PDF de l'activitat - Institut d'Estudis Catalans
PDF de l'activitat - Institut d'Estudis Catalans
PDF de l'activitat - Institut d'Estudis Catalans
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Disseny MBerlanga & RGuerrero<br />
RECAM 2009<br />
19-20 novEMbRE 2009<br />
http://scb.iec.cat/RECAM2009.htm<br />
Coordinadors:<br />
Jordi Urmeneta i Mercè Berlanga<br />
Secció <strong>de</strong> Microbiologia<br />
Societat Catalana <strong>de</strong> Biologia<br />
Filial <strong>de</strong> l´IEC<br />
<strong>Institut</strong> d’Estudis <strong>Catalans</strong><br />
C/ Carme, 47<br />
Barcelona
Unitat i diversitat en microbiologia-6<br />
19-20 novembre 2009<br />
RECAM 2009 — Reunió Científica Anual<br />
<strong>de</strong> la Secció <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la SCB<br />
Durant la dècada <strong>de</strong> 1970, Pere Babot i Boixeda, aleshores secretari general <strong>de</strong> la SCB, convocà unes reunions científiques<br />
anuals plenàries (RECAP) per fer participar en unes sessions <strong>de</strong> <strong>de</strong>bat i trobada científica el nombre més gran possible <strong>de</strong><br />
socis <strong>de</strong> la SCB, una Societat que s’anava fent cada cop més diversa i potent. La primera RECAP es féu el 1973 i la darrera<br />
el 1977; els treballs que s’hi <strong>de</strong>bateren es publicaren en els números IX al XIII <strong>de</strong>ls Col·loquis <strong>de</strong> la SCB. Passats els anys,<br />
la SCB ha crescut encara més en nombre <strong>de</strong> socis i enormement en el <strong>de</strong> camps <strong>de</strong> les ciències biològiques que abraça.<br />
Paral·lelament, un d’aquests camps, la microbiologia, també ha anat diversificant-se i creixent, tant en el nombre d’investigadors<br />
com en el <strong>de</strong> grups <strong>de</strong> treball i temes <strong>de</strong> recerca.<br />
Amb l’esperit d’aquelles reunions anuals, la Secció <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la SCB convoca aquesta trobada anual <strong>de</strong> microbiòlegs<br />
<strong>de</strong> molts diversos camps, la RECAM (Reunió Científica Anual <strong>de</strong> Microbiologia). Els principals objectius <strong>de</strong> la<br />
RECAM són <strong>de</strong>batre-hi alguns <strong>de</strong>ls recents avenços <strong>de</strong> la microbiologia, presentar i posar en contacte diversos grups <strong>de</strong>dicats<br />
a les ciències microbiològiques i promoure activitats <strong>de</strong> col·laboració entre laboratoris, centres <strong>de</strong> recerca i universitats.<br />
Aquesta reunió s’adreça als microbiòlegs d’universitats, centres <strong>de</strong> recerca i indústria, i també als ensenyants i altres professionals<br />
interessats pels avenços <strong>de</strong> la microbiologia, i als estudiants <strong>de</strong> les diverses branques <strong>de</strong> les ciències <strong>de</strong> la vida i <strong>de</strong> la<br />
salut que es plantegen <strong>de</strong>dicar-se a la recerca en microbiologia.<br />
Enguany, la RECAM es celebra el 19 i 20 <strong>de</strong> novembre <strong>de</strong> 2009.<br />
RECAM 2009 està coordinada per Jordi Urmeneta i Mercè Berlanga, <strong>de</strong>l Dept. <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la Facultat<br />
<strong>de</strong> Biologia, i <strong>de</strong>l Dept. <strong>de</strong> Microbiologia i Parasitologia Sanitàries, <strong>de</strong> la Facultat <strong>de</strong> Farmàcia, respectivament,<br />
<strong>de</strong> la Universitat <strong>de</strong> Barcelona. L'assistencia és gratuïta, però es recomana registrar-se previament (a<br />
qualsevol <strong>de</strong>ls dos correus electrònics següents: jurmeneta@ub.edu o mberlanga@ub.edu). Po<strong>de</strong>u trobar<br />
més informació a:<br />
http://scb.iec.cat/RECAM2009.htm<br />
Lloc i horari:<br />
Sala Nicolau d’Olwer, IEC. C/ Carme, 47. 08001 Barcelona<br />
19 <strong>de</strong> novembre, <strong>de</strong> 16 a 18.30 h<br />
20 <strong>de</strong> novembre, <strong>de</strong> 10 a 13.30 h i <strong>de</strong> 16 a 18.30 h<br />
La imatge <strong>de</strong>l fons <strong>de</strong> l’altra pàgina correspon a la capella <strong>de</strong> la Casa <strong>de</strong> Convalescència, seu <strong>de</strong> l’IEC. També s’hi inclouen<br />
micrografies coloreja<strong>de</strong>s artificialment <strong>de</strong> representants <strong>de</strong>ls quatre grans grups <strong>de</strong> microorganismes (virus, procariotes, fongs i protists):<br />
El virus és el bacteriòfag T2, unit a un fragment <strong>de</strong> la paret cel·lular d’un bacteri (200.000x) (Photo Researchers, Inc.);<br />
Diversitat <strong>de</strong> la microbiota intestinal humana (foto <strong>de</strong> la portada <strong>de</strong>l llibre Microorganismes, d’Editorial Reverté). Candida albicans,<br />
llevat en el que s’observa la formació <strong>de</strong> gemmes (Photo Researchers, Inc.). Trichomonas vaginalis és un protist que es transmet<br />
sexualment; la major part <strong>de</strong> les persones infecta<strong>de</strong>s són assimptomàtiques (9000x) (Photo Researchers, Inc.).
