27.07.2013 Views

PDF de l'activitat - Institut d'Estudis Catalans

PDF de l'activitat - Institut d'Estudis Catalans

PDF de l'activitat - Institut d'Estudis Catalans

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Disseny MBerlanga & RGuerrero<br />

RECAM 2009<br />

19-20 novEMbRE 2009<br />

http://scb.iec.cat/RECAM2009.htm<br />

Coordinadors:<br />

Jordi Urmeneta i Mercè Berlanga<br />

Secció <strong>de</strong> Microbiologia<br />

Societat Catalana <strong>de</strong> Biologia<br />

Filial <strong>de</strong> l´IEC<br />

<strong>Institut</strong> d’Estudis <strong>Catalans</strong><br />

C/ Carme, 47<br />

Barcelona


Unitat i diversitat en microbiologia-6<br />

19-20 novembre 2009<br />

RECAM 2009 — Reunió Científica Anual<br />

<strong>de</strong> la Secció <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la SCB<br />

Durant la dècada <strong>de</strong> 1970, Pere Babot i Boixeda, aleshores secretari general <strong>de</strong> la SCB, convocà unes reunions científiques<br />

anuals plenàries (RECAP) per fer participar en unes sessions <strong>de</strong> <strong>de</strong>bat i trobada científica el nombre més gran possible <strong>de</strong><br />

socis <strong>de</strong> la SCB, una Societat que s’anava fent cada cop més diversa i potent. La primera RECAP es féu el 1973 i la darrera<br />

el 1977; els treballs que s’hi <strong>de</strong>bateren es publicaren en els números IX al XIII <strong>de</strong>ls Col·loquis <strong>de</strong> la SCB. Passats els anys,<br />

la SCB ha crescut encara més en nombre <strong>de</strong> socis i enormement en el <strong>de</strong> camps <strong>de</strong> les ciències biològiques que abraça.<br />

Paral·lelament, un d’aquests camps, la microbiologia, també ha anat diversificant-se i creixent, tant en el nombre d’investigadors<br />

com en el <strong>de</strong> grups <strong>de</strong> treball i temes <strong>de</strong> recerca.<br />

Amb l’esperit d’aquelles reunions anuals, la Secció <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la SCB convoca aquesta trobada anual <strong>de</strong> microbiòlegs<br />

<strong>de</strong> molts diversos camps, la RECAM (Reunió Científica Anual <strong>de</strong> Microbiologia). Els principals objectius <strong>de</strong> la<br />

RECAM són <strong>de</strong>batre-hi alguns <strong>de</strong>ls recents avenços <strong>de</strong> la microbiologia, presentar i posar en contacte diversos grups <strong>de</strong>dicats<br />

a les ciències microbiològiques i promoure activitats <strong>de</strong> col·laboració entre laboratoris, centres <strong>de</strong> recerca i universitats.<br />

Aquesta reunió s’adreça als microbiòlegs d’universitats, centres <strong>de</strong> recerca i indústria, i també als ensenyants i altres professionals<br />

interessats pels avenços <strong>de</strong> la microbiologia, i als estudiants <strong>de</strong> les diverses branques <strong>de</strong> les ciències <strong>de</strong> la vida i <strong>de</strong> la<br />

salut que es plantegen <strong>de</strong>dicar-se a la recerca en microbiologia.<br />

Enguany, la RECAM es celebra el 19 i 20 <strong>de</strong> novembre <strong>de</strong> 2009.<br />

RECAM 2009 està coordinada per Jordi Urmeneta i Mercè Berlanga, <strong>de</strong>l Dept. <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la Facultat<br />

<strong>de</strong> Biologia, i <strong>de</strong>l Dept. <strong>de</strong> Microbiologia i Parasitologia Sanitàries, <strong>de</strong> la Facultat <strong>de</strong> Farmàcia, respectivament,<br />

<strong>de</strong> la Universitat <strong>de</strong> Barcelona. L'assistencia és gratuïta, però es recomana registrar-se previament (a<br />

qualsevol <strong>de</strong>ls dos correus electrònics següents: jurmeneta@ub.edu o mberlanga@ub.edu). Po<strong>de</strong>u trobar<br />

més informació a:<br />

http://scb.iec.cat/RECAM2009.htm<br />

Lloc i horari:<br />

Sala Nicolau d’Olwer, IEC. C/ Carme, 47. 08001 Barcelona<br />

19 <strong>de</strong> novembre, <strong>de</strong> 16 a 18.30 h<br />

20 <strong>de</strong> novembre, <strong>de</strong> 10 a 13.30 h i <strong>de</strong> 16 a 18.30 h<br />

La imatge <strong>de</strong>l fons <strong>de</strong> l’altra pàgina correspon a la capella <strong>de</strong> la Casa <strong>de</strong> Convalescència, seu <strong>de</strong> l’IEC. També s’hi inclouen<br />

micrografies coloreja<strong>de</strong>s artificialment <strong>de</strong> representants <strong>de</strong>ls quatre grans grups <strong>de</strong> microorganismes (virus, procariotes, fongs i protists):<br />

El virus és el bacteriòfag T2, unit a un fragment <strong>de</strong> la paret cel·lular d’un bacteri (200.000x) (Photo Researchers, Inc.);<br />

Diversitat <strong>de</strong> la microbiota intestinal humana (foto <strong>de</strong> la portada <strong>de</strong>l llibre Microorganismes, d’Editorial Reverté). Candida albicans,<br />

llevat en el que s’observa la formació <strong>de</strong> gemmes (Photo Researchers, Inc.). Trichomonas vaginalis és un protist que es transmet<br />

sexualment; la major part <strong>de</strong> les persones infecta<strong>de</strong>s són assimptomàtiques (9000x) (Photo Researchers, Inc.).


