Opinto-opas 2009-2010, Biologian koulutusohjelma

Biologian koulutusohjelma
Ajoitus ja kohderyhmä: LuK -tutkinto 1. sl,
BIOL: pak, BIOK: pak.
Opetuskieli: suomi.
Vastuuhenkilöt: Seppo Saarela, Hely Häggman
ja Jaakko Lumme.
Ympäristönsuojelun valinnaiset kuulustelut
2-6 op / 1-3 ov (750199P, 750399A,
750699S)
Tavoite: Ymmärtää biodiversiteetin suojelua
maailmanlaajuisessa kehyksessä.
Sisältö: Kirjavalinnasta riippuva.
Toteutustavat: Kirjatentti.
Kohderyhmä: Biologit, maantieteilijät, ympäristötekniikan
opiskelijat, vaihto-opiskelijat.
Oppimateriaali: Verkkosivulla lueteltava
kirjallinen
materiaali:
http://www.oulu.fi/genet/biodiversity/diversity
Suoritustavat: Tentti.
Arviointi: 1-5 / hylätty.
Ajoitus ja kohderyhmä: Biologian yleisinä
tenttipäivinä, myös kesäisin. LuK- tai FM -
tutkinto.
Opetuskieli: Tenttikirjat suurimmaksi osaksi
englanninkielisiä, mutta muutama erityisesti
Suomea koskeva on suomenkielinen.
Vastuuhenkilö: Jaakko Lumme.
Aine- ja syventävät opinnot
Biodiversiteetti ihmisen muuttamissa ympäristöissä
6 op / 3 ov (750635S)
Tavoite: Opiskelija saa kokonaiskuvan biodiversiteetin
käsitteistöstä, luonteesta, esiintymisestä,
uhkista ja säilyttämisen syistä ja
keinoista.
Sisältö: Kurssi koostuu kolmesta osasta.
1. Johdanto; tarkoitus on perehdyttää opiskelijat
alan keskeisiin käsitteisiin, monimuotoisuuden
historiaan ja nykytilaan maailmanlaajuisesti.
2. Populaatiot, eliöyhteisöt ja ekosysteemit
ihmisen muokkaamissa ympäristöissä. Teemoja
mm. sukupuutot, suojelualueet ja niiden
hoito, ekosysteemien hoito ja kunnostus,
monimuotoisuus ja ekosysteemien toiminta,
vieraslajikysymykset sekä elinympäristöjen
katoaminen ja pirstoutuminen.
3. Genetiikka. Genetiikan osuudella opiskelijat
perehtyvät nykyaikaisen geneettisen
luonnonsuojelun teoriaan ja käytäntöön.
Molekyyligeneettisten menetelmien käyttö
populaatiorakenteen selvittämisessä on
korostetusti esillä.
Työtavat: 34 h lu ja harj., internettyöskentelyä
ja te.
Arviointi: harjoitustyö hyv/hyl ja te 1-5 / hylätty.
Kirjallisuus: Kirja: Gaston, K.J. & Spicer, J.I.
2004. Biodiversity. An introduction, 2. painos.
Blackwell. 191 s. Muu kirjallisuus sopimuksen
mukaan.
Ajoitus ja kohderyhmä: FM-tutkinto 1.-2. vsk,
sl. Erikoiskurssi, joka sopii sekä ekologeille
että geneetikoille. (järjestetään resurssien
salliessa).
Vastuuhenkilöt: Laura Kvist, Timo Muotka,
Markku Orell ja Pirkko Siikamäki.
Biodiversity in boreal forests 3,5 ECTS cr.
/ 2 cr. (750627S)
Learning outcome: The student gets the
latest knowledge in conservation biology with
special regards to boreal forest ecosystem.
Contents: The course contains 8 hours
introductory lectures defining basic concepts
in conservation biology, as well as focusing
on characteristics and ecosystem functioning
in the boreal zone. The discussions focus on
current topics in recently published papers
concerning e.g. natural disturbances, habitat
fragmentation, species extinctions etc. The
scope of the course is not restricted to any
particular taxa, but the emphasis will be on
conceptual issues and on applications of
ecological research.
Literature: Gaston, K.J. & Spicer, J.I. 1998:
BIODIVERSITY. An Introduction. Blackwell.
109 p.
Duration: M.Sc. degree 1.-2. spring, 8 h
lectures, 14 h discussion groups, in English.
Responsible person: Timo Muotka.
Bioinformatiikan perusteet 3 op / 2 ov
(750340A)
Tavoite: Kurssin jälkeen opiskelija hallitsee
nukleotidi- ja proteiinisekvenssien käsittelyssä
käytettävät perusmenetelmät. Tavoitteena
on, että opiskelija oppii käyttämään alan
tietokantoja, ymmärtää analyysimenetelmien
taustan ja periaatteet, osaa suhtautua kriittisesti
käytettäviin menetelmiin, ja saa valmiudet
jatkuvasti kehittyvien, uusien menetelmien
käyttöön.
Sisältö: Käsiteltäviä aiheita ovat aineistojen
haku tietokannoista, sekvenssitiedon perusteella
tehtävä geenin toiminnan ja proteiinin
rakenteen arviointi, sekvenssien vertailu ja
sekvenssierojen arviointi, sekä geenien
41