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
UNITAT I DIVERSITAT EN MICROBIOLOGIA-6<br />
RECAM 2009, 19–20 novembre 2009<br />
Secció <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la Societat Catalana <strong>de</strong> Biologia<br />
Sala Nicolau d’Olwer, <strong>Institut</strong> d’Estudis <strong>Catalans</strong>, c/ Carme 47, 08001 Barcelona<br />
Coordinadors:<br />
Jordi Urmeneta (jurmeneta@ub.edu)<br />
Mercè Berlanga (mberlanga@ub.edu)<br />
Els principals objectius <strong>de</strong> les RECAM (Reunió Científica Anual <strong>de</strong> Microbiologia) són <strong>de</strong>batre-hi<br />
alguns <strong>de</strong>ls recents avenços <strong>de</strong> la microbiologia, presentar i posar en contacte diversos<br />
grups <strong>de</strong>dicats a les ciències microbiològiques i promoure activitats <strong>de</strong> col·laboració entre laboratoris,<br />
centres <strong>de</strong> recerca i universitats. Aquesta reunió s’adreça als microbiòlegs d’universitats,<br />
centres <strong>de</strong> recerca i indústria, i també als ensenyants i altres professionals interessats pels avenços<br />
<strong>de</strong> la microbiologia, i als estudiants <strong>de</strong> les diverses branques <strong>de</strong> les ciències <strong>de</strong> la vida i <strong>de</strong> la<br />
salut que es plantegen <strong>de</strong>dicar-se a la recerca en microbiologia. La RECAM 2009 reuneix<br />
microbiòlegs <strong>de</strong> la Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona, la Universitat <strong>de</strong> Barcelona, la Universitat<br />
<strong>de</strong> Girona, la Universitat <strong>de</strong> Lleida, la Universitat Ramon Llull i l’<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l<br />
Mar (ICM-CSIC).<br />
PROGRAMA CIENTÍFIC<br />
Dijous, 19 DE NOVEMBRE<br />
Coordinadora: Montserrat Agut, IQS, URL<br />
16.00−16.45 Com responen els llevats a l’estrès ambiental? Tècniques «-òmiques» en<br />
Saccharomyces cerevisiae<br />
Enric Herrero, Facultat <strong>de</strong> Medicina, Universitat <strong>de</strong> Lleida<br />
16.45−17.15 Pausa<br />
17.15−18.00 Productes vegetals frescos processats mínimament. Qualitat microbiològica i<br />
tecnologies <strong>de</strong> bioconservació<br />
Emili Montesinos, <strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Tecnologia Agroalimentària, Universitat <strong>de</strong><br />
Girona<br />
1
Divendres, 20 DE NOVEMBRE<br />
SESSIÓ DEL MATÍ<br />
Coordinador: Jordi Urmeneta, UB<br />
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
10.00−10.45 Procarionts a les profunditats marines: abundància, activitat, diversitat i funció<br />
ecològica <strong>de</strong>ls protagonistes principals <strong>de</strong> la biogeoquímica marina<br />
Josep M. Gasol, <strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l Mar, CSIC<br />
10.45−11.30 Diversitat d’arqueus i contribució a la fixació fosca <strong>de</strong> carboni en llacunes<br />
estratifica<strong>de</strong>s<br />
Marc Llirós Dupré, Facultat <strong>de</strong> Ciències, Universitat <strong>de</strong> Girona<br />
11.30−12.00 Pausa<br />
Coordinadora: Mercè Berlanga, UB<br />
12.00−12.45 Río Tinto com a un anàleg terrestre <strong>de</strong> Mart<br />
Ricard Amils, Universidad Autónoma <strong>de</strong> Madrid i Centro <strong>de</strong> Astrobiología<br />
(INTA-CSIC).<br />
12.45−13.30 Mil·liamperes i microorganismes: producció d’electricitat amb bacteris<br />
Jordi Mas Gordi, Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />
SESSIÓ DE LA TARDA<br />
Coordinador: Ricard Amils, CAB i UAM<br />
16.00−16.45 Què té a veure el sistema SOS amb els integrons?<br />
Susana Campoy, Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />
16.45−17.15 Pausa<br />
17.15−18.00 El nou Grau <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la UAB<br />
Montserrat Llagostera, Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong><br />
Barcelona<br />
18.00–18.30 Discussió general: Conclusions i perspectives<br />
2
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
RESUMS<br />
COM RESPONEN ELS LLEVATS A L’ESTRÈS AMBIENTAL? TÈCNIQUES<br />
«-ÒMIQUES» EN Saccharomyces cerevisiae<br />
Enric Herrero<br />
Departament <strong>de</strong> Ciències Mèdiques Bàsiques, IRBLleida, Universitat <strong>de</strong> Lleida<br />
enric.herrero@cmb.udl.cat<br />
Les cèl·lules responen als canvis ambientals modificant els nivells d’expressió <strong>de</strong> diverses<br />
proteïnes per tal d’afavorir una adaptació a<strong>de</strong>quada a la nova situació. Quan aquests canvis son<br />
ràpids, parlem d’una situació d’«estrès ambiental» i, lògicament, la resposta també ha <strong>de</strong> ser<br />
immediata. La regulació <strong>de</strong> la resposta pot produir-se a diversos nivells, principalment: (i)<br />
modificant els nivells d’RNA missatger (mRNA) d’un subgrup <strong>de</strong> gens, (ii) modificant la<br />
capacitat <strong>de</strong> traducció d’una subpoblació <strong>de</strong> molècules <strong>de</strong> mRNA, o (iii) modificant l’estabilitat<br />
<strong>de</strong> diverses proteïnes. Aquests nivells <strong>de</strong> resposta no són incompatibles, i po<strong>de</strong>n donar-se<br />
simultàniament. Al llarg <strong>de</strong> la darrera dècada, el llevat Saccharomyces cerevisiae ha estat<br />
