Anotación funcional - Bioinformatics and Genomics Department at ...
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Conceptos p de anotación funcional del B2G Similitud EEspecificidad ifi id d Precisión CCalidad lid d Selección Regla de anotación Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante
Conceptos de anotación funcional del B2G término más bajo cumpliendo los requisitos requerimiento de similitud sim = ∑ positives hsp ∑ hsp calidad de la anotación t ió “source” “ ” EC weight IC 1 TAS 1 IDA 1 IMP 0.9 IGI 0.9 IPI 0.9 ISS 08 0.8 IEP 0.8 NAS 0.7 IEA 0.7 cóódigos de eevidenciaa posibilidad de abstracción Recall alignmentl ength engthhsp ND 05 0.5 vs vs. NR 0.5 RCA 0.5 Precision lowest. node[(max. sim× ECw) + (# GO× GOw)] ≤threshold Regla de anotación Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante
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Conceptos de anotación <strong>funcional</strong> del B2G<br />
término más bajo<br />
cumpliendo los requisitos<br />
requerimiento de similitud<br />
sim<br />
=<br />
∑ positives<br />
hsp<br />
∑ hsp<br />
calidad de la<br />
anotación t ió “source” “ ”<br />
EC weight<br />
IC 1<br />
TAS 1<br />
IDA 1<br />
IMP 0.9<br />
IGI 0.9<br />
IPI 0.9<br />
ISS 08 0.8<br />
IEP 0.8<br />
NAS 0.7<br />
IEA 0.7<br />
cóódigos<br />
de eevidenciaa<br />
posibilidad de abstracción<br />
Recall<br />
alignmentl ength engthhsp<br />
ND 05 0.5<br />
vs vs.<br />
NR 0.5<br />
RCA 0.5<br />
Precision<br />
lowest. node[(max. sim× ECw) + (# GO× GOw)] ≤threshold<br />
Regla de anotación<br />
Curso Bioinformática, 19 Diciembre 2007, Universida de Alicante