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

UNITAT I DIVERSITAT EN MICROBIOLOGIA-6<br />

RECAM 2009, 19–20 novembre 2009<br />

Secció <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la Societat Catalana <strong>de</strong> Biologia<br />

Sala Nicolau d’Olwer, <strong>Institut</strong> d’Estudis <strong>Catalans</strong>, c/ Carme 47, 08001 Barcelona<br />

Coordinadors:<br />

Jordi Urmeneta (jurmeneta@ub.edu)<br />

Mercè Berlanga (mberlanga@ub.edu)<br />

Els principals objectius <strong>de</strong> les RECAM (Reunió Científica Anual <strong>de</strong> Microbiologia) són <strong>de</strong>batre-hi<br />

alguns <strong>de</strong>ls recents avenços <strong>de</strong> la microbiologia, presentar i posar en contacte diversos<br />

grups <strong>de</strong>dicats a les ciències microbiològiques i promoure activitats <strong>de</strong> col·laboració entre laboratoris,<br />

centres <strong>de</strong> recerca i universitats. Aquesta reunió s’adreça als microbiòlegs d’universitats,<br />

centres <strong>de</strong> recerca i indústria, i també als ensenyants i altres professionals interessats pels avenços<br />

<strong>de</strong> la microbiologia, i als estudiants <strong>de</strong> les diverses branques <strong>de</strong> les ciències <strong>de</strong> la vida i <strong>de</strong> la<br />

salut que es plantegen <strong>de</strong>dicar-se a la recerca en microbiologia. La RECAM 2009 reuneix<br />

microbiòlegs <strong>de</strong> la Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona, la Universitat <strong>de</strong> Barcelona, la Universitat<br />

<strong>de</strong> Girona, la Universitat <strong>de</strong> Lleida, la Universitat Ramon Llull i l’<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l<br />

Mar (ICM-CSIC).<br />

PROGRAMA CIENTÍFIC<br />

Dijous, 19 DE NOVEMBRE<br />

Coordinadora: Montserrat Agut, IQS, URL<br />

16.00−16.45 Com responen els llevats a l’estrès ambiental? Tècniques «-òmiques» en<br />

Saccharomyces cerevisiae<br />

Enric Herrero, Facultat <strong>de</strong> Medicina, Universitat <strong>de</strong> Lleida<br />

16.45−17.15 Pausa<br />

17.15−18.00 Productes vegetals frescos processats mínimament. Qualitat microbiològica i<br />

tecnologies <strong>de</strong> bioconservació<br />

Emili Montesinos, <strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Tecnologia Agroalimentària, Universitat <strong>de</strong><br />

Girona<br />

1


Divendres, 20 DE NOVEMBRE<br />

SESSIÓ DEL MATÍ<br />

Coordinador: Jordi Urmeneta, UB<br />

RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

10.00−10.45 Procarionts a les profunditats marines: abundància, activitat, diversitat i funció<br />

ecològica <strong>de</strong>ls protagonistes principals <strong>de</strong> la biogeoquímica marina<br />

Josep M. Gasol, <strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l Mar, CSIC<br />

10.45−11.30 Diversitat d’arqueus i contribució a la fixació fosca <strong>de</strong> carboni en llacunes<br />

estratifica<strong>de</strong>s<br />

Marc Llirós Dupré, Facultat <strong>de</strong> Ciències, Universitat <strong>de</strong> Girona<br />

11.30−12.00 Pausa<br />

Coordinadora: Mercè Berlanga, UB<br />

12.00−12.45 Río Tinto com a un anàleg terrestre <strong>de</strong> Mart<br />

Ricard Amils, Universidad Autónoma <strong>de</strong> Madrid i Centro <strong>de</strong> Astrobiología<br />

(INTA-CSIC).<br />

12.45−13.30 Mil·liamperes i microorganismes: producció d’electricitat amb bacteris<br />

Jordi Mas Gordi, Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />

SESSIÓ DE LA TARDA<br />

Coordinador: Ricard Amils, CAB i UAM<br />

16.00−16.45 Què té a veure el sistema SOS amb els integrons?<br />

Susana Campoy, Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />

16.45−17.15 Pausa<br />

17.15−18.00 El nou Grau <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la UAB<br />

Montserrat Llagostera, Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong><br />

Barcelona<br />

18.00–18.30 Discussió general: Conclusions i perspectives<br />

2


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

RESUMS<br />

COM RESPONEN ELS LLEVATS A L’ESTRÈS AMBIENTAL? TÈCNIQUES<br />

«-ÒMIQUES» EN Saccharomyces cerevisiae<br />

Enric Herrero<br />

Departament <strong>de</strong> Ciències Mèdiques Bàsiques, IRBLleida, Universitat <strong>de</strong> Lleida<br />

enric.herrero@cmb.udl.cat<br />

Les cèl·lules responen als canvis ambientals modificant els nivells d’expressió <strong>de</strong> diverses<br />

proteïnes per tal d’afavorir una adaptació a<strong>de</strong>quada a la nova situació. Quan aquests canvis son<br />

ràpids, parlem d’una situació d’«estrès ambiental» i, lògicament, la resposta també ha <strong>de</strong> ser<br />

immediata. La regulació <strong>de</strong> la resposta pot produir-se a diversos nivells, principalment: (i)<br />

modificant els nivells d’RNA missatger (mRNA) d’un subgrup <strong>de</strong> gens, (ii) modificant la<br />

capacitat <strong>de</strong> traducció d’una subpoblació <strong>de</strong> molècules <strong>de</strong> mRNA, o (iii) modificant l’estabilitat<br />