l’organisme més utilitzat per a estudiar la resposta a diversos tipus d’estrès ambiental (tèrmic,<br />
oxidatiu, osmòtic, nutricional, per agents químics, etc.), encara que aquests estudis s’han limitat<br />
a analitzar els nivells <strong>de</strong>ls mRNA <strong>de</strong> tots els gens <strong>de</strong> la cèl·lula en la situació d’estrès<br />
comparant-los amb una situació control. Aquest enfocament té la limitació experimental <strong>de</strong> no<br />
consi<strong>de</strong>rar que els nivells <strong>de</strong> mRNA estan <strong>de</strong>terminats per dos factors in<strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nts l’un <strong>de</strong><br />
l’altre: la velocitat <strong>de</strong> transcripció <strong>de</strong>terminada per l’activitat <strong>de</strong> diversos factors<br />
transcripcionals, i la velocitat <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació d’aquestes mateixes molècules <strong>de</strong> mRNA. Aquesta<br />
velocitat <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació està <strong>de</strong>terminada per una maquinària complexa dins <strong>de</strong> la cèl·lula, que<br />
només recentment s’ha començat a caracteritzar. En una situació dinàmica, com es la resposta a<br />
un estrès ambiental, la velocitat <strong>de</strong> síntesi i <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació <strong>de</strong>ls mRNA pot variar <strong>de</strong> manera<br />
separada i específica per a diversos grups funcionals <strong>de</strong> gens. Nosaltres hem aplicat la tècnica<br />
<strong>de</strong>l Genomic Run-On (GRO) per tal <strong>de</strong> discriminar entre la velocitat <strong>de</strong> síntesi i <strong>de</strong> <strong>de</strong>gradació<br />
<strong>de</strong> cadascun <strong>de</strong>ls mRNA <strong>de</strong> S. cerevisiae en resposta a l’estrès tèrmic i a l’estrès oxidatiu.<br />
Aquesta tècnica permet <strong>de</strong>terminar experimentalment i <strong>de</strong> manera simultània els nivells i la<br />
velocitat <strong>de</strong> transcripció <strong>de</strong>ls mRNA i, per tant, <strong>de</strong>duir matemàticament la velocitat <strong>de</strong><br />
<strong>de</strong>gradació. Mitjançant la tècnica GRO hem pogut <strong>de</strong>terminar que certes categories funcionals<br />
<strong>de</strong> gens tenen una mateixa resposta immediata a l’estrès tèrmic i a l’estrès oxidatiu; en són un<br />
exemple els gens que codifiquen proteïnes ribosòmiques (responen reprimint-se), o <strong>de</strong> la<br />
maquinària <strong>de</strong>l proteasoma (responen induint-se). En canvi, altres categories <strong>de</strong> gens tenen<br />
respostes específiques per a cada tipus d’estrès, com són els que codifiquen xaperones o<br />
oxidoreductases. En aquestes respostes, els canvis en l’estabilitat <strong>de</strong>ls mRNA modulen els<br />
canvis en la velocitat <strong>de</strong> transcripció, per tal <strong>de</strong> fixar uns nivells <strong>de</strong> mRNA a<strong>de</strong>quats per a la<br />
situació canviant.<br />
Enric Herrero (Barcelona, 1952). Doctor en Biologia per la UAB. Catedràtic <strong>de</strong> Microbiologia<br />
<strong>de</strong> la Universitat <strong>de</strong> Lleida i membre <strong>de</strong> l’<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Recerca Biomèdica <strong>de</strong> Lleida. Ha treballat<br />
a les Universitats Autònoma <strong>de</strong> Barcelona, Leicester (Anglaterra) i València, sempre dins <strong>de</strong>l<br />
camp <strong>de</strong> la genètica i la biologia molecular <strong>de</strong>ls microorganismes. Va participar en el projecte<br />
<strong>de</strong> seqüenciació <strong>de</strong>l genoma <strong>de</strong>l llevat, finalitzat l’any 1996, i també en el <strong>de</strong> l’anàlisi funcional<br />
d’aquest mateix genoma, dins d’un consorci d’un centenar <strong>de</strong> laboratoris europeus. Actualment,<br />
el seu interès es centra en l’estudi <strong>de</strong> la regulació <strong>de</strong> la resposta <strong>de</strong>l llevat als diversos tipus<br />
d’estrès ambiental, i, particularment, <strong>de</strong>ls mecanismes <strong>de</strong> reparació <strong>de</strong>l dany oxidatiu sobre les<br />
proteïnes.<br />
3
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
PRODUCTES VEGETALS FRESCOS PROCESSATS MÍNIMAMENT. QUALITAT<br />
MICROBIOLÒGICA I TECNOLOGIES DE BIOCONSERVACIÓ<br />
Emili Montesinos<br />
<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Tecnologia Agroalimentària, Universitat <strong>de</strong> Girona<br />
emilio.montesinos@udg.es<br />
L’escenari actual <strong>de</strong> la seguretat <strong>de</strong>ls aliments està condicionat per la implementació <strong>de</strong> noves<br />
tecnologies <strong>de</strong> conservació suaus i <strong>de</strong> processament mínim (<strong>de</strong> quarta gamma). L’aplicació<br />
d’aquestes tecnologies és imprescindible en els nous aliments, ateses les restriccions en el perfil<br />
toxicològic <strong>de</strong>ls actuals conservadors químics i la prohibició o limitació dràstica <strong>de</strong>ls antibiòtics,<br />
que tenen com a conseqüència l’aparició <strong>de</strong> nous patògens emergents o la potenciació d’alguns<br />
