />

visant à la détection directe du virus à l’état latent.<br />

Transmission inter-espèces <strong>de</strong>s pestivirus <strong>de</strong> ruminants<br />

Les projets sur les pestiviroses se sont attachés à poursuivre<br />

l’étu<strong>de</strong> <strong>de</strong> la transmission <strong>de</strong> la maladie <strong>de</strong>s frontières (Bor<strong>de</strong>r<br />

Disease) entre ruminants sauvages et d’élevage, l’étu<strong>de</strong> <strong>de</strong><br />

l’interaction <strong>de</strong>s pestivirus dans d’autres pathologies et à<br />

isoler <strong>de</strong> nouvelles souches virales. L’unité s’est impliquée<br />

dans le suivi d’une étu<strong>de</strong> menée par GDS-France visant<br />

à évaluer une métho<strong>de</strong> <strong>de</strong> détection <strong>de</strong>s jeunes animaux<br />

porteurs du virus <strong>de</strong> la BVD basée sur un prélèvement <strong>de</strong><br />

cartilage auriculaire.<br />

Fièvre Q<br />

Le laboratoire poursuit ses efforts dans le but d’harmoniser<br />

et <strong>de</strong> vali<strong>de</strong>r les métho<strong>de</strong>s <strong>de</strong> diagnostic à l’échelle nationale<br />

et européenne. En parallèle, le laboratoire s’implique dans<br />

la mise au point <strong>de</strong> nouveaux outils <strong>de</strong> typage moléculaire<br />

<strong>de</strong>s souches <strong>de</strong> C. burnetii à <strong>de</strong>s fins d’investigations<br />

épidémiologiques, et étudie les formes <strong>de</strong> résistance <strong>de</strong> cet<br />

agent pathogène dans la perspective d’un meilleur contrôle<br />

dans les élevages et l’environnement.<br />

Les grands chantiers menés à terme<br />

Une thèse en cotutelle internationale<br />

Un travail <strong>de</strong> doctorat intitulé « Pestivirus à l’interface faune<br />

sauvage/faune domestique : pathogénie chez l’isard gestant<br />

et épidémiologie dans la région Provence - Alpes - Côte<br />

d’Azur » s’est achevé en 2011. Cofinancé par la région PACA<br />

il s’est déroulé en cotutelle internationale entre l’Université <strong>de</strong><br />

Nice <strong>Sophia</strong>-<strong>Antipolis</strong> et l’Université <strong>de</strong> Liège en Belgique.<br />

L’étu<strong>de</strong> a montré qu’une circulation active <strong>de</strong>s pestivirus était<br />

présente en PACA, chez les animaux sauvages (chamois)<br />

et domestiques (moutons). Dans les Alpes-<strong>de</strong>-Haute-<br />

Provence, les souches virales isolées <strong>de</strong> différentes espèces<br />

<strong>de</strong> ruminants sont génétiquement proches, traduisant<br />

une continuité géographique dans leur répartition. Une<br />

infection expérimentale a permis <strong>de</strong> montrer <strong>de</strong>s effets sur<br />

la gestation <strong>de</strong> l’isard (le chamois pyrénéen) importants,<br />

avec une possible présence d’animaux infectés persistants<br />

immunotolérants (IPI) comme chez les ovins. Bien que les<br />

résultats ne permettent pas d’établir <strong>de</strong> façon précise un sens<br />

<strong>de</strong> transmission entre les espèces <strong>de</strong> ruminants domestiques<br />

et sauvages, <strong>de</strong>ux cycles épidémiologiques semblent être<br />

présents, caractérisés par une forte circulation intra-espèce<br />

ponctuée par <strong>de</strong>s transmissions entre chamois et moutons.<br />

Les grands chantiers engagés<br />

Le laboratoire a été nommé <strong>Laboratoire</strong> <strong>de</strong> référence<br />

<strong>de</strong> l’Union européenne pour la santé <strong>de</strong>s abeilles par la<br />

Commission européenne. Depuis plusieurs années, un<br />

phénomène d’affaiblissement et <strong>de</strong> mortalité <strong>de</strong>s colonies<br />

d’abeilles est constaté dans <strong>de</strong> nombreux pays. Les<br />

facteurs potentiellement impliqués sont multiples : maladies<br />

et parasites, intoxications, stress lié aux changements<br />

<strong>de</strong>s ressources alimentaires, conditions climatiques… La<br />

compréhension <strong>de</strong> cette situation nécessite, à l’échelle<br />

européenne, l’harmonisation <strong>de</strong>s dispositifs <strong>de</strong> surveillance,<br />

ainsi que le renforcement et la coordination <strong>de</strong> la recherche.<br />

Les activités <strong>de</strong> référence du laboratoire couvriront un large<br />

champ portant sur les principales maladies <strong>de</strong> l’abeille<br />

(d’origine parasitaire, bactériologique ou virologique) ainsi que<br />

sur les maladies exotiques (insectes et acariens) menaçant<br />

le cheptel apicole. Selon les besoins <strong>de</strong> la Commission,<br />

le laboratoire sera également amené à investiguer les<br />

causes d’intoxications <strong>de</strong> colonies. Un programme pilote<br />

<strong>de</strong> surveillance <strong>de</strong>s mortalités d’abeille sera lancé dès<br />

2012, dans plusieurs pays européens, sous l’égi<strong>de</strong> <strong>de</strong> la<br />

Commission européenne, pour un montant <strong>de</strong> 3,7 millions<br />

d’euros. Le laboratoire, qui a fourni le document gui<strong>de</strong> <strong>de</strong><br />

ce programme en lien avec la plateforme épidémiologique<br />

<strong>de</strong> l’agence, sera impliqué dans la coordination globale du<br />

recueil <strong>de</strong>s données et leur traitement.