<strong>de</strong> diverses proteïnes. Aquests nivells <strong>de</strong> resposta no són incompatibles, i po<strong>de</strong>n donar-se<br />

simultàniament. Al llarg <strong>de</strong> la darrera dècada, el llevat Saccharomyces cerevisiae ha estat<br />

l’organisme més utilitzat per a estudiar la resposta a diversos tipus d’estrès ambiental (tèrmic,<br />

oxidatiu, osmòtic, nutricional, per agents químics, etc.), encara que aquests estudis s’han limitat<br />

a analitzar els nivells <strong>de</strong>ls mRNA <strong>de</strong> tots els gens <strong>de</strong> la cèl·lula en la situació d’estrès<br />

comparant-los amb una situació control. Aquest enfocament té la limitació experimental <strong>de</strong> no<br />

consi<strong>de</strong>rar que els nivells <strong>de</strong> mRNA estan <strong>de</strong>terminats per dos factors in<strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nts l’un <strong>de</strong><br />

l’altre: la velocitat <strong>de</strong> transcripció <strong>de</strong>terminada per l’activitat <strong>de</strong> diversos factors<br />

transcripcionals, i la velocitat <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació d’aquestes mateixes molècules <strong>de</strong> mRNA. Aquesta<br />

velocitat <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació està <strong>de</strong>terminada per una maquinària complexa dins <strong>de</strong> la cèl·lula, que<br />

només recentment s’ha començat a caracteritzar. En una situació dinàmica, com es la resposta a<br />

un estrès ambiental, la velocitat <strong>de</strong> síntesi i <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació <strong>de</strong>ls mRNA pot variar <strong>de</strong> manera<br />

separada i específica per a diversos grups funcionals <strong>de</strong> gens. Nosaltres hem aplicat la tècnica<br />

<strong>de</strong>l Genomic Run-On (GRO) per tal <strong>de</strong> discriminar entre la velocitat <strong>de</strong> síntesi i <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació<br />

<strong>de</strong> cadascun <strong>de</strong>ls mRNA <strong>de</strong> S. cerevisiae en resposta a l’estrès tèrmic i a l’estrès oxidatiu.<br />

Aquesta tècnica permet <strong>de</strong>terminar experimentalment i <strong>de</strong> manera simultània els nivells i la<br />

velocitat <strong>de</strong> transcripció <strong>de</strong>ls mRNA i, per tant, <strong>de</strong>duir matemàticament la velocitat <strong>de</strong><br />

<strong>de</strong>gradació. Mitjançant la tècnica GRO hem pogut <strong>de</strong>terminar que certes categories funcionals<br />

<strong>de</strong> gens tenen una mateixa resposta immediata a l’estrès tèrmic i a l’estrès oxidatiu; en són un<br />

exemple els gens que codifiquen proteïnes ribosòmiques (responen reprimint-se), o <strong>de</strong> la<br />

maquinària <strong>de</strong>l proteasoma (responen induint-se). En canvi, altres categories <strong>de</strong> gens tenen<br />

respostes específiques per a cada tipus d’estrès, com són els que codifiquen xaperones o<br />

oxidoreductases. En aquestes respostes, els canvis en l’estabilitat <strong>de</strong>ls mRNA modulen els<br />

canvis en la velocitat <strong>de</strong> transcripció, per tal <strong>de</strong> fixar uns nivells <strong>de</strong> mRNA a<strong>de</strong>quats per a la<br />

situació canviant.<br />

Enric Herrero (Barcelona, 1952). Doctor en Biologia per la UAB. Catedràtic <strong>de</strong> Microbiologia<br />

<strong>de</strong> la Universitat <strong>de</strong> Lleida i membre <strong>de</strong> l’<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Recerca Biomèdica <strong>de</strong> Lleida. Ha treballat<br />

a les Universitats Autònoma <strong>de</strong> Barcelona, Leicester (Anglaterra) i València, sempre dins <strong>de</strong>l<br />

camp <strong>de</strong> la genètica i la biologia molecular <strong>de</strong>ls microorganismes. Va participar en el projecte<br />

<strong>de</strong> seqüenciació <strong>de</strong>l genoma <strong>de</strong>l llevat, finalitzat l’any 1996, i també en el <strong>de</strong> l’anàlisi funcional<br />

d’aquest mateix genoma, dins d’un consorci d’un centenar <strong>de</strong> laboratoris europeus. Actualment,<br />

el seu interès es centra en l’estudi <strong>de</strong> la regulació <strong>de</strong> la resposta <strong>de</strong>l llevat als diversos tipus<br />

d’estrès ambiental, i, particularment, <strong>de</strong>ls mecanismes <strong>de</strong> reparació <strong>de</strong>l dany oxidatiu sobre les<br />

proteïnes.<br />

3


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

PRODUCTES VEGETALS FRESCOS PROCESSATS MÍNIMAMENT. QUALITAT<br />

MICROBIOLÒGICA I TECNOLOGIES DE BIOCONSERVACIÓ<br />

Emili Montesinos<br />

<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Tecnologia Agroalimentària, Universitat <strong>de</strong> Girona<br />

emilio.montesinos@udg.es<br />

L’escenari actual <strong>de</strong> la seguretat <strong>de</strong>ls aliments està condicionat per la implementació <strong>de</strong> noves<br />

tecnologies <strong>de</strong> conservació suaus i <strong>de</strong> processament mínim (<strong>de</strong> quarta gamma). L’aplicació<br />

d’aquestes tecnologies és imprescindible en els nous aliments, ateses les restriccions en el perfil<br />

toxicològic <strong>de</strong>ls actuals conservadors químics i la prohibició o limitació dràstica <strong>de</strong>ls antibiòtics,<br />

que tenen com a conseqüència l’aparició <strong>de</strong> nous patògens emergents o la potenciació d’alguns<br />

