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O papel modulador do gene AIRE - capes

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MATERIAL E MÉTODOS(Merck), solução 0,2 M de KOH e água novamente. As canetas foramsecas com nitrogênio 5.0 analítico antes das próximas amostras seremcarregadas. A câmara de deposição das amostras em lâminas <strong>do</strong> robôArray Spotter III possui temperatura e umidade controladas. A umidaderelativa de deposição das amostras foi de ≈ 55% e a temperatura foi de ≈25°C. Além disso, este robô está instala<strong>do</strong> numa sala especial com arlimpo (sala limpa classe 10.000).Após a deposição e secagem de todas as amostras nas lâminas, oDNA foi fixa<strong>do</strong> por “cross-linking” por meio de irradiação ultravioleta a500 mJ de energia (Hoefer UV Crosslinker).4.7. Delineamento das hibridações em microarraysUma escolha chave em um projeto que envolve a tecnologia demicroarray é utilizar comparações que podem ser diretas ou indiretas istoé, estabelecer comparações dentro ou entre as lâminas. Existem trêsprincipais tipos de delineamento: 1) inversão de corantes (dye-swap), 2)experimentos em volta (looping) e 3) RNA de referência (figura 7). Mas,não existe um delineamento experimental ideal para todas as situações,ou seja, diferentes desenhos experimentais são necessários para contextosexperimentais diferentes. Qualquer que seja o tipo de desenho utiliza<strong>do</strong>será requeri<strong>do</strong> o mesmo número de hibridações, e a decisão sobre o tipode delineamento deve considerar a pergunta <strong>do</strong> trabalho.49

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