Presentación en cartel - VIII Reunión de SOMA - Universidad ...

VIII Reunión de la Sociedad Mexicana de Astrobiología
Cuernavaca, Morelos. 24 de agosto de 2012 103
Presentación en cartel: BIOLOGÍA Y EVOLUCIÓN
ANÁLISIS EVOLUTIVO DE LOS PATRONES DE SELECCIÓN EN LAS CÁPSIDES DE
TRES VIRUS ICOSAÉDRICOS: VIRUS DEL MOSAICO DEL FRIJOL DEL SUR, VIRUS
DEL TOMATE Y VIRUS SATÉLITE DE LA NECROSIS DEL TABACO
Karina Espinoza Muñoz, CINVESTAV IPN-ITESI
karyes_21@hotmail.com
Luis José Delaye Arredondo, CINVESTAV IPN
Introducción
Debido al proceso de descendencia con modificación la evolución es un proceso
aproximadamente gradual [1]. Al nivel de la genética de poblaciones, los dos mecanismos principales
de la evolución son la deriva génica y la selección natural. Si bien la selección natural es el mecanismo
que explica las adaptaciones morfológicas, a nivel molecular la mayor parte de la variación es
mantenida por un balance entre la deriva génica y las mutaciones neutras o casi-neutras [2]. Con base a
múltiples discusiones que se han generado, se han desarrollado numerosos métodos para la detección
de selección a nivel molecular, por lo que el objetivo de este trabajo es determinar qué presiones
selectivas están actuando en el Virus del Mosaico del frijol del Sur, Virus del Tomate y Virus satélite
de la Necrosis del tabaco. Ello debido a que se ha sugerido que en las proteínas que conforman la
cápside de estos tres virus icosaédricos existen residuos sujetos a selección positiva que son
importantes para la interacción proteína-proteína y por lo tanto para la replicación de los mismos.
Métodos
Secuencias de Virus y Homólogos
Se utilizo la secuencia de la cápside del Virus del Mosaico del Frijol del Sur (SBMV); Virus del
Tomate, (TBSV); Y Virus satélite de la Necrosis del Tabaco, (STNV). Se realizó un BLAST en NCBI
para la obtención de homólogos.
Reconstrucciones filogenéticas
Las alineaciones se realizaron en el programa MEGAv5 y mediante el programa PHYLIP se
obtuvieron las filogenias por el método de Neighbor-Joining (NJ).
Traducción de la secuencia de aminoácidos a codones
Para el Análisis filogenético de los patrones de selección por máxima verosimilitud se obtuvieron
las correspondientes secuencias codificantes y se alinearon respetando los codones con el programa
PAL2NAL.
Análisis de Selección
El análisis de selección se realizará en PAML donde se requiere de los siguientes archivos:
Secuencia de codones, la reconstrucción filogenética y el archivo control.
En el archivo control se especificarán ciertos parámetros que nos permitirán poner a prueba las
hipótesis de evolución: por selección natural o por deriva genética y mutación neutral.