ja existents. En aquest context, els bioconservadors sorgeixen amb grans expectatives, atès que<br />

es tracta <strong>de</strong> microorganismes segurs que provenen <strong>de</strong>ls aliments, <strong>de</strong> compostos químics d’origen<br />

natural (pèptids i proteïnes antimicrobians, extractes vegetals, enzims), o <strong>de</strong> compostos sintètics<br />

basats en estructures naturals, encara que menys tòxics i més eficaços, com ara els pèptids<br />

antimicrobians. Entre els bioconservadors, els bacteris làctics presenten grans avantatges<br />

d’aplicació, sobretot en productes carnis crus curats, en fruites i verdures fresques i, en especial,<br />

en productes <strong>de</strong> quarta gamma, com també en mèto<strong>de</strong>s per a reduir la càrrega microbiana <strong>de</strong><br />

patògens en subproductes alimentaris abans <strong>de</strong>l seu processament. El nostre laboratori ha<br />

realitzat un estudi extens <strong>de</strong> la qualitat microbiològica <strong>de</strong> fruites i verdures fresques, i <strong>de</strong><br />

productes processats mínimament, <strong>de</strong>tectant-hi nivells baixos, però significatius, <strong>de</strong> Salmonella<br />

sp., Escherichia coli i Listeria spp., incloent-hi L. monocytogenes. Per això vàrem en<strong>de</strong>gar un<br />

projecte consistent a <strong>de</strong>senvolupar aplicacions, com a bioconservadors, <strong>de</strong> bacteris làctics<br />

(BAL) obtinguts d’aquests productes. Els BAL eren abundants en el productes <strong>de</strong> quarta<br />

gamma, en especial en llavors germina<strong>de</strong>s. Es van obtenir diverses soques productores <strong>de</strong><br />

bacteriocines, sobretot <strong>de</strong> Leuconostoc, Lactobacillus i Weissella, amb una activitat significativa<br />

per al control <strong>de</strong> L. monocytogenes en pomes i en enciam processat. Altres soques han estat<br />

efectives en la inhibició <strong>de</strong> podridures fúngiques en postcollita causa<strong>de</strong>s per Penicillium<br />

expansum.<br />

Emili Montesinos. Catedràtic <strong>de</strong> Microbiologia-Patologia Vegetal <strong>de</strong> la Universitat <strong>de</strong> Girona,<br />

expresi<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> la Sociedad Española <strong>de</strong> Fitopatología. Des <strong>de</strong> fa vint-i-cinc anys investiga en<br />

diversos camps <strong>de</strong> la microbiologia aplicada, en especial en microbiologia <strong>de</strong> plantes. La principal<br />

tasca <strong>de</strong> recerca se centra en el control <strong>de</strong> malalties <strong>de</strong>ls conreus i en el <strong>de</strong>senvolupament<br />

biotecnològic <strong>de</strong> nous plaguici<strong>de</strong>s i bioconservadors que no tinguin els efectes perjudicials <strong>de</strong>ls<br />

plaguici<strong>de</strong>s químics convencionals. La seva tasca ha estat reconeguda internacionalment i<br />

participa com a expert <strong>de</strong> forma regular en congressos i conferències. És assessor en diversos<br />

comitès científics catalans, estatals i internacionals, i membre <strong>de</strong> representacions nacionals i<br />

internacionals en el camp <strong>de</strong> la sanitat vegetal. Ha portat a terme una extensa tasca <strong>de</strong> formació<br />

d’investigadors, amb la direcció <strong>de</strong> tesis doctorals, projectes <strong>de</strong> recerca i màsters. La seva producció<br />

científica amb 120 publicacions està acreditada internacionalment.<br />

4


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

PROCARIONTS A LES PROFUNDITATS MARINES: ABUNDÀNCIA, ACTIVITAT,<br />

DIVERSITAT I FUNCIÓ ECOLÒGICA DELS PROTAGONISTES PRINCIPALS DE<br />

LA BIOGEOQUÍMICA MARINA<br />

Josep M. Gasol<br />

<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l Mar, CSIC<br />

pepgasol@icm.csic.es<br />

Les profunditats marines constitueixen indrets clau <strong>de</strong> la biosfera per al cicle global <strong>de</strong>l carboni:<br />

allà es produeix la remineralització <strong>de</strong> la matèria orgànica que arriba al mar <strong>de</strong>s <strong>de</strong>ls continents,<br />

o que se sintetitza per producció primària al propi mar, i allà pot acumular-se durant llargs<br />

perío<strong>de</strong>s <strong>de</strong> temps, quedant enterrada als sediments si els procarionts no la <strong>de</strong>gra<strong>de</strong>n. Les<br />

profunditats marines contenen la major quantitat <strong>de</strong> microorganismes <strong>de</strong>ls ecosistemes aquàtics,<br />

al voltant <strong>de</strong>l 75% <strong>de</strong> la biomassa i el 50% <strong>de</strong> la producció bacteriana <strong>de</strong> tot el mar. L’aplicació<br />

<strong>de</strong> la genòmica en microbiologia marina ens explica que les profunditats marines contenen un<br />

enorme i dinàmic magatzem <strong>de</strong> variabilitat genètica <strong>de</strong>s <strong>de</strong>l punt <strong>de</strong> vista filogenètic i funcional.<br />

Les comunitats microbianes són molt diverses i estan domina<strong>de</strong>s per ecotips generalistes amb<br />

genomes <strong>de</strong> mida gran, que contenen una extensa varietat <strong>de</strong> gens funcionals. L’expressió<br />

d’aquests gens té un impacte important sobre la biogeoquímica <strong>de</strong> les masses d’aigua profun<strong>de</strong>s.<br />