ja existents. En aquest context, els bioconservadors sorgeixen amb grans expectatives, atès que<br />
es tracta <strong>de</strong> microorganismes segurs que provenen <strong>de</strong>ls aliments, <strong>de</strong> compostos químics d’origen<br />
natural (pèptids i proteïnes antimicrobians, extractes vegetals, enzims), o <strong>de</strong> compostos sintètics<br />
basats en estructures naturals, encara que menys tòxics i més eficaços, com ara els pèptids<br />
antimicrobians. Entre els bioconservadors, els bacteris làctics presenten grans avantatges<br />
d’aplicació, sobretot en productes carnis crus curats, en fruites i verdures fresques i, en especial,<br />
en productes <strong>de</strong> quarta gamma, com també en mèto<strong>de</strong>s per a reduir la càrrega microbiana <strong>de</strong><br />
patògens en subproductes alimentaris abans <strong>de</strong>l seu processament. El nostre laboratori ha<br />
realitzat un estudi extens <strong>de</strong> la qualitat microbiològica <strong>de</strong> fruites i verdures fresques, i <strong>de</strong><br />
productes processats mínimament, <strong>de</strong>tectant-hi nivells baixos, però significatius, <strong>de</strong> Salmonella<br />
sp., Escherichia coli i Listeria spp., incloent-hi L. monocytogenes. Per això vàrem en<strong>de</strong>gar un<br />
projecte consistent a <strong>de</strong>senvolupar aplicacions, com a bioconservadors, <strong>de</strong> bacteris làctics<br />
(BAL) obtinguts d’aquests productes. Els BAL eren abundants en el productes <strong>de</strong> quarta<br />
gamma, en especial en llavors germina<strong>de</strong>s. Es van obtenir diverses soques productores <strong>de</strong><br />
bacteriocines, sobretot <strong>de</strong> Leuconostoc, Lactobacillus i Weissella, amb una activitat significativa<br />
per al control <strong>de</strong> L. monocytogenes en pomes i en enciam processat. Altres soques han estat<br />
efectives en la inhibició <strong>de</strong> podridures fúngiques en postcollita causa<strong>de</strong>s per Penicillium<br />
expansum.<br />
Emili Montesinos. Catedràtic <strong>de</strong> Microbiologia-Patologia Vegetal <strong>de</strong> la Universitat <strong>de</strong> Girona,<br />
expresi<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> la Sociedad Española <strong>de</strong> Fitopatología. Des <strong>de</strong> fa vint-i-cinc anys investiga en<br />
diversos camps <strong>de</strong> la microbiologia aplicada, en especial en microbiologia <strong>de</strong> plantes. La principal<br />
tasca <strong>de</strong> recerca se centra en el control <strong>de</strong> malalties <strong>de</strong>ls conreus i en el <strong>de</strong>senvolupament<br />
biotecnològic <strong>de</strong> nous plaguici<strong>de</strong>s i bioconservadors que no tinguin els efectes perjudicials <strong>de</strong>ls<br />
plaguici<strong>de</strong>s químics convencionals. La seva tasca ha estat reconeguda internacionalment i<br />
participa com a expert <strong>de</strong> forma regular en congressos i conferències. És assessor en diversos<br />
comitès científics catalans, estatals i internacionals, i membre <strong>de</strong> representacions nacionals i<br />
internacionals en el camp <strong>de</strong> la sanitat vegetal. Ha portat a terme una extensa tasca <strong>de</strong> formació<br />
d’investigadors, amb la direcció <strong>de</strong> tesis doctorals, projectes <strong>de</strong> recerca i màsters. La seva producció<br />
científica amb 120 publicacions està acreditada internacionalment.<br />
4
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
PROCARIONTS A LES PROFUNDITATS MARINES: ABUNDÀNCIA, ACTIVITAT,<br />
DIVERSITAT I FUNCIÓ ECOLÒGICA DELS PROTAGONISTES PRINCIPALS DE<br />
LA BIOGEOQUÍMICA MARINA<br />
Josep M. Gasol<br />
<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l Mar, CSIC<br />
pepgasol@icm.csic.es<br />
Les profunditats marines constitueixen indrets clau <strong>de</strong> la biosfera per al cicle global <strong>de</strong>l carboni:<br />
allà es produeix la remineralització <strong>de</strong> la matèria orgànica que arriba al mar <strong>de</strong>s <strong>de</strong>ls continents,<br />
o que se sintetitza per producció primària al propi mar, i allà pot acumular-se durant llargs<br />
perío<strong>de</strong>s <strong>de</strong> temps, quedant enterrada als sediments si els procarionts no la <strong>de</strong>gra<strong>de</strong>n. Les<br />
profunditats marines contenen la major quantitat <strong>de</strong> microorganismes <strong>de</strong>ls ecosistemes aquàtics,<br />
al voltant <strong>de</strong>l 75% <strong>de</strong> la biomassa i el 50% <strong>de</strong> la producció bacteriana <strong>de</strong> tot el mar. L’aplicació<br />
<strong>de</strong> la genòmica en microbiologia marina ens explica que les profunditats marines contenen un<br />
enorme i dinàmic magatzem <strong>de</strong> variabilitat genètica <strong>de</strong>s <strong>de</strong>l punt <strong>de</strong> vista filogenètic i funcional.<br />
Les comunitats microbianes són molt diverses i estan domina<strong>de</strong>s per ecotips generalistes amb<br />
genomes <strong>de</strong> mida gran, que contenen una extensa varietat <strong>de</strong> gens funcionals. L’expressió<br />
