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O papel modulador do gene AIRE - capes

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MATERIAL E MÉTODOSOnde Xp(i) e Xc(i) são defini<strong>do</strong>s como níveis médios da expressão<strong>do</strong> <strong>gene</strong> nos esta<strong>do</strong>s p (timo) e c (pool de órgãos), respectivamente. Adispersão <strong>gene</strong>-específica S(i) é o desvio padrão de medidas repetidas deexpressão, e a constante positiva So no denomina<strong>do</strong>r da equação acima,servem para certificação de que a variância de d(i) é independente daexpressão gênica. Para a determinação de <strong>gene</strong>s com mudançassignificativas na expressão, utilizou-se um gráfico de dispersão d(i), emrelação à diferença relativa esperada dE.(i). Para uma grande maioria de<strong>gene</strong>s d(i) ≅ dE.(i), mas alguns <strong>gene</strong>s são representa<strong>do</strong>s por pontosdistantes da linha d(i) ≅ dE.(i). As alterações das expressões <strong>do</strong>s <strong>gene</strong>s quese encontram a uma distância maior <strong>do</strong> que o limiar (∆) é entãoconsidera<strong>do</strong> significante (figura 11).Significant: 104Median # false significant: 50,24446SAM PlotDelta 0,47270Fold Change15105Observed0-15 -10 -5 0 5 10-5-10-15Expe cte dFigura 11: Comparação entre a distância relativa observada d(i) e esperada dE(i).63

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