Els procarionts expressen una elevada activitat enzimàtica extracel·lular a nivell individual,<br />

comparable, o més gran, que la que es dóna en la superfície <strong>de</strong>l mar, amb un elevat percentatge<br />

d’ectoenzims dissolts, la qual cosa probablement indica un mo<strong>de</strong> <strong>de</strong> vida que <strong>de</strong>pèn <strong>de</strong> l’associació<br />

estreta amb partícules o col·loids. A més a més, la quimiotròfia pot representar una font<br />

addicional <strong>de</strong> producció primària i un embornal <strong>de</strong> CO2, mentre que noves vies metabòliques,<br />

com ara l’oxidació anaeròbica <strong>de</strong> l’amoni, o l’oxidació <strong>de</strong> metà, po<strong>de</strong>n tenir papers importants<br />

en els cicles biogeoquímics marins. Els avenços recents en microbiologia marina qüestionen el<br />

paradigma d’una xarxa tròfica estable en estructura i funció a les profunditats marines, amb una<br />

mineralització molt lenta <strong>de</strong> la matèria orgànica. Encara coneixem molt poc l’estructura i la<br />

dinàmica <strong>de</strong> les xarxes tròfiques <strong>de</strong> les profunditats marines, i <strong>de</strong>l paper <strong>de</strong>ls protists i <strong>de</strong>ls virus.<br />

Coneixem també molt poc la dinàmica <strong>de</strong> transformació <strong>de</strong> partícules, biòtiques i abiòtiques, i el<br />

<strong>de</strong>stí <strong>de</strong>l material exportat a les profunditats marines. Noves eines moleculars i mèto<strong>de</strong>s <strong>de</strong> mostratge<br />

ens permetran, en el futur, ampliar i estendre el nostre coneixement cap a aquest ecosistema<br />

fascinant i, bàsicament, inexplorat.<br />

Josep M. Gasol (Manresa, 1962) Professor d’Investigació a l’<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l Mar, <strong>de</strong>l<br />

CSIC. Treballa en ecologia microbiana d’ambients planctònics: durant la tesi, als llacs <strong>de</strong> la<br />

zona <strong>de</strong> Banyoles, <strong>de</strong>sprés als llacs temperats <strong>de</strong>l Canadà, i finalment en ambients marins. En<br />

els darrers anys i a més <strong>de</strong> coordinar els treballs a l’Observatori Microbià <strong>de</strong> la Badia <strong>de</strong> Blanes,<br />

s’ha tornat a interessar pels llacs tropicals, les llacunes poc profun<strong>de</strong>s tropicals i els ambients<br />

lacustres <strong>de</strong> l’Antàrtida i <strong>de</strong> l’alta muntanya. En tots aquests indrets s’ha interessat per l’estructura<br />

<strong>de</strong> les xarxes tròfiques microbianes, pels mecanismes que la <strong>de</strong>terminen, i pels factors que<br />

regulen la diversitat i la funció d’aquestes comunitats. Entre d’altres, <strong>de</strong>staca la seva recerca per<br />

a la utilització <strong>de</strong> la citometria <strong>de</strong> flux en estudis d’ecologia microbiana, com una <strong>de</strong> les tècniques<br />

d’anàlisi a nivell <strong>de</strong> microorganisme individual amb les quals es treballa al seu laboratori.<br />

Actualment coordina un grup amb tres investigadors postdoctorals i cinc estudiants <strong>de</strong> doctorat.<br />

Ha publicat més <strong>de</strong> 110 treballs en revistes internacionals, alguns capítols <strong>de</strong> llibre i alguns treballs<br />

<strong>de</strong> divulgació. És membre <strong>de</strong> comitès editorials <strong>de</strong> tres revistes, i és també membre <strong>de</strong><br />

diversos comitès internacionals, però no es perd mai l’oportunitat d’anar a visitar escoles i <strong>de</strong><br />

participar en tasques <strong>de</strong> divulgació com ara les <strong>de</strong>l grup Lacenet (www.lacenet.org).<br />

5


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

DIVERSITAT D’ARQUEUS I CONTRIBUCIÓ A LA FIXACIÓ FOSCA DE CARBONI<br />

EN LLACUNES ESTRATIFICADES<br />

Marc Llirós Dupré<br />

Facultat <strong>de</strong> Ciències, Universitat <strong>de</strong> Girona<br />

marc.lliros@udg.es<br />

Els arqueus són components habitual <strong>de</strong> la comunitat planctònica procariota <strong>de</strong>ls ecosistemes<br />

aquàtics. L’abundància i ubiqüitat <strong>de</strong>ls Crenarchaeota no termòfils al mar, juntament amb el recent<br />

<strong>de</strong>scobriment <strong>de</strong> la seva capacitat <strong>de</strong> fixar carboni a les fosques utilitzant amoni com a font<br />

d’energia, han fet augmentar l’interès en el seu estudi, atès l’impacte que la seva activitat podria tenir<br />

en els cicles biogeoquímics, en especial <strong>de</strong>l nitrogen i el carboni. En els darrers anys, el nostre grup<br />

ha analitzat diverses llacunes estratifica<strong>de</strong>s <strong>de</strong>l sistema càrstic <strong>de</strong> Banyoles (El Pla <strong>de</strong> l’Estany)<br />

caracteritza<strong>de</strong>s per un cicle <strong>de</strong>l sofre molt actiu, anòxia estacional i un estat tròfic que va <strong>de</strong>s <strong>de</strong><br />

la mesotròfia (estanyol d’El Vilar), fins a l’eutròfia (estanyol <strong>de</strong> Can Coromina). El grup <strong>de</strong>ls<br />