d’aquests gens té un impacte important sobre la biogeoquímica <strong>de</strong> les masses d’aigua profun<strong>de</strong>s.<br />
Els procarionts expressen una elevada activitat enzimàtica extracel·lular a nivell individual,<br />
comparable, o més gran, que la que es dóna en la superfície <strong>de</strong>l mar, amb un elevat percentatge<br />
d’ectoenzims dissolts, la qual cosa probablement indica un mo<strong>de</strong> <strong>de</strong> vida que <strong>de</strong>pèn <strong>de</strong> l’associació<br />
estreta amb partícules o col·loids. A més a més, la quimiotròfia pot representar una font<br />
addicional <strong>de</strong> producció primària i un embornal <strong>de</strong> CO2, mentre que noves vies metabòliques,<br />
com ara l’oxidació anaeròbica <strong>de</strong> l’amoni, o l’oxidació <strong>de</strong> metà, po<strong>de</strong>n tenir papers importants<br />
en els cicles biogeoquímics marins. Els avenços recents en microbiologia marina qüestionen el<br />
paradigma d’una xarxa tròfica estable en estructura i funció a les profunditats marines, amb una<br />
mineralització molt lenta <strong>de</strong> la matèria orgànica. Encara coneixem molt poc l’estructura i la<br />
dinàmica <strong>de</strong> les xarxes tròfiques <strong>de</strong> les profunditats marines, i <strong>de</strong>l paper <strong>de</strong>ls protists i <strong>de</strong>ls virus.<br />
Coneixem també molt poc la dinàmica <strong>de</strong> transformació <strong>de</strong> partícules, biòtiques i abiòtiques, i el<br />
<strong>de</strong>stí <strong>de</strong>l material exportat a les profunditats marines. Noves eines moleculars i mèto<strong>de</strong>s <strong>de</strong> mostratge<br />
ens permetran, en el futur, ampliar i estendre el nostre coneixement cap a aquest ecosistema<br />
fascinant i, bàsicament, inexplorat.<br />
Josep M. Gasol (Manresa, 1962) Professor d’Investigació a l’<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Ciències <strong>de</strong>l Mar, <strong>de</strong>l<br />
CSIC. Treballa en ecologia microbiana d’ambients planctònics: durant la tesi, als llacs <strong>de</strong> la<br />
zona <strong>de</strong> Banyoles, <strong>de</strong>sprés als llacs temperats <strong>de</strong>l Canadà, i finalment en ambients marins. En<br />
els darrers anys i a més <strong>de</strong> coordinar els treballs a l’Observatori Microbià <strong>de</strong> la Badia <strong>de</strong> Blanes,<br />
s’ha tornat a interessar pels llacs tropicals, les llacunes poc profun<strong>de</strong>s tropicals i els ambients<br />
lacustres <strong>de</strong> l’Antàrtida i <strong>de</strong> l’alta muntanya. En tots aquests indrets s’ha interessat per l’estructura<br />
<strong>de</strong> les xarxes tròfiques microbianes, pels mecanismes que la <strong>de</strong>terminen, i pels factors que<br />
regulen la diversitat i la funció d’aquestes comunitats. Entre d’altres, <strong>de</strong>staca la seva recerca per<br />
a la utilització <strong>de</strong> la citometria <strong>de</strong> flux en estudis d’ecologia microbiana, com una <strong>de</strong> les tècniques<br />
d’anàlisi a nivell <strong>de</strong> microorganisme individual amb les quals es treballa al seu laboratori.<br />
Actualment coordina un grup amb tres investigadors postdoctorals i cinc estudiants <strong>de</strong> doctorat.<br />
Ha publicat més <strong>de</strong> 110 treballs en revistes internacionals, alguns capítols <strong>de</strong> llibre i alguns treballs<br />
<strong>de</strong> divulgació. És membre <strong>de</strong> comitès editorials <strong>de</strong> tres revistes, i és també membre <strong>de</strong><br />
diversos comitès internacionals, però no es perd mai l’oportunitat d’anar a visitar escoles i <strong>de</strong><br />
participar en tasques <strong>de</strong> divulgació com ara les <strong>de</strong>l grup Lacenet (www.lacenet.org).<br />
5
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
DIVERSITAT D’ARQUEUS I CONTRIBUCIÓ A LA FIXACIÓ FOSCA DE CARBONI<br />
EN LLACUNES ESTRATIFICADES<br />
Marc Llirós Dupré<br />
Facultat <strong>de</strong> Ciències, Universitat <strong>de</strong> Girona<br />
marc.lliros@udg.es<br />
Els arqueus són components habitual <strong>de</strong> la comunitat planctònica procariota <strong>de</strong>ls ecosistemes<br />
aquàtics. L’abundància i ubiqüitat <strong>de</strong>ls Crenarchaeota no termòfils al mar, juntament amb el recent<br />
<strong>de</strong>scobriment <strong>de</strong> la seva capacitat <strong>de</strong> fixar carboni a les fosques utilitzant amoni com a font<br />
d’energia, han fet augmentar l’interès en el seu estudi, atès l’impacte que la seva activitat podria tenir<br />
en els cicles biogeoquímics, en especial <strong>de</strong>l nitrogen i el carboni. En els darrers anys, el nostre grup<br />
ha analitzat diverses llacunes estratifica<strong>de</strong>s <strong>de</strong>l sistema càrstic <strong>de</strong> Banyoles (El Pla <strong>de</strong> l’Estany)<br />
caracteritza<strong>de</strong>s per un cicle <strong>de</strong>l sofre molt actiu, anòxia estacional i un estat tròfic que va <strong>de</strong>s <strong>de</strong><br />
la mesotròfia (estanyol d’El Vilar), fins a l’eutròfia (estanyol <strong>de</strong> Can Coromina). El grup <strong>de</strong>ls<br />
