Anotación funcional - Bioinformatics and Genomics Department at ...
Anotación funcional - Bioinformatics and Genomics Department at ... Anotación funcional - Bioinformatics and Genomics Department at ...
Software Demo (II) Desarrollo (II): • Ampliar las anotaciones usando la herramienta “Annex” Annex en el menú “Annotation” Annotation y observa los resultados en “Application Messages”. • Complementar/cambiar la anotación de la secuencia no.3 manualmente usando enlaces al NCBI y Amigo, "The Gene Ontology Web Browser" (www.geneontology.org) • PPara conseguir i eso se abre b el l menú ú ddel l contexto t t dde esa secuencia i (b (botón tó dderecho) h ) y se abre b los resultados blast, las descripciones GO y el grafo de la anotación de las 3 categorías de esta secuencia. • Busca en el Amigo los términos biológicos más frecuentes del resultado blast (ubiquitin) y compara los resultados con las anotaciones hechas por el B2G. Con el menú ítem: "Change annotation and description" añade esa nueva anotación encontrado en el Amigo (protein ubiquitination). • Vuelve a generar g el ggrafo de esa anotación ppara ver el cambio. • Visualización: Visualizar la anotación de esta secuencia y generar un "Combined Graph" del conjunto de secuencias/anotaciones del grafo "molecular function". Repetir cambiando Node Score Filter a 1. • Fisher Fisher. Hacer un análisis de enriquecimiento y visualizar datos datos. Utilizar ficheros reference.annot y test.txt. Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante
Para terminar � … os invitamos a probarlo en www.blast2go.de �� Y nos alegramos siempre de recibir “feedback” feedback � ¿Más preguntas? Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante
- Page 1 and 2: Anotación Funcional de Secuencias
- Page 3 and 4: Contenido 1. Conceptos p y necesida
- Page 5 and 6: Aclaraciones sobre “anotación”
- Page 7 and 8: Sistemas terminológicos Motivos Fu
- Page 9 and 10: Servidores y Software PFP Protein A
- Page 11 and 12: Conceptos de anotación funcional e
- Page 13 and 14: Anotación en Blast2GO � Término
- Page 15 and 16: Conceptos de anotación funcional d
- Page 17 and 18: Evaluación Curso Bioinformática,
- Page 19 and 20: Arquitectura Curso Bioinformática,
- Page 21 and 22: Buscar de secuencias similares con
- Page 23 and 24: Mapeo de términos GO con secuencia
- Page 25 and 26: Mapeo de términos GO con secuencia
- Page 27 and 28: Gráficas Descriptivas Anotación C
- Page 29 and 30: Anotación de KEGG pathways GO �
- Page 31 and 32: Visualización (Una secuencia) Curs
- Page 33 and 34: Visualización (Varias Secuencias)
- Page 35 and 36: Análisis estadístico (Fisher´s E
- Page 37 and 38: Blast2GO4Pipe Resultados Blast en f
- Page 39 and 40: Uso mundial del Blast2GO Especies C
- Page 41 and 42: Presesencia WWeb: b http://www.gene
- Page 43 and 44: Ejemplos de uso en “papers” (II
- Page 45: Software Demo (I) Objetivo Conocer
Para terminar<br />
� … os invitamos a probarlo en www.blast2go.de<br />
�� Y nos alegramos siempre de recibir “feedback” feedback<br />
� ¿Más preguntas?<br />
Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante
Change language