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Una Dinámica Regulatoria Discreta

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Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

<strong>Una</strong> Dinámica <strong>Regulatoria</strong> <strong>Discreta</strong><br />

Edgardo Ugalde<br />

Instituto de Física, UASLP<br />

Coloquio del Instituto de Matemáticas<br />

Morelia, 12 de Marzo del 2008<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

Contenido<br />

1 ¿Qué es la regulación<br />

2 ¿Cómo se estudia<br />

3 ¿Qué se sabe<br />

4 ¿Cómo la estudiamos nosotros<br />

5 ¿Qué hemos encontrado<br />

6 ¿Qué sigue<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué es la regulación<br />

Predador–Presa<br />

P<br />

C<br />

Población<br />

Tiempo<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué es la regulación<br />

Regulación Genética<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Cómo se estudia<br />

Redes Lógicas o Booleanas<br />

P<br />

X t+1<br />

P<br />

= ¬XC<br />

t<br />

X t+1<br />

C<br />

= X P t<br />

C<br />

t XP t XC<br />

t<br />

0 1 1<br />

1 0 1<br />

2 0 0<br />

3 1 0<br />

4 1 1<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Cómo se estudia<br />

Ecuaciones Diferenciales Acopladas<br />

P<br />

C<br />

dx P<br />

dt<br />

dx C<br />

dt<br />

!<br />

= −x P + κ P,C 1 − xm C<br />

x<br />

C m + θm C<br />

= −x C + κ C,P<br />

xP<br />

m<br />

x<br />

P m + θm P<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué se sabe<br />

Programa de Thomas<br />

Teorema (Gouzé)<br />

Consideremos el sistema<br />

dx<br />

dt = f (x), x ∈ D ⊂ Rn .<br />

Supongamos que el signo del Jacobiano no cambia en D. Si todos<br />

los circuito del grafo de interacción son no positivos, y si hay al<br />

menos un término no nulo en la expansión del determinante del<br />

signo del Jacobiano, entonces f es inyectiva en D, y por lo tanto<br />

hay a lo más un punto de equilibrio.<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué se sabe<br />

Teorema (Gouzé)<br />

Consideremos el sistema<br />

dx<br />

dt = f (x), x ∈ D ⊂ Rn .<br />

Supongamos que el signo del Jacobiano no cambia en D. Si todos<br />

los semicircuito de longitud 2 p n del grafo de interacción son<br />

no negativos. Entonces no hay trayectorias periódicas atractivias.<br />

Además, si el grafo de interacciones es fuertemente conexo,<br />

entonces casi toda trayetoria converge a un punto de equilibrio o<br />

diverge.<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué se sabe<br />

Las redes Booleanas de Kauffman<br />

F : {0, 1} n → {0, 1} n , F(x) i = F i (x i1 , x i2 , . . . , x iK )<br />

i<br />

1<br />

i<br />

2<br />

i<br />

3<br />

i<br />

k<br />

i<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué se sabe<br />

Resultados Empíricos<br />

ρ = P<br />

(F )<br />

i (a) ≠ F i (b) : a, b ∈ {0, 1} K<br />

⎧<br />

⎨ O(1) si ρ < 1/K,<br />

E(#ciclos) → O( √ N) si ρ = 1/K,<br />

⎩<br />

O(N) si ρ > 1/K.<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Cómo la estudiamos nosotros<br />

Redes <strong>Regulatoria</strong>s <strong>Discreta</strong>s<br />

F : [0, 1] n → [0, 1] n<br />

F(x) i = ax i + (1 − a)D i (x i1 , x i2 , . . . , x id (i))<br />

i 1<br />

i 2<br />

i 3<br />

i k<br />

i<br />

D i (x i1 , x i2 , . . . , x id (i)) = 1<br />

d(i)<br />

∑<br />

H(σ i,ij (x ij − T i,ij ))<br />

d(i)<br />

j=1<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Cómo la estudiamos nosotros<br />

D i : [0, 1] n → {e i,1 , e i,2 , . . . , e i,l(i) } ⊂ [0, 1] n<br />

F<br />

T<br />

F,S<br />

S<br />

S<br />

T<br />

S,M<br />

F<br />

M<br />

T<br />

T<br />

T<br />

M,M M,F M,S<br />

M<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Cómo la estudiamos nosotros<br />

Dinámica Simbólica<br />

F (x) = ax + (1 − a)H(T − x)<br />

0 1<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Cómo la estudiamos nosotros<br />

Teorema (Coutinho)<br />

Consideremos la contracción por pedazos<br />

F (x) = ax + (1 − a)H(T − x), x ∈ [0, 1].<br />

Sea Λ = ∩ ∞ t=0 F −t ([0, 1]). Entonces existe ν = ν(a, T ), y una<br />

transformación contínua φ : Λ → [0, 1] tal que<br />

φ ◦ F (x) = φ(x) + ν ( mod 1), ∀x ∈ Λ.<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué hemos encontrado<br />

Complejidad Simbólica<br />

F<br />

TF,S<br />

S<br />

Se define una codificación:<br />

x → (I 0 , I 1 , . . . , ) ∈ A N F t (x) ∈ I t .<br />

TM,M TM,F TM,S<br />

M<br />

TS,M<br />

La complejidad es:<br />

C(τ) := #{(I 0 , . . . , I τ ) : (I t ) ∞ t=0 admisible }<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué hemos encontrado<br />

Teorema (U. Lima)<br />

Consideremos la contracción por pedazos del tipo<br />

F : [0, 1] n → [0, 1] n<br />

F(x) i = ax i + (1 − a)D i (x i1 , x i2 , . . . , x id (i)).<br />

Si los dominios de continuidad de las funciones D i son rectángulos,<br />

entonces existe a 0 > 0 tal que para todo 0 a < a 0 tenemos<br />

C(τ) 1 + (P − 1)(1 + (P − 1) n τ n ), ∀τ ∈ N.<br />

Aquí P=número de dominios de continuidad de F .<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué hemos encontrado<br />

Convergencia a órbitas periódicas<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué hemos encontrado<br />

Teorema (U. Lima)<br />

Consideremos la contracción por pedazos del tipo<br />

F : [0, 1] n → [0, 1] n<br />

F(x) i = ax i + (1 − a)D i (x i1 , x i2 , . . . , x id (i)).<br />

Si los dominios de continuidad de las funciones D i son rectángulos,<br />

entonces para cada a 0 la probabilidad conjunta de escoger D i y<br />

condiciones iniciales x ∈ [0, 1] n tales que la órbita {F t (x)}<br />

converge a una órbita periódica es 1, es decir,<br />

P(dist({F t (x)}, Per(F )) → 0) = 1.<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué sigue<br />

Trabajos en Curso<br />

Más dinámica simbólica para redes pequeñas.<br />

Cotas inferiores para la complejidad.<br />

Ingeniería: subredes y sistemas abiertos.<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>


Dinámica <strong>Regulatoria</strong><br />

¿Qué sigue<br />

Gracias<br />

Edgardo Ugalde<br />

Dinámica <strong>Regulatoria</strong>

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