O papel modulador do gene AIRE - capes

MATERIAL E MÉTODOSsistemas. A análise foi feita utilizando o banco de dados SymAtlas(http://symatlas.gnf.org/SymAtlas/) que permite a visualização daexpressividade de cada gene em um gráfico de barras paralelas queapresenta 60 tecidos, que representam por sua vez 17 sistemas doorganismo.Visando a homogeneização dos dados optou-se por considerarcomo tecidos representados por um determinado gene, apenas aquelestecidos que obtiveram expressividade superior à linha da mediana que seencontra presente em cada gráfico. Após a organização dos dados emsistemas, gerou-se uma planilha contendo o número de genes quecaracterizavam cada sistema em particular e, posteriormente, gerou-seum gráfico de setores demonstrando a representatividade de cadasistema nos agrupamentos definidos.4.13. GeneNetworkO programa escolhido para a inferência de redes gênicas foi oGeneNetwork por ser aquele que melhor se aplica aos nossos conjuntosde dados. O GeneNetwork é um software livre e encontra-se disponívelaos usuários no site: http://genenetwork.sbl.bc.sinica.edu.tw/index.asp.O fluxo do trabalho para GeneNetwork é como segue: (1) input dosdados experimentais no formato de texto limitado por tabulações; (2)procede a interpolação dos dados através do controlador de interpolaçãose o número de pontos de dados experimentais forem insuficientes parainiciar os cálculos de inferência; (3) executar a aproximação da inferênciapor engenharia reversa através do “Modeling controller” para gerar amatriz gênica regulatória que descreve como os genes se regulam; (4)66