O papel modulador do gene AIRE - capes

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RESULTADOS6.6. Quantificação e normalização dos dados de microarraysPara análise dos dados dos microarrays em lâminas de vidrocontendo 4.500 seqüências, foi utilizado inicialmente o tratamentoestatístico SAM (Significance Analysis of Microarrays) com o qual se podeselecionar 1611 genes diferencialmente expressos (FDR ≤ 5%, p-value ≤0,005), ou seja, com 95% de confiabilidade entre os cinco grupos decélulas analisadas. A figura 23 ilustra a matriz de expressão gênica com odendrograma dos genes e amostras, com uma distinção entre os gruposamostrais de acordo com o tratamento. Os 1611 genes diferencialmenteexpressos estão listados na tabela II, do anexo I.79
RESULTADOSFigura 23. Agrupamento hierárquico mostrando o perfil de expressão gênica dos diferentesgrupos de células mTEC. O agrupamento foi realizado utilizando correlação de Pearson e“average linkage” utilizando o programa TIGR MEV (http://www.tm4.org/mev.html). Verderepresenta genes reprimidos, vermelho genes induzidos, preto genes que não tiverammodulação com relação ao controle e cinza dados perdidos.80
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Universidade de São PauloFaculdade
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Macedo, ClaudiaO papel modulador do
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Dedico Especialmente este TrabalhoM
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AgradecimentosAgradeço do fundo do
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Promiscuous gene expression in medu
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Anexo II
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MANUSCRITOAbstractThe expression of
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T cell signaling gene networks duri
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IntroductionThe thymus is an import
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227coincided (CBA/J) with expressio
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