Crenarchaeota conegut com a MCG (Miscellaneous Crenarchaeotic Group) és el més abundant<br />
en els hipolimnis anòxics d’ambdues llacunes (63% al Vilar i 50% a Can Coromina), tot i que<br />
també s’hi han <strong>de</strong>tectat altres grups filogenètics relacionats amb els Euryarchaeota. Malgrat la<br />
gran riquesa filogenètica observada, no s’han <strong>de</strong>tectat filotips d’Archaea relacionats amb<br />
Crenarchaeota oxidadors d’amoni, cosa que indica que aquestes llacunes estratifica<strong>de</strong>s no són<br />
ambients idonis per al <strong>de</strong>senvolupament d’arqueus nitrificants (grups Marine I.1a i Soil I.1b).<br />
D’altra banda, l’abundància d’arqueus a Can Coromina variava entre l’1 i el 7% <strong>de</strong>l total <strong>de</strong><br />
cèl·lules tenyi<strong>de</strong>s amb DAPI. Per tal d’analitzar la fracció activa <strong>de</strong> la comunitat planctònica<br />
<strong>de</strong>ls arqueus, es varen realitzar incubacions in situ amb bicarbonat radioactiu. Amb aquesta<br />
tècnica es va posar <strong>de</strong> manifest la important contribució <strong>de</strong>ls processos <strong>de</strong> fixació fosca <strong>de</strong> la<br />
llacuna, i que una petita fracció <strong>de</strong>l total d’arqueus (10%) incorporava carboni a les fosques.<br />
Aquests resultats suggereixen que els llinatges d’arqueus predominants en aquests ambients<br />
lacustres sulfurosos eutròfics podrien ser microorganismes heteròtrofs anaerobis.<br />
Marc Llirós (Barcelona, 1974). Llicenciat en Biologia i Màster en Microbiologia per la UAB,<br />
on va estudiar els tapissos microbians i el seu possible paper bioremediador <strong>de</strong>ls vessaments <strong>de</strong><br />
petroli. Actualment està finalitzant la tesi doctoral a la Universitat <strong>de</strong> Girona, investigant les<br />
poblacions mesòfiles d’arqueus en ecosistemes lacustres estratificats d’arreu <strong>de</strong>l món. És<br />
professor <strong>de</strong> l’Àrea <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la mateixa universitat. És autor <strong>de</strong> diferents articles en<br />
revistes internacionals, ha participat en congressos, tant nacionals com internacionals, i en<br />
activitats <strong>de</strong> divulgació científica.<br />
6
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
RÍO TINTO COM A ANÀLEG TERRESTRE DE MART<br />
Ricard Amils<br />
Universidad Autónoma <strong>de</strong> Madrid i Centro <strong>de</strong> Astrobiología (INTA-CSIC)<br />
ricardo.amils@uam.es<br />
En astrobiologia, l’estudi d’anàlegs terrestres es consi<strong>de</strong>ra fonamental per a avaluar la<br />
possibilitat que la vida pogués <strong>de</strong>senvolupar-se fora <strong>de</strong> la Terra. Atesa la seva proximitat, Mart<br />
ha estat <strong>de</strong>s <strong>de</strong> fa anys un candidat excel·lent per a explorar si hi ha hagut, o hi ha, vida en el<br />
planeta vermell. D’entre els diferents anàlegs terrestres <strong>de</strong> Mart, Río Tinto ocupa un lloc<br />
privilegiat, ja que la mineralogia i la geoquímica <strong>de</strong>l planeta vermell <strong>de</strong>tectada en les recents<br />
missions d’exploració són similars a les observa<strong>de</strong>s en la conca <strong>de</strong> Río Tinto. En el cas <strong>de</strong> Río<br />
Tinto, la constitució geoquímica és <strong>de</strong>guda a l’activitat <strong>de</strong> microorganismes quimiolitoautòtrofs<br />
que operen en el subsòl <strong>de</strong> la Faixa Pirítica Ibèrica, on es dóna la major concentració <strong>de</strong> sulfurs<br />
metàl·lics <strong>de</strong>l món. En aquesta comunicació analitzarem les possibilitats <strong>de</strong> l’existència <strong>de</strong> vida<br />
a Mart mitjançant da<strong>de</strong>s genera<strong>de</strong>s en l’exploració <strong>de</strong> la geomicrobiologia <strong>de</strong> la conca <strong>de</strong>l Tío<br />
Tinto.<br />
Ricard Amils (Barcelona, 1947). Llicenciat en Ciències Químiques per la Universitat <strong>de</strong> Barcelona,<br />
1969. Doctor en Ciències per la Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona, 1973. Catedràtic <strong>de</strong><br />
Microbiologia <strong>de</strong>l Departamento <strong>de</strong> Biología Molecular, Centro <strong>de</strong> Biología Molecular, Universidad<br />
Autónoma <strong>de</strong> Madrid, i investigador associat <strong>de</strong>l Centro <strong>de</strong> Astrobiología (INTA-CSIC).<br />
Ha estat investigador associat a la Dartmouth Medical School, USA, i a la Columbia University,<br />
USA. Té més <strong>de</strong> 220 publicacions, entre articles en revistes científiques especialitza<strong>de</strong>s i capítols<br />
<strong>de</strong> llibres. Les seves principals línees <strong>de</strong> recerca han estat l’evolució funcional <strong>de</strong>l ribosoma,<br />
la reconstitució <strong>de</strong> ribosomes, la biomineria, la bioremediació i el segrestament <strong>de</strong> metalls<br />
pesants, l’ecologia microbiana en ambientes extrems i l’astrobiologia.<br />
7
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
MIL·LIAMPERES I MICROORGANISMES: PRODUCCIÓ D’ELECTRICITAT AMB<br />
BACTERIS<br />
Jordi Mas Gordi<br />
Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />
jordi.mas@uab.es<br />
