Opinto-opas 2009-2010, Biologian koulutusohjelma
Opinto-opas 2009-2010, Biologian koulutusohjelma
Opinto-opas 2009-2010, Biologian koulutusohjelma
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
<strong>Biologian</strong> <strong>koulutusohjelma</strong><br />
Tavoite: Oppia tavallisimmat menetelmät<br />
kasvi- ja eläinnäytteen valmistuksesta mikroskooppista<br />
tutkimusta varten. Saada perustietous<br />
erilaisista mikroskoopeista ja niiden<br />
sovellusmahdollisuuksista.<br />
Sisältö: Harjoitustöissä demonstroidaan valoja<br />
elektronimikroskooppinäytteiden fikseeraus<br />
ja valu, jää-, paraffiini- ja muovileikkeiden<br />
leikkaus ja värjäys. Aiheet vaihtelevat valomikroskopian<br />
tekniikoista vaativampiin erikoistekniikoihin<br />
kuten analyyttiseen ja immunoelektronimikroskopiaan,<br />
konfokaali-, kryotekniikoihin<br />
ja kuva-analyysiin.<br />
Työtavat: 24 h lu, ohjattuja lab. harj., dem, te,<br />
näytteiden mikroskopointi. Luennon ja kurssin<br />
suoritus 4 op.<br />
Oppimateriaali: Luentomateriaali ja harjoitustyömoniste.<br />
Muu kurssin aiheeseen liittyvä<br />
oheismateriaali ja kirjallisuus kerrotaan<br />
kurssilla.<br />
Yhteys muihin opintoihin: Kurssilla opittuja<br />
menetelmiä ja kädentaitoja voi hyödyntää<br />
monilla eri tieteen aloilla.<br />
Ajoitus ja kohderyhmä: FM -tutkinto 1 sl.,<br />
suunnattu lähinnä BT -linjan opiskelijoille ja<br />
ekofysiologeille. Järjestetään resurssien<br />
salliessa.<br />
Vastuuhenkilö: Anja Hohtola.<br />
Molekulaarisen kasvibiologian jatkokurssi<br />
9 op / 5 ov (752682S)<br />
Tavoite: Opiskelija perehtyy ja ymmärtää<br />
miten geenien ilmeneminen säätelee kasvien<br />
kehitystä ja aineenvaihduntaa, hallitsee sekä<br />
holistisia että spesifisiä tapoja geenien ilmenemisen<br />
tutkimisessa ja osaa arvioida ja<br />
analysoida erilaisilla menetelmillä tuotetun<br />
tiedon luotettavuutta. Perehtyy alan uusimpaan<br />
kirjallisuuteen.<br />
Sisältö: Uusien sekvensointimenetelmien<br />
myötä geenitiedon määrä kasvaa nopeasti.<br />
<strong>Opinto</strong>jaksolla perehdytään kasvien geenien<br />
ilmenemiseen kuten geenien toiminnan<br />
säätelyyn, kloroplastien ja tuman genomien<br />
vuorovaikutukseen, transkriptiotekijöihin,<br />
RNA-häirintään jne. Perusteiden lisäksi<br />
luennoidaan erilaisia geeniekspression<br />
tutkimustapoja transkriptio-, proteiini- ja<br />
metaboliatasoilla, joita sitten kurssiosuuden<br />
harjoitustöissä konkretisoidaan. Seminaarien<br />
avulla perehdytään alan uusimpaan kirjallisuuteen.<br />
Työtavat: 30 h lu ja seminaari, 68 h dem/lab,<br />
kt (työselostuksia), te.<br />
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Buchanan,<br />
Gruissern, Jones 2000: Biochemistry &<br />
Molecular Biology of Plants. Courier Companies<br />
Inc. 1367 s. (osia kirjasta), luentomateriaali<br />
ja kurssilla jaettava aiheeseen liittyvä<br />
kirjallisuus.<br />
Yhteys muihin opintojaksoihin: Edeltävänä<br />
opintona kurssin Funktionaalisen kasvibiologian<br />
perusteet (752345A) suoritus.<br />
Ajoitus ja kohderyhmä: FM -tutkinto 1. tai 2.<br />
sl, järjestetään joka toinen vuosi BTk: pak 9<br />
op.<br />
Vastuuhenkilöt: Hely Häggman ja Anja Hohtola.<br />
Molekyyliekologia 2-5 op / 1-2 ov<br />
(755615S)<br />
Tavoite: Kurssin tavoitteena on perehdyttää<br />
opiskelija ekologisessa tutkimuksessa sovellettaviin<br />
molekyylibiologisiin menetelmiin ja<br />
geneettisiin teorioihin. Kurssin käytyään<br />
opiskelija tuntee laboratoriossa käytettävät<br />
perusmenetelmät, osaa soveltaa niitä ekologisten<br />
ongelmien tutkimisessa sekä tuntee<br />
populaatio– ja fylogenetiikan perusteita<br />
riittävästi kyetäkseen analysoimaan ja tulkitsemaan<br />
geneettistä aineistoa.<br />
Sisältö: Kurssilla tutustutaan proteiinien ja<br />
DNA:n rakenteeseen ja evoluutioon ja opiskellaan<br />
molekyylimenetelmien käyttöä lajin,<br />
sukupuolen ja yksilön tunnistuksessa sekä<br />
käyttäytymisekologiassa (pariutumissysteemit,<br />
yhteistyö, lisääntymismenestys). Lisäksi<br />
perehdytään populaatiogenetiikan perusteisiin<br />
(muuntelu, efektiivinen populaatiokoko,<br />
pullonkaulat, populaatiorakenne ja geenivirta),<br />
molekulaarisen ja adaptiivisen muuntelun<br />
suhteeseen, fylogeneettisiin menetelmiin,<br />
fylogeografiaan ja systematiikkaan sekä<br />
luonnonsuojelugenetiikkaan.<br />
Työtavat: 20 h lu, 4 h kirjallisuusseminaareja,<br />
21 h laboratorioharj, 27 h tietokoneharjoituksia.<br />
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Beebee, T. ja<br />
Rowe G. 2004: An introduction to molecular<br />
ecology. Oxford University Press.<br />
Suoritustavat: Luento-osuudesta kirjallinen<br />
kuulustelu, seminaari, osallistumisen laboratorio-<br />
ja tietokoneharjoituksiin sekä työselostus.<br />
Yhteys muihin opintojaksoihin: Genetiikan<br />
perusteet.<br />
Ajoitus ja kohderyhmä: FM -tutkinto 1. kl.<br />
EKOe.<br />
Vastuuhenkilöt: Laura Kvist.<br />
65