O papel modulador do gene AIRE - capes

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RESULTADOSFigura 25. Agrupamento hierárquico mostrando o perfil de expressão gênica decélulas mTEC transfectadas com RNAi anti-Aire comparados ao grupo controle decélulas mTEC na ausência de qualquer tipo de RNA interferente. O agrupamento foirealizado utilizando correlação de Pearson e “average linkage” utilizando o programaTIGR MEV (http://www.tm4.org/mev.html). Verde representa genes reprimidos,vermelho genes induzidos, preto genes que não tiveram modulação com relação aocontrole e cinza dados perdidos.83
RESULTADOS6.7. Análise da expressão gênica promíscua.A PGE exibida pelas células mTEC controles e transfectadas com oRNAi anti-Aire foi analisada a partir dos genes diferencialmenteexpressos obtidos pelo programa SAM seguida de agrupamentohierárquico. Dos 212 genes diferencialmente expressos, 80 encontravamseinduzidos e 132 reprimidos em células mTEC transfectadas. Foi feitaentão uma consulta para cada um dos genes usando o banco de dadosSymatlas (http://symatlas.gnf.org/SymAtlas/) que indica arepresentatividade do gene consultado em mais de 60 tecidos e/ouórgãos do camundongo (figura 26) os quais foram finalmente agrupadosem 17 sistemas. As informações de cada gene encontrado no Symatlaspossibilitaram a construção de gráficos de setores mostrando asporcentagens de representação dos 17 sistemas diferentes pelas célulasmTEC (figuras 27 e 28).Como se pôde observar o silenciamento parcial de Airedesencadeou indução de vários genes e repressão de outros nas célulasmTEC, modulando assim os níveis de expressão dos genes TRAs (PGE)(figura 25). Esses dois conjuntos de genes serviram de base para seconfeccionar dois gráficos de setores mostrando a modulação da PGE e,portanto, a modulação da representatividade de TRAs (figuras 27 e 28).É importante salientar que a inibição parcial de Aire não alterou adiversidade deste conjunto gênico, mas sim seus respectivos níveis deexpressão.84
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Universidade de São PauloFaculdade
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Macedo, ClaudiaO papel modulador do
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Dedico Especialmente este TrabalhoM
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AgradecimentosAgradeço do fundo do
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ÍndiceRESUMO .....................
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Promiscuous gene expression in medu
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INTRODUÇÃORecentemente surgiram e
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INTRODUÇÃOmigram para a região s
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INTRODUÇÃOgrande diversidade nas
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Anexo II
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Manuscrito da Tese
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MANUSCRITOAbstractThe expression of
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225Table 1. Target cDNA sequences a
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227coincided (CBA/J) with expressio
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