Crenarchaeota conegut com a MCG (Miscellaneous Crenarchaeotic Group) és el més abundant<br />

en els hipolimnis anòxics d’ambdues llacunes (63% al Vilar i 50% a Can Coromina), tot i que<br />

també s’hi han <strong>de</strong>tectat altres grups filogenètics relacionats amb els Euryarchaeota. Malgrat la<br />

gran riquesa filogenètica observada, no s’han <strong>de</strong>tectat filotips d’Archaea relacionats amb<br />

Crenarchaeota oxidadors d’amoni, cosa que indica que aquestes llacunes estratifica<strong>de</strong>s no són<br />

ambients idonis per al <strong>de</strong>senvolupament d’arqueus nitrificants (grups Marine I.1a i Soil I.1b).<br />

D’altra banda, l’abundància d’arqueus a Can Coromina variava entre l’1 i el 7% <strong>de</strong>l total <strong>de</strong><br />

cèl·lules tenyi<strong>de</strong>s amb DAPI. Per tal d’analitzar la fracció activa <strong>de</strong> la comunitat planctònica<br />

<strong>de</strong>ls arqueus, es varen realitzar incubacions in situ amb bicarbonat radioactiu. Amb aquesta<br />

tècnica es va posar <strong>de</strong> manifest la important contribució <strong>de</strong>ls processos <strong>de</strong> fixació fosca <strong>de</strong> la<br />

llacuna, i que una petita fracció <strong>de</strong>l total d’arqueus (10%) incorporava carboni a les fosques.<br />

Aquests resultats suggereixen que els llinatges d’arqueus predominants en aquests ambients<br />

lacustres sulfurosos eutròfics podrien ser microorganismes heteròtrofs anaerobis.<br />

Marc Llirós (Barcelona, 1974). Llicenciat en Biologia i Màster en Microbiologia per la UAB,<br />

on va estudiar els tapissos microbians i el seu possible paper bioremediador <strong>de</strong>ls vessaments <strong>de</strong><br />

petroli. Actualment està finalitzant la tesi doctoral a la Universitat <strong>de</strong> Girona, investigant les<br />

poblacions mesòfiles d’arqueus en ecosistemes lacustres estratificats d’arreu <strong>de</strong>l món. És<br />

professor <strong>de</strong> l’Àrea <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la mateixa universitat. És autor <strong>de</strong> diferents articles en<br />

revistes internacionals, ha participat en congressos, tant nacionals com internacionals, i en<br />

activitats <strong>de</strong> divulgació científica.<br />

6


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

RÍO TINTO COM A ANÀLEG TERRESTRE DE MART<br />

Ricard Amils<br />

Universidad Autónoma <strong>de</strong> Madrid i Centro <strong>de</strong> Astrobiología (INTA-CSIC)<br />

ricardo.amils@uam.es<br />

En astrobiologia, l’estudi d’anàlegs terrestres es consi<strong>de</strong>ra fonamental per a avaluar la<br />

possibilitat que la vida pogués <strong>de</strong>senvolupar-se fora <strong>de</strong> la Terra. Atesa la seva proximitat, Mart<br />

ha estat <strong>de</strong>s <strong>de</strong> fa anys un candidat excel·lent per a explorar si hi ha hagut, o hi ha, vida en el<br />

planeta vermell. D’entre els diferents anàlegs terrestres <strong>de</strong> Mart, Río Tinto ocupa un lloc<br />

privilegiat, ja que la mineralogia i la geoquímica <strong>de</strong>l planeta vermell <strong>de</strong>tectada en les recents<br />

missions d’exploració són similars a les observa<strong>de</strong>s en la conca <strong>de</strong> Río Tinto. En el cas <strong>de</strong> Río<br />

Tinto, la constitució geoquímica és <strong>de</strong>guda a l’activitat <strong>de</strong> microorganismes quimiolitoautòtrofs<br />

que operen en el subsòl <strong>de</strong> la Faixa Pirítica Ibèrica, on es dóna la major concentració <strong>de</strong> sulfurs<br />

metàl·lics <strong>de</strong>l món. En aquesta comunicació analitzarem les possibilitats <strong>de</strong> l’existència <strong>de</strong> vida<br />

a Mart mitjançant da<strong>de</strong>s genera<strong>de</strong>s en l’exploració <strong>de</strong> la geomicrobiologia <strong>de</strong> la conca <strong>de</strong>l Tío<br />

Tinto.<br />

Ricard Amils (Barcelona, 1947). Llicenciat en Ciències Químiques per la Universitat <strong>de</strong> Barcelona,<br />

1969. Doctor en Ciències per la Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona, 1973. Catedràtic <strong>de</strong><br />

Microbiologia <strong>de</strong>l Departamento <strong>de</strong> Biología Molecular, Centro <strong>de</strong> Biología Molecular, Universidad<br />

Autónoma <strong>de</strong> Madrid, i investigador associat <strong>de</strong>l Centro <strong>de</strong> Astrobiología (INTA-CSIC).<br />

Ha estat investigador associat a la Dartmouth Medical School, USA, i a la Columbia University,<br />

USA. Té més <strong>de</strong> 220 publicacions, entre articles en revistes científiques especialitza<strong>de</strong>s i capítols<br />

