SEFV

Figura 4. A. Esquema simplificado de la síntesis de
eugenol e isoeugenol con indicaci ón del paso fi nal
catalizado por la eugenol sintesa (EGS) e isoeugenol
sintasa (IGS). B. Perfil cromatográfico en extractos de
frutos de fresa sobr e-expresando FaEGS2. C.
Caracterización cinética de l as activi dades EGS e IGS de
FaEGS2.
Una ruta esencial en el metabolismo secundario de
los f rutos de fresa, y de muchos otros frutos, es la de
los compuestos f enólicos y flav onoides. Compuestos
importantes en el f ruto de f resa son las proantocianidinas
y las antocianinas por un lado, y por
otro los monómeros de lignina y algunos de los
compuestos volátiles como los f enilpropenos. Los
pasos metabólicos están bien descritos, así como
identif icados los genes, o f amilias génicas,
codif icantes de los correspondientes enzimas. Sin
embargo, la regulación global de la ruta con todas
sus ramif icaciones, aún presenta bastantes lagunas.
Nuestra aportación se hizo a partir de una
colaboración con Wilf red Schwab, de la Universidad
Politécnica de Munich. Pruebas de transf ormación
transitoria identif icaron a un grupo de proteínas (Fra
a), incluídas dentro de laf amilia de proteínas PR10y
con ef ectos alergénicos para el consumo humano,
cuy o silenciamiento tenía como efecto más visible la
inhibición de la síntesis de antocianinas,
compensada por el aumento en concentración de
algunos deriv ados fenólicos (Muñoz et al., 2010).
Sorprendentemente, no hay ninguna inf ormación
def initv a sobre la f unción de estas proteínas en el
fruto de f resa, más allá de participar de alguna
manera en la regulación de metabolismo de
f lavonoides y derivados fenólicos. La cristalización
de un miembro de la familia en colaboración con J. A
Márquez (EMBO, Grenoble), Fra a1, mostró gran
similitud con el receptor de ABA la proteína
PYRL/PYL/RCAR (Casañal et al. 2013). Además, la
interacción específica de las div ersas Fra a con
f lavonoides presentes en el receptáculo (Figura 5)
apuntan a una f unción reguladora importante de Fra
a en el f ruto de fresa mediada por su unión a
ligandos específicos.
Figura 5. A. Detalle estructural de la unión de catequina a FaFra a1
obtenido de la cristalización de la proteína en presencia del ligando.
B. Estudio de la afinidad de Fra a1 por catequina por calorimetría
de la titulación isotérmica (ITC).
Las aproximaciones ómicas
La f resa es una especie alo-octoploide
genéticamente compleja (2n = 8x = 56). Estudios
recientes de su estructura subgenómica han
determinado que al menos 3 donadores diploides
han contribuido al genoma actual. Este contiene un
subgenoma que muestra similitud con el genoma de
la diploide Fragaria iinumae, dos subgenomas
adicionales no f ácilmente distinguibles, pero que
claramente segregan de f orma disómia, y un
subgenoma con gran similitud a Fragaria vesca.
Esta última especie, cuyo genoma está secuenciado
desde 2010 (Shulaev et al, 2010), es una especie
modelo no solo para la f resa cultiv ada sino también
para otras especies de Rosáceas, f amilia a la que
pertenecen las Fragaria. La información de
secuencia prev ia a esta fecha era muy limitada y
nuestro grupo ha hecho dos esf uerzso importantes
en la dirección del conocimiento genómica. Uno
primero f ue la generación de una colección de ESTs
(Bombarely et al. 2010), y generación de la base de
datos correspondiente (http://fresa.uma.es). Trabajo
realizado en colaboración con el grupo de J.F.
Sánchez Sev illa (IFAPA, Junta de Andalucíon) y J.
Muñoz (Univ ersidad de Córdoba). Esta inf ormación
de secuencia, aunque muy limitada, f ue de gran
utilidad en dos aspectos: 1) Identificación de genes
diana que f ueron esenciales para establecer que el
miRNA159 es un regulador del proceso de
maduración (Csukasi et al., 2012) y la implicación de
las giberelinas en dicho proceso (Csukasi et al.
2011); 2) Información de marcadores microsatélites
que f ueron utilizados por el grupo del IFAPA con el
que colaboramos, y cuy a localización regiones
codif icantes han sido de gran ay uda para los
estudios de QTLS (Zorrilla-Fontanesi et al., 2011)
como para la identificación de genes candidatos
para aspectos tan importantes de calidad del f ruto
como es la producción de v olátiles (Zorrilla-
Fontanesi et al., 2012).
La segunda aportación de secuencia más relev ante
la constituye el ensamblaje del transcriptoma a partir
de los datos de RNAseq de 10 muestras dif erentes
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