Principales publications<br />

Chauzat M.P. et al. (2011) An assessment of honeybee<br />

colony matrices, Apis mellifera (Hymenoptera: Apidae) to<br />

monitor pestici<strong>de</strong> presence in continental France.<br />

Environmental Toxicology and Chemistry 30, 103-111.<br />

Martel A.C. and Lair C. (2011) Validation of a highly sensitive<br />

method for the <strong>de</strong>termination of neonicotinoid insectici<strong>de</strong>s<br />

residues in honeybees by liquid chromatography with<br />

electrospray tan<strong>de</strong>m mass spectrometry. International<br />

Journal of Environmental Analytical Chemistry 91, 978-988.<br />

King L.A et al. (2011). Outbreak of Q fever, florac, Southern<br />

France, Spring 2007. Vector-Borne and zoonotic diseases<br />

4, 341-347.<br />

une surveillance<br />

<strong>de</strong>s maladies <strong>de</strong>s abeilles<br />

renforcée<br />

Le LNR Maladies <strong>de</strong>s abeilles a été sollicité par la DGAL dans<br />

la mise en place d’un projet d’épidémiosurveillance pilote<br />

<strong>de</strong>s maladies et troubles <strong>de</strong>s abeilles. Le laboratoire a été<br />

chargé <strong>de</strong> proposer un protocole <strong>de</strong> surveillance en lien<br />

avec les objectifs fixés et a participé au déploiement du<br />

dispositif à l’automne 2011 dans le département <strong>de</strong> la<br />

Drôme : formation et coordination <strong>de</strong>s laboratoires<br />

impliqués, formation <strong>de</strong>s équipes <strong>de</strong> terrain au déroulement<br />

<strong>de</strong>s visites et aux prélèvements…<br />

Agence nationale <strong>de</strong> sécurité sanitaire<br />

<strong>de</strong> l’alimentation, <strong>de</strong> l’environnement et du travail<br />

<strong>Laboratoire</strong> <strong>de</strong> <strong>Sophia</strong>-<strong>Antipolis</strong><br />

Les templiers - 105 route <strong>de</strong>s Chappes - bP 111<br />

06902 <strong>Sophia</strong>-<strong>Antipolis</strong> Ce<strong>de</strong>x<br />

www.anses.fr<br />

importation <strong>de</strong>s reines<br />

d’abeilles<br />

Afin <strong>de</strong> répondre à une <strong>de</strong>man<strong>de</strong> analytique croissante<br />

liée aux importations <strong>de</strong> reines d’abeilles en France, le<br />

LNR Maladies <strong>de</strong>s abeilles a participé à l’agrément d’un<br />

réseau <strong>de</strong> laboratoire pour l’analyse <strong>de</strong>s cages à reines et<br />

la recherche <strong>de</strong> parasitoses exotiques (petit coléoptère<br />

<strong>de</strong>s ruches, Aethina tumida, et acariens du type<br />

Tropilaelaps. Le laboratoire a appuyé la DGAL dans<br />

l’élaboration <strong>de</strong> l’appel à candidature (Note <strong>de</strong> service<br />

DGAL/SDPRAT/N2011-8097 du 26 avril 2011). Une<br />

métho<strong>de</strong> d’analyse officielle a été définie et une<br />

formation a été organisée à l’attention <strong>de</strong>s laboratoires<br />

candidats. 21 laboratoires ont été officiellement agréés<br />

le 31 mai 2011. (Note <strong>de</strong> service DGAL/SDPRAT/N2011-8128<br />

du 08 juin 2011).<br />

Amélioration <strong>de</strong>s<br />

connaissances sur les<br />

herpèsvirus <strong>de</strong> ruminants<br />

Une enquête a été menée auprès <strong>de</strong>s laboratoires agréés<br />

pour le sérodiagnostic <strong>de</strong> l’IBR afin d’évaluer l’impact <strong>de</strong>s<br />

modifications <strong>de</strong>s réactifs <strong>de</strong> mélanges sur la prophylaxie<br />

2010/2011. En outre, une étu<strong>de</strong> <strong>de</strong> séroprévalence <strong>de</strong><br />

l’herpes virus caprin <strong>de</strong> type 1 dans 4 régions a montré<br />

<strong>de</strong>s taux <strong>de</strong> prévalence entre 0,2 % et 30 %. Le laboratoire<br />

a engagé, en partenariat avec <strong>Laboratoire</strong> <strong>de</strong> Niort <strong>de</strong><br />

l’<strong>Anses</strong>, un projet <strong>de</strong>stiné à mieux comprendre<br />

l’implication <strong>de</strong> ce virus dans certains avortements <strong>de</strong><br />

la chèvre et à évaluer son potentiel <strong>de</strong> transmission aux<br />

bovins.<br />

© <strong>Anses</strong> Éditions : mai 2012<br />

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