<strong>de</strong> llibres. Les seves principals línees <strong>de</strong> recerca han estat l’evolució funcional <strong>de</strong>l ribosoma,<br />

la reconstitució <strong>de</strong> ribosomes, la biomineria, la bioremediació i el segrestament <strong>de</strong> metalls<br />

pesants, l’ecologia microbiana en ambientes extrems i l’astrobiologia.<br />

7


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

MIL·LIAMPERES I MICROORGANISMES: PRODUCCIÓ D’ELECTRICITAT AMB<br />

BACTERIS<br />

Jordi Mas Gordi<br />

Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />

jordi.mas@uab.es<br />

Una pila microbiana <strong>de</strong> combustible és un dispositiu capaç <strong>de</strong> convertir l’energia química<br />

present en compostos orgànics en energia elèctrica, mitjançant l’ús <strong>de</strong> microorganismes com a<br />

catalitzadors. El disseny més convencional <strong>de</strong> les piles microbianes <strong>de</strong> combustible consta <strong>de</strong><br />

dos elèctro<strong>de</strong>s, un àno<strong>de</strong> i un càto<strong>de</strong>, situats en dos compartiments in<strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nts separats per<br />

una membrana permeable als protons. En el compartiment <strong>de</strong> l’àno<strong>de</strong>, els microorganismes<br />

oxi<strong>de</strong>n compostos orgànics (glucosa, acetat, etc.) fins a CO2, i generen protons (H + ) i electrons<br />

(e – ) en el procés. En condicions aeròbiques normals, els electrons proce<strong>de</strong>nts d’aquesta oxidació<br />

són transferits a l’oxigen, que actua com a acceptor final d’electrons. En una pila microbiana <strong>de</strong><br />

combustible, a causa <strong>de</strong> l’absència d’oxigen, els microorganismes es veuen obligats a transferir<br />

els electrons a l’àno<strong>de</strong>, que actua, en aquest cas, com a acceptor extern d’electrons. Els electrons<br />

circulen <strong>de</strong> l’àno<strong>de</strong> al càto<strong>de</strong> i d’aquesta manera donen energia a un circuit extern. En el<br />

compartiment <strong>de</strong>l càto<strong>de</strong>, els electrons que hi arriben a través <strong>de</strong>l circuit són utilitzats juntament<br />

amb protons <strong>de</strong>l medi per reduir oxigen fins a aigua. Aquest tipus <strong>de</strong> dispositiu es pot fer operar<br />

a diferents escales, que permeten diferents aplicacions, que van <strong>de</strong>s <strong>de</strong>l tractament d’aigües<br />

residuals fins al <strong>de</strong>senvolupament <strong>de</strong> microsensors <strong>de</strong> toxicitat.<br />

Jordi Mas Gordi (Castellbell i el Vilar, 1960). Professor titular <strong>de</strong> Microbiologia a la UAB. La<br />

seva recerca es va iniciar amb l’estudi <strong>de</strong> l’ecologia <strong>de</strong>ls bacteris fotòtrofs <strong>de</strong>ls sofre. Ha<br />

investigat la utilització <strong>de</strong> biofilms d’aquests microorganismes en reactors per al tractament<br />

d’efluents contaminants i, més recentment, la seva recerca s’ha centrat en el camp <strong>de</strong> la<br />

microbiologia ambiental aplicada, <strong>de</strong>senvolupant sistemes per a la <strong>de</strong>tecció i seguiment en<br />

temps real <strong>de</strong> la presència i l’activitat <strong>de</strong> microorganismes en aigües. Al mateix temps, ha<br />

explorat <strong>de</strong> forma interdisciplinària diferents metodologies avança<strong>de</strong>s, com ara el <strong>de</strong>senvolupament<br />

<strong>de</strong> microxips per a la mesura <strong>de</strong> biomassa bacteriana en suspensió i per a l’estudi <strong>de</strong><br />

l’establiment <strong>de</strong> biofilms microbians sobre superfícies.<br />

8


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

QUÈ TÉ A VEURE EL SISTEMA SOS AMB ELS INTEGRONS?<br />

Susana Campoy*<br />

Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />

susana.campoy@gmail.com<br />

El sistema <strong>de</strong> reparació d’emergència, o sistema SOS, es <strong>de</strong>fineix clàssicament com una<br />

resposta global davant la presència <strong>de</strong> lesions en el DNA, que té com a objectiu final la<br />

superació <strong>de</strong> les lesions i la supervivència <strong>de</strong> la cèl·lula. Els estudis <strong>de</strong> la composició <strong>de</strong> la xarxa<br />

gènica d’aquest sistema han permès <strong>de</strong>terminar que no només engloba gens vinculats amb la<br />

reparació (com ara polimerases <strong>de</strong> baixa fi<strong>de</strong>litat <strong>de</strong> còpia, helicases, gens <strong>de</strong> reparació per<br />

escissió <strong>de</strong> nucleòtid o recombinases), sinó que també inclou, entre d’altres, toxines, repressors<br />

<strong>de</strong>l cicle lític <strong>de</strong> bacteriòfags, gens vinculats amb l’empaquetament d’illes <strong>de</strong> patogenicitat o<br />

mecanismes <strong>de</strong> resistència antibiòtica. L’aparició d’aquestes noves da<strong>de</strong>s ha ampliat la visió <strong>de</strong>l<br />

sistema SOS, associant aquesta resposta gènica a les situacions d’estrés a les quals s’enfronta la<br />

cèl·lula. Els integrons són elements genètics capaços d’adquirir i d’expressar gens que no tenen<br />

promotor i que, en molts casos, codifiquen resistències a antibiòtics. Una característica que<br />

<strong>de</strong>fineix els integrons és que presenten, en la seva estructura, el gen int, el qual codifica un<br />

enzim, anomenat integrasa, encarregat d’incorporar o d’escindir els gens que formen part <strong>de</strong><br />

l’integró. Recentment, el nostre grup ha <strong>de</strong>terminat que aquestes integrases formen part <strong>de</strong>l<br />

sistema SOS i que incrementen la seva expressió quan les condicions ambientals activen aquest<br />

sistema <strong>de</strong> reparació d’emergència. Atès que molts antimicrobians tenen la capacitat d’induir la<br />

resposta SOS, és necessària una reflexió sobre l’ús d’aquests compostos per tal <strong>de</strong> controlar i<br />

d’evitar l’aparició i dispersió <strong>de</strong> mecanismes <strong>de</strong> resistència antimicrobiana entre diferents<br />

microorganismes.<br />

*Han participat en el treball Neus Sánchez-Alberola, Ivan Erill, Pilar Cortés, Montserrat Llagostera<br />

i Jordi Barbé<br />

Susana Campoy. Llicenciada en Ciències Biològiques (1997) i doctora en Ciències Biològiques<br />

