O papel modulador do gene AIRE - capes

MATERIAL E MÉTODOSO programa SAM permite ainda o agrupamento hierárquico,porém, o mais importante na elaboração deste agrupamento é a decisãosobre qual medida de similaridade será adotada, a necessidade de setransformar a escala dos valores de expressão (normalmentetransformada em escala logarítmica) e a dependência dos genes entre si.O agrupamento hierárquico nos permite a definição de grupos de genescom o mesmo padrão de expressão, seja ele de indução ou de repressão.Todas as informações citadas acima foram retiradas do trabalho deTusher et al. 2001, do manual do software SAM e de relatórios técnicospublicados na página de Robert Tibshirani (http://wwwstat.stanford.edu/~tibs/SAM).4.11.1. Nomenclatura dos genesNeste trabalho, optou-se por seguir a nomenclatura usual para genesde camundongos, ou seja, o símbolo do gene em inglês com a primeiraletra maiúscula e as seguintes minúsculas (exemplo: Aire paraAutoimmune regulator). Os nomes dos genes estão em inglês, pois toda aliteratura e os bancos de dados internacionais como Source, GenBank etc.estão neste idioma. Além disso, todos os arquivos da biblioteca de cDNAestão em inglês.4.12. Análise da expressão gênica promíscuaOs agrupamentos gênicos gerados durante o processamento dosdados no programa TIGR MEV foram analisados em termos de ExpressãoGênica Promíscua (PGE) para avaliar a representatividade dos órgãos e65