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Biotecnología para el uso sostenible de la biodiversidad
Figura 14. Tipos de genómica y pasos que involucra un estudio genómico
Genómica estructural
Figura 14
Tipos de genómica y pasos
que involucra un estudio
genómico
Análisis
del genoma
Mapeo genético
y físico
Secuenciamiento
del genoma
Genómica Funcional
Genes: función bioquímica, fisiológica, adaptativa
• ESTs- cDNA
• Microarrays DNA
Análisis
in silico
Función
determinada
Confirmación
experimental
• Bioinformática
• “Knockouts”
• Sobreexpresión
• Subexpresión
Fuente: Adaptado por Roca, W. (2004)
genomas (genéticos, físicos y de transcripción) y para
elucidar secuencias genómicas de diferentes organismos.
El término se ha extendido a los métodos
empleados para determinar experimentalmente las
estructuras de todos los posibles plegamientos de las
proteínas. El asignamiento de la función bioquímica
de una proteína puede ser llevada a cabo escaneando
su estructura para confrontarlo con la geometría y
actividad química de un sitio activo conocido, de
modo que la genómica estructural nos lleva primero a
determinar la estructura de una proteína y luego a
investigar su función. (Skolnick et. al., 2000).
Genómica funcional. La disponibilidad de secuencias
genómicas completas para algunos organismos
junto con el desarrollo de procedimientos de alta
tecnología para el análisis de la función génica ha
marcado la era postgenómica en la biología. El
análisis sistemático de los patrones de expresión del
RNA y proteínas y las modificaciones post traduccionales
son ahora posibles para muchos genes.
Esto provee importantes pistas acerca de interacciones
proteína-proteína y función génica en
contextos de desarrollo complejos. Por ejemplo el
estudio del proceso de germinación de semillas ha
sido estudiado en el ecotipo Landsberg erecta de
Arabidopsis. Para ello se utilizaron geles de electroforesis
bidimensional para analizar las proteínas de
la semilla y los cambios en abundancia de estas
proteínas durante el proceso de germinación. Algunas
de estas proteínas fueron identificados mediante
espectroscopia de masa (MALDI-TOF). Cerca de
1.300 proteínas diferentes fueron resueltas en los
geles y clasificadas de acuerdo a patrones de
acumulación específicos, al parecer el proceso de
germinación estaría asociado con modificaciones en
la abundancia de un número limitado de proteínas
(Bove et. al., 2001).
El enfoque de genómica funcional, que utiliza análisis
computacionales y de expresión, combinados de
grandes cantidades de información de secuencia,
permite acelerar el entendimiento del metabolismo
celular en tejidos especializados y en todo el organismo.
Como ejemplo se puede citar el trabajo de
Lange et. al., (2000), que está referido a la identificación
de genes para la biosíntesis de aceites esenciales
(monoterpenos) en Mentha, cuyos genes
fueron aislados, identificados y luego expresados.
Los enfoques integrados presentados en este trabajo
representan un paso importante hacia el desarrollo
de mapas metabólicos de la producción de aceites y
proveen un recurso valioso para definir moléculas
blanco para ingeniería genética o formación de aceites
esenciales. Además, el secuenciamiento
completo de los genomas de Arabidopsis y arroz,
permitirá contar con secuencias de miles de genes y
emplearlos en chips para el estudio de la expresión
coordinada de los genes, permitiendo desarrollar
estrategias para el mejoramiento de caracteres
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