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VIII Reunión de la Sociedad Mexicana de Astrobiología Cuernavaca, Morelos. 24 de agosto de 2012 40 Donde Ωa y Ωb corresponden al cociente entre tasas de sustitución sinónimas con respecto a nosinónimas (dN/dS) de las dos ramas emergentes a partir del evento evolutivo de duplicación genómica ancestral en los ascomicetos (levaduras), y Ω0 al dN/dS del resto de la filogenia. Las hipótesis: H0, H1 y H2, y sus respectivas pruebas de contraste, implementan estadísticamente la hipótesis evolutiva según la cual ocurre un cambio en las tasas de evolución molecular de los genes parálogos resultantes de una duplicación génica, inmediatamente posterior al mismo, debido a una relajación de la presión de selección negativa y/o a la acción de verdadera selección positiva, dando como resultado procesos de divergencia funcional (neofuncionalización y subfuncionalización). Para la realización de este estudio bioinformático se utilizó la información contenida en la base de datos “Fungal Othogroups Repository” 5 , que contiene las secuencias genómicas de 23 hongos ascomicetos. Además, la selección específica de los 7 pares de parálogos y ortogrupos correspondientes se hizo con base a los criterios de divergencia fenotípica en las secuencias codificantes que se encontraron experimentalmente por los investigadores del Laboratorio de Biología de Sistemas Genéticos (Ascencio, en preparación). Resultados Los resultados de las estimaciones por máxima verosimilitud y sus pruebas estadísticas de contraste de hipótesis se pueden consultar en las tablas 1 y 2. Conclusiones Conforme a los resultados obtenidos se concluye que la presión de selección natural se modifica como consecuencia del evento de duplicación genómica ancestral en 5 de los 7 pares de genes parálogos analizados. El incremento relativo en el índice omega de las ramas posteriores a la duplicación génica puede estar asociado con relajación de la selección negativa o selección positiva genuina, posiblemente relacionado con la divergencia funcional de estos genes y sus proteínas codificadas. Agradecimientos Agradecemos a los miembros del Laboratorio de Biología de Sistemas Genéticos, en especial a la M. en C. Diana Itzel Ascencio Sánchez por su valiosa colaboración científica, y del Grupo de Genómica Evolutiva por todo su apoyo, así como a la Química María Cristina Ortega Moo por su asesoría y ayuda en la redacción del presente escrito. Referencias [1] A. Castillo, in Ecología Molecular, E. L. Eguiarte, V. Souza, X. Aguirre, Eds. (SEMARNAT, 2007), chap. 1. [2] F. Perfectti, F.X. Picó, J.M. Gómez, Ecosistemas, 18(1),10-16 (2009). [3] J. Bertranpetit, SEBBM, 160, 12 (2009). [4] Z. Yang, Mol. Biol. Evol. 24(8),1586-1592 (2007). [5] I. Wapinski, A. Pfeffer, N. Friedman, A. Regev, Nat. 449(7158),54-61 (2007).
Tablas VIII Reunión de la Sociedad Mexicana de Astrobiología Cuernavaca, Morelos. 24 de agosto de 2012 41 Tabla 1. Descripción general de los valores de omega estimados y de verosimilitud asociados para cada modelo hipotético en los distintos ortogrupos que contienen los pares de parálogos estudiados. Ortogrupos Hipótesis Ω0 Ωa Ωb lnL H0 0.074 0.739 0.074 -36701.889 OG1074 H1 0.073 0.367 0.367 -36697.781 H2 0.073 1.127 0.184 -36697.531 H0 0.140 0.140 0.140 -113057.354 OG1675 H1 0.137 999.000 999.000 -113046.706 H2 0.137 941.712 999.000 -113046.706 H0 0.127 0.127 0.127 -74107.880 OG1893 H1 0.126 12.910 12.910 -74107.161 H2 0.127 762.177 0.098 -74106.565 H0 0.058 0.058 0.058 -33184.536 OG23610 H1 0.058 999.000 999.000 -33179.986 H2 0.058 999.000 999.000 -33179.986 H0 0.089 0.089 0.089 -53018.867 OG25431 H1 0.088 999.000 999.000 -53016.585 H2 0.088 259.280 934.464 -53016.585 H0 0.109 0.109 0.109 -47316.961 OG2962 H1 0.107 999.000 999.000 -47312.788 H2 0.107 773.580 999.000 -47312.788 H0 0.147 0.147 0.147 -11988.939 OG3776 H1 0.146 0.208 0.207 -11988.653 H2 0.147 0.140 999.000 -11986.868 Tabla 2. Resultados de las pruebas de rechazo de hipótesis estadísticas en cada ortogrupo. p Ortogrupos H0 vs H1 H1 vs H2 Hipótesis No - Rechazada OG1074 0.004* 0.480 H1 OG1675
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