O papel modulador do gene AIRE - capes

DELINEAMENTO EXPERIMENTAL5. DELINEAMENTO EXPERIMENTALCultura de células mTECs napresença ou não de RNAi.Biblioteca de cDNAIMAGE.Extração de RNAPCRPreparação das sondascomplexas de cDNAfluorescentes Cy3 e Cy5Confecção de cDNA-microarraysem lâminas de vidro com o auxíliodo robô Array Spotter Gen III (GE).HibridaçõesQuantificação das imagens como uso do programa SpotFinder.Análise dos dados realizada no ambiente estatístico R com oauxílio dos pacotes LIMMA, Bioconductor, Aroma e KTH.Identificação dos genes diferencialmente expressos.Análises “in silico” (SymAtlas, GeneNetwork,Mandala).Figura 12. Fluxograma do trabalho mostrando o sistema modelo experimental utilizandocélulas tímicas epiteliais medulares (mTEC 3.10), a inibição do transcrito do gene Aire, ashibridações com microarrays e o uso dos programas de bioinformática.69