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Bolet%C3%ADn-63-Julio-2016

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correspondientes a dif erentes tejidos y estados de<br />

desarrollo (Figura 6). Un total de 44,104 contigs<br />

f ueron ensamblados, siento notable que un 6%<br />

mostraban mayor homología a secuencias dif erentes<br />

del género Fragaria y un 21% a secuencias nr<br />

(NCBI) dif erentes de plantas.<br />

Figura 6. Esquema de los pasos seguidos en el análisis<br />

del transcriptoma diferencial de la madur ación de los frutos<br />

de fresa, así como de su ensamblaj e de novo y el análisis<br />

del polimorfismo.<br />

A pesar de que la aproximación proteómica f ue la<br />

primera que se hizo en f rutos de f resa para<br />

identif icar cambios moleculares aasociados a la<br />

maduración de los f rutos, sin embargo ha estado<br />

limitada por la complejidad del extracto proteico<br />

obtenido de los f rutos, así como por los límites<br />

existentes, hoy día muy inf eriores, en la sensibilidad<br />

de la detección. La proteómica dif erencial entre<br />

aquenios y receptáculo, y entre dif erentes estados<br />

de desarrollo del receptáculo han apuntalado de<br />

f orma contundente la existencia de la ruta primaria<br />

de biosíntesis de v itamina C y la participación del<br />

etileno en el desarrollo del f ruto (Aragüez et al,<br />

2013).<br />

El metaboloma es probablemente la expresión f inal<br />

del estado actual en términos moleculares de una<br />

célula, o de un conjunto de ellas organizadas en<br />

tejidos y órganos. Su conocimiento, que av anza de<br />

f orma paralela a las capacidades de detección y<br />

análisis, contribuy e a entender el funcionamiento del<br />

sistema biológico analizado. La aplicación al estudio<br />

del desarrollo del f ruto de fresa en nuestro<br />

laboratorio se ha realizado por la colaboración con<br />

Allisdair Fernie (Max Planck, Göln). Los cambios en<br />

metabolitos primarios y secundarios han sido<br />

importantes para confirmar la f unción de los<br />

oligogalacturónidos parcialmente desmetilados<br />

(OGAs) en la defensa frente a Botrytis (Osorio et al.,<br />

2011), la acción del etileno en la maduración del<br />

receptáculo (Merchante et al. 2013), así como para<br />

delimitar la acción reguladora del factor de<br />

transcripción GAMYB dentro del programa de<br />

desarrollo del receptáculo (Vallarino et al., 2015).<br />

El futuro<br />

Nuevos reguladores (Fra)<br />

El conocimiento básico de los procesos biológicos<br />

han soportado de f orma significativ a los programas<br />

de mejora de muchas de las especies con interés<br />

agrícola. Hay procesos suf icientemente generales<br />

en los que la inf ormación obtenida de especies<br />

modelo son trasladables a otras especies. Sin<br />

embargo, bien las limitaciones genéticas de algunas<br />

especies, bien la singularidad del proceso de interés,<br />

hace difícil esta traslación en muchas casos. La<br />

fresa cultivada, Fragaria ananassa, entra dentro de<br />

esta categoría. Así, aunque se ha av anzado en el<br />

conocimiento del proceso de desarrollo del f ruto,<br />

aquenio y receptáculo, quedan muchas incógnitas<br />

sobre los circuitos hormonales que participan e<br />

interaccionan en este proceso de desarrollo. Esta<br />

inf ormación es básica y debe ser prev ia a la<br />

búsqueda de cualquier aplicación biotecnológica.<br />

Av ances importantes en el potencial agronómico de<br />

muchas de las especies cultivadas se ha sustentado<br />

sobre v ariaciones, naturales o inducidas, en genes<br />

reguladores. Los resultados del transcriptoma<br />

cambiante durante la maduración nos han permitido<br />

clasif icar de forma priorizada el potencial de los más<br />

de 1,500 f actores de transcripción identificados en el<br />

transcriptoma (Figura 6). Su estudio, más orientado<br />

a la aplicación biotecnológica, ha de ser prioritario<br />

en la inv estigación futura sobre el fruto de fresa.<br />

La regulación global en la especia modelo<br />

Este estudio de regulación y a está en marcha y<br />

liderado por Dav id Posé, que ha sido f inanciado<br />

durante 5 años por una ERC Starting Grant. El<br />

estudio se centra f undamentalmente en la especie<br />

modelo Fragaria vesca, pero sin perder la<br />

perspectiva de su extensióny aplicación a la especie<br />

cultiv ada Fragaria ananassa. Como resultado se<br />

espera el delineado de la red reguladora global del<br />

proceso de maduración del f ruto que deberá<br />

desemboca en la identificación de nuevos alelos<br />

transf eribles a los programas de mejora de laf resa.<br />

Estrategia mútiple de mejora del cultivo aplicando<br />

genómica y metabolómica<br />

Un desafío en el trabajo del grupo es la combinación<br />

del uso de las nuev as herramientas de análisis<br />

disponibles con su aplicación a una especie<br />

compleja como es la f resa. En esta dirección está<br />

enf ocado el trabajo del grupo en los próximos años.<br />

El trabajo está liderado por Sonia Osorio que<br />

coordina un nuevo proy ecto H2020 para los<br />

próximos 4 años. El enf oque netamente aplicado y<br />

con objetiv os traslacionales está garantizado por las<br />

empresas y grupos de mejora que integran el<br />

Consorcio. La aportación metabolómica, aportada<br />

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