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Buscar secuencias similares con BLAST Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante

Mapeo de términos GO con secuencias Fuentes del mapeo: � Gene Ontology BBDD: contiene mas de ~2 milliones de “productos geneticos” anotado en GO, de Arabidopsis hasta Zebrafish. � NCBI Flat Files: gene2accession (4 079 414 entries) gene_info (1 635 614 entries) � PIR ‐ Non‐Redundant Reference Protein Database: incluye PSD, UniProt, Swiss‐Prot, TrEMBL, RefSeq, GenPept y PDB Hit ACC/GI Mapping RResources EC GO-Terms GO Terms sim % Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante

Mapeo de términos GO con secuencias<br />

Fuentes del mapeo:<br />

� Gene Ontology BBDD: contiene mas de ~2<br />

milliones de “productos geneticos” anotado en GO, de<br />

Arabidopsis hasta Zebrafish.<br />

� NCBI Fl<strong>at</strong> Files: gene2accession (4 079 414 entries)<br />

gene_info (1 635 614 entries)<br />

� PIR ‐ Non‐Redundant Reference Protein D<strong>at</strong>abase:<br />

incluye PSD, UniProt, Swiss‐Prot, TrEMBL, RefSeq,<br />

GenPept y PDB<br />

Hit<br />

ACC/GI<br />

Mapping<br />

RResources<br />

EC<br />

GO-Terms GO Terms<br />

sim %<br />

Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante

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