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Bolet%C3%ADn-63-Julio-2016
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correspondientes a dif erentes tejidos y estados de<br />
desarrollo (Figura 6). Un total de 44,104 contigs<br />
f ueron ensamblados, siento notable que un 6%<br />
mostraban mayor homología a secuencias dif erentes<br />
del género Fragaria y un 21% a secuencias nr<br />
(NCBI) dif erentes de plantas.<br />
Figura 6. Esquema de los pasos seguidos en el análisis<br />
del transcriptoma diferencial de la madur ación de los frutos<br />
de fresa, así como de su ensamblaj e de novo y el análisis<br />
del polimorfismo.<br />
A pesar de que la aproximación proteómica f ue la<br />
primera que se hizo en f rutos de f resa para<br />
identif icar cambios moleculares aasociados a la<br />
maduración de los f rutos, sin embargo ha estado<br />
limitada por la complejidad del extracto proteico<br />
obtenido de los f rutos, así como por los límites<br />
existentes, hoy día muy inf eriores, en la sensibilidad<br />
de la detección. La proteómica dif erencial entre<br />
aquenios y receptáculo, y entre dif erentes estados<br />
de desarrollo del receptáculo han apuntalado de<br />
f orma contundente la existencia de la ruta primaria<br />
de biosíntesis de v itamina C y la participación del<br />
etileno en el desarrollo del f ruto (Aragüez et al,<br />
2013).<br />
El metaboloma es probablemente la expresión f inal<br />
del estado actual en términos moleculares de una<br />
célula, o de un conjunto de ellas organizadas en<br />
tejidos y órganos. Su conocimiento, que av anza de<br />
f orma paralela a las capacidades de detección y<br />
análisis, contribuy e a entender el funcionamiento del<br />
sistema biológico analizado. La aplicación al estudio<br />
del desarrollo del f ruto de fresa en nuestro<br />
laboratorio se ha realizado por la colaboración con<br />
Allisdair Fernie (Max Planck, Göln). Los cambios en<br />
metabolitos primarios y secundarios han sido<br />
importantes para confirmar la f unción de los<br />
oligogalacturónidos parcialmente desmetilados<br />
(OGAs) en la defensa frente a Botrytis (Osorio et al.,<br />
2011), la acción del etileno en la maduración del<br />
receptáculo (Merchante et al. 2013), así como para<br />
delimitar la acción reguladora del factor de<br />
transcripción GAMYB dentro del programa de<br />
desarrollo del receptáculo (Vallarino et al., 2015).<br />
El futuro<br />
Nuevos reguladores (Fra)<br />
El conocimiento básico de los procesos biológicos<br />
han soportado de f orma significativ a los programas<br />
de mejora de muchas de las especies con interés<br />
agrícola. Hay procesos suf icientemente generales<br />
en los que la inf ormación obtenida de especies<br />
modelo son trasladables a otras especies. Sin<br />
embargo, bien las limitaciones genéticas de algunas<br />
especies, bien la singularidad del proceso de interés,<br />
hace difícil esta traslación en muchas casos. La<br />
fresa cultivada, Fragaria ananassa, entra dentro de<br />
esta categoría. Así, aunque se ha av anzado en el<br />
conocimiento del proceso de desarrollo del f ruto,<br />
aquenio y receptáculo, quedan muchas incógnitas<br />
sobre los circuitos hormonales que participan e<br />
interaccionan en este proceso de desarrollo. Esta<br />
inf ormación es básica y debe ser prev ia a la<br />
búsqueda de cualquier aplicación biotecnológica.<br />
Av ances importantes en el potencial agronómico de<br />
muchas de las especies cultivadas se ha sustentado<br />
sobre v ariaciones, naturales o inducidas, en genes<br />
reguladores. Los resultados del transcriptoma<br />
cambiante durante la maduración nos han permitido<br />
clasif icar de forma priorizada el potencial de los más<br />
de 1,500 f actores de transcripción identificados en el<br />
transcriptoma (Figura 6). Su estudio, más orientado<br />
a la aplicación biotecnológica, ha de ser prioritario<br />
en la inv estigación futura sobre el fruto de fresa.<br />
La regulación global en la especia modelo<br />
Este estudio de regulación y a está en marcha y<br />
liderado por Dav id Posé, que ha sido f inanciado<br />
durante 5 años por una ERC Starting Grant. El<br />
estudio se centra f undamentalmente en la especie<br />
modelo Fragaria vesca, pero sin perder la<br />
perspectiva de su extensióny aplicación a la especie<br />
cultiv ada Fragaria ananassa. Como resultado se<br />
espera el delineado de la red reguladora global del<br />
proceso de maduración del f ruto que deberá<br />
desemboca en la identificación de nuevos alelos<br />
transf eribles a los programas de mejora de laf resa.<br />
Estrategia mútiple de mejora del cultivo aplicando<br />
genómica y metabolómica<br />
Un desafío en el trabajo del grupo es la combinación<br />
del uso de las nuev as herramientas de análisis<br />
disponibles con su aplicación a una especie<br />
compleja como es la f resa. En esta dirección está<br />
enf ocado el trabajo del grupo en los próximos años.<br />
El trabajo está liderado por Sonia Osorio que<br />
coordina un nuevo proy ecto H2020 para los<br />
próximos 4 años. El enf oque netamente aplicado y<br />
con objetiv os traslacionales está garantizado por las<br />
empresas y grupos de mejora que integran el<br />
Consorcio. La aportación metabolómica, aportada<br />
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