Una pila microbiana <strong>de</strong> combustible és un dispositiu capaç <strong>de</strong> convertir l’energia química<br />
present en compostos orgànics en energia elèctrica, mitjançant l’ús <strong>de</strong> microorganismes com a<br />
catalitzadors. El disseny més convencional <strong>de</strong> les piles microbianes <strong>de</strong> combustible consta <strong>de</strong><br />
dos elèctro<strong>de</strong>s, un àno<strong>de</strong> i un càto<strong>de</strong>, situats en dos compartiments in<strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nts separats per<br />
una membrana permeable als protons. En el compartiment <strong>de</strong> l’àno<strong>de</strong>, els microorganismes<br />
oxi<strong>de</strong>n compostos orgànics (glucosa, acetat, etc.) fins a CO2, i generen protons (H + ) i electrons<br />
(e – ) en el procés. En condicions aeròbiques normals, els electrons proce<strong>de</strong>nts d’aquesta oxidació<br />
són transferits a l’oxigen, que actua com a acceptor final d’electrons. En una pila microbiana <strong>de</strong><br />
combustible, a causa <strong>de</strong> l’absència d’oxigen, els microorganismes es veuen obligats a transferir<br />
els electrons a l’àno<strong>de</strong>, que actua, en aquest cas, com a acceptor extern d’electrons. Els electrons<br />
circulen <strong>de</strong> l’àno<strong>de</strong> al càto<strong>de</strong> i d’aquesta manera donen energia a un circuit extern. En el<br />
compartiment <strong>de</strong>l càto<strong>de</strong>, els electrons que hi arriben a través <strong>de</strong>l circuit són utilitzats juntament<br />
amb protons <strong>de</strong>l medi per reduir oxigen fins a aigua. Aquest tipus <strong>de</strong> dispositiu es pot fer operar<br />
a diferents escales, que permeten diferents aplicacions, que van <strong>de</strong>s <strong>de</strong>l tractament d’aigües<br />
residuals fins al <strong>de</strong>senvolupament <strong>de</strong> microsensors <strong>de</strong> toxicitat.<br />
Jordi Mas Gordi (Castellbell i el Vilar, 1960). Professor titular <strong>de</strong> Microbiologia a la UAB. La<br />
seva recerca es va iniciar amb l’estudi <strong>de</strong> l’ecologia <strong>de</strong>ls bacteris fotòtrofs <strong>de</strong>ls sofre. Ha<br />
investigat la utilització <strong>de</strong> biofilms d’aquests microorganismes en reactors per al tractament<br />
d’efluents contaminants i, més recentment, la seva recerca s’ha centrat en el camp <strong>de</strong> la<br />
microbiologia ambiental aplicada, <strong>de</strong>senvolupant sistemes per a la <strong>de</strong>tecció i seguiment en<br />
temps real <strong>de</strong> la presència i l’activitat <strong>de</strong> microorganismes en aigües. Al mateix temps, ha<br />
explorat <strong>de</strong> forma interdisciplinària diferents metodologies avança<strong>de</strong>s, com ara el <strong>de</strong>senvolupament<br />
<strong>de</strong> microxips per a la mesura <strong>de</strong> biomassa bacteriana en suspensió i per a l’estudi <strong>de</strong><br />
l’establiment <strong>de</strong> biofilms microbians sobre superfícies.<br />
8
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
QUÈ TÉ A VEURE EL SISTEMA SOS AMB ELS INTEGRONS?<br />
Susana Campoy*<br />
Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />
susana.campoy@gmail.com<br />
El sistema <strong>de</strong> reparació d’emergència, o sistema SOS, es <strong>de</strong>fineix clàssicament com una<br />
resposta global davant la presència <strong>de</strong> lesions en el DNA, que té com a objectiu final la<br />
superació <strong>de</strong> les lesions i la supervivència <strong>de</strong> la cèl·lula. Els estudis <strong>de</strong> la composició <strong>de</strong> la xarxa<br />
gènica d’aquest sistema han permès <strong>de</strong>terminar que no només engloba gens vinculats amb la<br />
reparació (com ara polimerases <strong>de</strong> baixa fi<strong>de</strong>litat <strong>de</strong> còpia, helicases, gens <strong>de</strong> reparació per<br />
escissió <strong>de</strong> nucleòtid o recombinases), sinó que també inclou, entre d’altres, toxines, repressors<br />
<strong>de</strong>l cicle lític <strong>de</strong> bacteriòfags, gens vinculats amb l’empaquetament d’illes <strong>de</strong> patogenicitat o<br />
mecanismes <strong>de</strong> resistència antibiòtica. L’aparició d’aquestes noves da<strong>de</strong>s ha ampliat la visió <strong>de</strong>l<br />
sistema SOS, associant aquesta resposta gènica a les situacions d’estrés a les quals s’enfronta la<br />
cèl·lula. Els integrons són elements genètics capaços d’adquirir i d’expressar gens que no tenen<br />
promotor i que, en molts casos, codifiquen resistències a antibiòtics. Una característica que<br />
<strong>de</strong>fineix els integrons és que presenten, en la seva estructura, el gen int, el qual codifica un<br />
enzim, anomenat integrasa, encarregat d’incorporar o d’escindir els gens que formen part <strong>de</strong><br />
l’integró. Recentment, el nostre grup ha <strong>de</strong>terminat que aquestes integrases formen part <strong>de</strong>l<br />
sistema SOS i que incrementen la seva expressió quan les condicions ambientals activen aquest<br />
sistema <strong>de</strong> reparació d’emergència. Atès que molts antimicrobians tenen la capacitat d’induir la<br />
