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Contenido - Instituto de Investigaciones de Sanidad Vegetal

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Tejeda Gómezmado por estudios <strong>de</strong>l material genético [Cook et al.,1989].La especie R.solanacearum constituye una unidadtaxonómicamente compleja en la que las cepas muestranuna amplia diversidad a diferentes niveles: fisiológico,serológico, genético y <strong>de</strong> rango <strong>de</strong> hospedantes. Elgran número <strong>de</strong> cepas <strong>de</strong> R. solanacearum existente entodo el mundo dificulta el establecimiento <strong>de</strong> criteriospara la diferenciación <strong>de</strong> cepas, aspecto esencial para eltrabajo <strong>de</strong> los taxónomos y <strong>de</strong>l personal <strong>de</strong> cuarentena.Con el objetivo <strong>de</strong> <strong>de</strong>scribir esta variabilidad intraespecíficase han propuesto diversos sistemas <strong>de</strong> clasificación.Se conocen cinco razas <strong>de</strong> R. solanacearum cuya separaciónestá basada en el rango <strong>de</strong> los hospedantes y lahabilidad para sobrevivir bajo diferentes condicionesambientales [Bud<strong>de</strong>nhagen et al., 1962; He et al., 1983;Bud<strong>de</strong>nhagen, 1985; Pegg y Moffett, 1971]. La utilización<strong>de</strong> tres disacáridos y/u oxidación <strong>de</strong> tres hexosaalcoholes ha permitido la separación <strong>de</strong> los aislamientosen seis biovares [Hayward, 1964; He et al., 1983;Hayward et al., 1990]. El sistema <strong>de</strong> clasificación enrazas y biovares es confuso, pues cada biovar contienecepas con diferentes rangos <strong>de</strong> hospedantes, y variasrazas contienen una amplia diversidad <strong>de</strong> cepas pertenecientesa diferentes biovares. Solo existe correspon<strong>de</strong>nciaentre la raza 3 y el biovar 2. El análisis <strong>de</strong> ácidosgrasos [Janse, 1991] y <strong>de</strong>l perfil <strong>de</strong> proteínas [Dianeseet al., 1994] no ha logrado esclarecer las relaciones entrelas cepas ni el establecimiento <strong>de</strong> un criterio <strong>de</strong> clasificaciónuniforme. Esto hace que los métodos tradicionales<strong>de</strong> clasificación no sean lo suficientementeefectivos [Poussier et al., 1999; Sequeira, 1994].Estas dificulta<strong>de</strong>s condujeron a la búsqueda <strong>de</strong> un nuevosistema <strong>de</strong> clasificación basado en el análisis <strong>de</strong>l materialgenético. Muchas <strong>de</strong> las técnicas moleculares empleadasen la actualidad tienen como fundamento comúnla separación <strong>de</strong> fragmentos <strong>de</strong> ADN <strong>de</strong> diferentes pesosmoleculares. El resultado electroforético se representapor un patrón <strong>de</strong> bandas en un gel. Estos patrones suelenser muy complejos y <strong>de</strong> difícil interpretación.Entre las técnicas utilizadas para el estudio <strong>de</strong> R. solanacearumse encuentran el polimorfismo <strong>de</strong> longitud <strong>de</strong>fragmentos <strong>de</strong> restricción (Restriction Fragment LengthPolymorphism (RFLP)) en sus dos variantes: Southernblotting-RFLP y PCR-RFLP, el ADN polimórficoaleatoriamente amplificado (Random AmplifiedPolymorphic DNA or Arbitrary Primed PCR, RAPD),el Rep-PCR, el polimorfismo <strong>de</strong> longitud <strong>de</strong> fragmentosamplificados (Amplified Fragment LengthPolymorphism (AFLP)) y la secuenciación <strong>de</strong> regionesespecíficas <strong>de</strong>l genoma. El empleo <strong>de</strong> cada una <strong>de</strong> ellasha contribuido a una caracterización y diferenciaciónmás acertadas <strong>de</strong> las cepas. El análisis a nivel genético<strong>de</strong> las cepas ofrece la posibilidad <strong>de</strong> estudiar las relacionesfilogenéticas y evolutivas entre ellas.Contribución <strong>de</strong> los estudios <strong>de</strong> diversidad genéticaa la diferenciación intraespecífica <strong>de</strong> las cepas<strong>de</strong> Ralstonia solanacearumLos primeros trabajos que constituyeron un hito en elestudio <strong>de</strong> la diversidad genética <strong>de</strong>l patógeno fueronreportados por Cook et al. (1989) y Cook y Sequeira(1994). Estos investigadores utilizaron el Southernblotting-RFLP con nueve sondas, lo que les permitió<strong>de</strong>tectar y localizar secuencias específicas en el ADN,las cuales contenían información esencial para la virulenciay la respuesta <strong>de</strong> hipersensibilidad. Estas secuenciasse sometieron a digestión con enzimas <strong>de</strong> restricciónespecíficas. La ubicación <strong>de</strong> los sitios <strong>de</strong> corte parauna enzima <strong>de</strong> restricción <strong>de</strong>terminada <strong>de</strong>ntro <strong>de</strong> unlocus <strong>de</strong> interés pue<strong>de</strong> variar <strong>de</strong> una cepa a otra, y traercomo resultado fragmentos que difieren en tamaño encepas diferentes [Olive y Bean, 1999]. El análisis <strong>de</strong> lospatrones electroforéticos obtenidos por este procedimientoposibilitó establecer la existencia <strong>de</strong> dos gruposo divisiones con un coeficiente <strong>de</strong> similitud <strong>de</strong> 13,5%:la división I, que incluyó los biovares 3, 4 y 5, y la divisiónII, formada por las cepas <strong>de</strong> biovares 1, 2 y N2.Dentro <strong>de</strong> cada división los coeficientes <strong>de</strong> similitudresultaron ser muy elevados, y fueron mayores <strong>de</strong>ntro<strong>de</strong> la división I. Más <strong>de</strong>l 90% <strong>de</strong> las cepas <strong>de</strong> ladivisión I procedían <strong>de</strong> Asia y Australia (divisiónAsiaticum), mientras que 98% <strong>de</strong> las cepas <strong>de</strong> la divisiónII eran originarias <strong>de</strong> las Américas (divisiónAmericanum).Estas divisiones se han confirmado por análisis <strong>de</strong> lasecuencia <strong>de</strong>l gen que codifica para el ARN ribosomal16 S [Li et al., 1993; Seal et al., 1993; Taghavi et al.,1996]. El análisis <strong>de</strong> esta secuencia permitió estudiarlas relaciones filogenéticas y evolutivas entre losmicroorganismos, dado su elevado contenido informacional,su naturaleza conservativa, su distribuciónuniversal y la accesibilidad <strong>de</strong> las secuencias en bancos<strong>de</strong> genes [Woese, 1987]. Las secuencias <strong>de</strong> los genes quecodifican para el ARNr 16S son por lo general específicaspara cada especie y están presentes en múltiples300/fitosanidad

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