(2002) per la UAB. De 2003 fins a 2008 va ser investigadora adjunta <strong>de</strong> l’IRTA en el Centre<br />

<strong>de</strong> Recerca en Sanitat Animal, amb una beca postdoctoral INIA. Des <strong>de</strong> <strong>de</strong>sembre <strong>de</strong> 2008,<br />

és professora agregada <strong>de</strong>l Departament <strong>de</strong> Genètica i <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la UAB, on treballa<br />

dins <strong>de</strong>l grup <strong>de</strong> Microbiologia Molecular. Les seves línees d’investigació són l’estudi <strong>de</strong><br />

factors <strong>de</strong> virulència en bacteris patògens, l’obtenció <strong>de</strong> vacunes, els biosensors, l’estudi <strong>de</strong>ls<br />

mecanismes moleculars <strong>de</strong> regulació <strong>de</strong> l’expressió gènica relacionats amb l’homeòstasi <strong>de</strong><br />

cations divalents, o amb la reparació <strong>de</strong>l DNA. Ha publicat a Science, EMBO Reports, Analytical<br />

Chemistry, Molecular Microbiology, Nucleic Acid Research, Journal of Bacteriology,<br />

Microbiology i d’altres.<br />

9


RECAM2009<br />

Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />

EL NOU GRAU DE MICROBIOLOGIA A LA UAB<br />

Montserrat Llagostera<br />

Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />

Montserrat.Llagostera@uab.es<br />

L’avenç <strong>de</strong>l coneixement <strong>de</strong> les ciències biològiques en els darrers trenta anys ha conduït a la<br />

seva diversificació en disciplines ben diferencia<strong>de</strong>s i amb entitat pròpia, entre les quals <strong>de</strong>staca<br />

la microbiologia. Stanley Maloy i Moselio Schaechter ja van indicar en el 2006 (International<br />

Microbiology 9:1-7) que estem vivint «la Tercera Edat d’Or» <strong>de</strong> la microbiologia. Per tant,<br />

tenim el repte d’oferir una formació a<strong>de</strong>quada per a capacitar les properes generacions <strong>de</strong><br />

professionals <strong>de</strong> la microbiologia i el d’educar la població i els governants per a entendre el<br />

paper crucial <strong>de</strong> la nostra ciència en la salut humana i en l’economia. En aquest marc, <strong>de</strong>s <strong>de</strong> la<br />

Unitat <strong>de</strong> Microbiologia Campus <strong>de</strong> la UAB va sorgir la proposta d’elaborar un pla d’estudis per<br />

a oferir un Grau <strong>de</strong> Microbiologia, a l’igual que el que ja existeix en altres països, i tot aprofitant<br />

l’experiència d’aquesta Unitat en la docència que imparteix fa anys en l’especialitat <strong>de</strong> Microbiologia<br />

<strong>de</strong> la Llicenciatura <strong>de</strong> Biologia <strong>de</strong> la UAB. La proposta va tenir el suport <strong>de</strong> la Facultat<br />

<strong>de</strong> Biociències i <strong>de</strong> tots els altres estaments <strong>de</strong> la UAB, i, finalment, l’ANECA la va autoritzar.<br />

Així, el 14 <strong>de</strong> setembre d’enguany s’han iniciat els estudis conduents al primer Grau <strong>de</strong> Microbiologia<br />

<strong>de</strong> l’Estat Espanyol. Han començat els estudis 64 alumnes i la nota <strong>de</strong> tall per a l’admissió<br />

ha estat <strong>de</strong> 7,13.<br />

Montserrat Llagostera. Catedràtica <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la UAB i directora <strong>de</strong>l Departament<br />

<strong>de</strong> Genètica i <strong>de</strong> Microbiologia. Ha estat membre <strong>de</strong> diferents comissions per a l’elaboració <strong>de</strong><br />

plans d’estudis <strong>de</strong> diverses llicenciatures (Biologia, Bioquímica i Biotecnologia), va impulsar a<br />

la UAB la creació <strong>de</strong> l’especialitat <strong>de</strong> Microbiologia dins <strong>de</strong> la Llicenciatura <strong>de</strong> Biologia i<br />

recentment la <strong>de</strong>l grau <strong>de</strong> Microbiologia. Ha estat la coordinadora <strong>de</strong> la comissió que va<br />

elaborar el pla d’estudis d’aquest nou grau. La seva recerca s’ha centrat en l’estudi <strong>de</strong>ls<br />

mecanismes <strong>de</strong> mutagènesi i <strong>de</strong> reparació <strong>de</strong>l DNA en bacteris, <strong>de</strong> la resistència als antibiòtics,<br />

<strong>de</strong>ls mecanismes <strong>de</strong> captació <strong>de</strong> cations divalents i <strong>de</strong> les seves aplicacions en el disseny <strong>de</strong><br />

vacunes. En els darrers anys també ha treballat en l’aïllament <strong>de</strong> bacteriòfags i en les seves<br />

aplicacions per al control <strong>de</strong> la salmonel·losi. Ha publicat més <strong>de</strong> 60 articles en revistes internacionals<br />

i ha participat en nombrosos congressos nacionals i internacionals.<br />

10

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!