resposta SOS, és necessària una reflexió sobre l’ús d’aquests compostos per tal <strong>de</strong> controlar i<br />
d’evitar l’aparició i dispersió <strong>de</strong> mecanismes <strong>de</strong> resistència antimicrobiana entre diferents<br />
microorganismes.<br />
*Han participat en el treball Neus Sánchez-Alberola, Ivan Erill, Pilar Cortés, Montserrat Llagostera<br />
i Jordi Barbé<br />
Susana Campoy. Llicenciada en Ciències Biològiques (1997) i doctora en Ciències Biològiques<br />
(2002) per la UAB. De 2003 fins a 2008 va ser investigadora adjunta <strong>de</strong> l’IRTA en el Centre<br />
<strong>de</strong> Recerca en Sanitat Animal, amb una beca postdoctoral INIA. Des <strong>de</strong> <strong>de</strong>sembre <strong>de</strong> 2008,<br />
és professora agregada <strong>de</strong>l Departament <strong>de</strong> Genètica i <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la UAB, on treballa<br />
dins <strong>de</strong>l grup <strong>de</strong> Microbiologia Molecular. Les seves línees d’investigació són l’estudi <strong>de</strong><br />
factors <strong>de</strong> virulència en bacteris patògens, l’obtenció <strong>de</strong> vacunes, els biosensors, l’estudi <strong>de</strong>ls<br />
mecanismes moleculars <strong>de</strong> regulació <strong>de</strong> l’expressió gènica relacionats amb l’homeòstasi <strong>de</strong><br />
cations divalents, o amb la reparació <strong>de</strong>l DNA. Ha publicat a Science, EMBO Reports, Analytical<br />
Chemistry, Molecular Microbiology, Nucleic Acid Research, Journal of Bacteriology,<br />
Microbiology i d’altres.<br />
9
RECAM2009<br />
Barcelona, 19–20 novembre 2009<br />
EL NOU GRAU DE MICROBIOLOGIA A LA UAB<br />
Montserrat Llagostera<br />
Facultat <strong>de</strong> Biociències, Universitat Autònoma <strong>de</strong> Barcelona<br />
Montserrat.Llagostera@uab.es<br />
L’avenç <strong>de</strong>l coneixement <strong>de</strong> les ciències biològiques en els darrers trenta anys ha conduït a la<br />
seva diversificació en disciplines ben diferencia<strong>de</strong>s i amb entitat pròpia, entre les quals <strong>de</strong>staca<br />
la microbiologia. Stanley Maloy i Moselio Schaechter ja van indicar en el 2006 (International<br />
Microbiology 9:1-7) que estem vivint «la Tercera Edat d’Or» <strong>de</strong> la microbiologia. Per tant,<br />
tenim el repte d’oferir una formació a<strong>de</strong>quada per a capacitar les properes generacions <strong>de</strong><br />
professionals <strong>de</strong> la microbiologia i el d’educar la població i els governants per a entendre el<br />
paper crucial <strong>de</strong> la nostra ciència en la salut humana i en l’economia. En aquest marc, <strong>de</strong>s <strong>de</strong> la<br />
Unitat <strong>de</strong> Microbiologia Campus <strong>de</strong> la UAB va sorgir la proposta d’elaborar un pla d’estudis per<br />
a oferir un Grau <strong>de</strong> Microbiologia, a l’igual que el que ja existeix en altres països, i tot aprofitant<br />
l’experiència d’aquesta Unitat en la docència que imparteix fa anys en l’especialitat <strong>de</strong> Microbiologia<br />
<strong>de</strong> la Llicenciatura <strong>de</strong> Biologia <strong>de</strong> la UAB. La proposta va tenir el suport <strong>de</strong> la Facultat<br />
<strong>de</strong> Biociències i <strong>de</strong> tots els altres estaments <strong>de</strong> la UAB, i, finalment, l’ANECA la va autoritzar.<br />
Així, el 14 <strong>de</strong> setembre d’enguany s’han iniciat els estudis conduents al primer Grau <strong>de</strong> Microbiologia<br />
<strong>de</strong> l’Estat Espanyol. Han començat els estudis 64 alumnes i la nota <strong>de</strong> tall per a l’admissió<br />
ha estat <strong>de</strong> 7,13.<br />
Montserrat Llagostera. Catedràtica <strong>de</strong> Microbiologia <strong>de</strong> la UAB i directora <strong>de</strong>l Departament<br />
<strong>de</strong> Genètica i <strong>de</strong> Microbiologia. Ha estat membre <strong>de</strong> diferents comissions per a l’elaboració <strong>de</strong><br />
plans d’estudis <strong>de</strong> diverses llicenciatures (Biologia, Bioquímica i Biotecnologia), va impulsar a<br />
la UAB la creació <strong>de</strong> l’especialitat <strong>de</strong> Microbiologia dins <strong>de</strong> la Llicenciatura <strong>de</strong> Biologia i<br />
recentment la <strong>de</strong>l grau <strong>de</strong> Microbiologia. Ha estat la coordinadora <strong>de</strong> la comissió que va<br />
elaborar el pla d’estudis d’aquest nou grau. La seva recerca s’ha centrat en l’estudi <strong>de</strong>ls<br />
mecanismes <strong>de</strong> mutagènesi i <strong>de</strong> reparació <strong>de</strong>l DNA en bacteris, <strong>de</strong> la resistència als antibiòtics,<br />
<strong>de</strong>ls mecanismes <strong>de</strong> captació <strong>de</strong> cations divalents i <strong>de</strong> les seves aplicacions en el disseny <strong>de</strong><br />
vacunes. En els darrers anys també ha treballat en l’aïllament <strong>de</strong> bacteriòfags i en les seves<br />
aplicacions per al control <strong>de</strong> la salmonel·losi. Ha publicat més <strong>de</strong> 60 articles en revistes internacionals<br />
i ha participat en nombrosos congressos nacionals i internacionals.<br />
10