Manual sobre Técnicas Moleculares - Centro Jardín Botánico de ...
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aparean, y se mantienen fuertemente unidos a su hebra complementaria por su extremo 3’, a partir de cual se producirá la reacción de polimerización o elongación. Las reacciones de polimerización en el ADN siempre se producen en dirección 5’-3’. El desarrollo de la reacción en cadena de la polimerasa consiste en una serie de ciclos repetitivos (de 30 a 40) en los que se dan tres pasos: la desnaturalización de las dos hebras del ADN (a una temperatura elevada, entre 92-95C), el apareamiento de los cebadores con sus respectivas hebras complementarias (a una temperatura menor, que depende de la longitud y naturaleza de los cebadores, y que suele oscilar entre 50-60C), y la elongación o síntesis de las nuevas cadenas complementarias (a la temperatura óptima de actividad de la ADN polimerasa, que suele ser 72C). En el primer ciclo, y durante el primer paso de desnaturalización, las dos hebras complementarias de ADN se separan al elevar la temperatura, en el segundo paso los cebadores se aparean con sus regiones complementarias de cada hebra al disminuir la temperatura, en el tercer paso la ADN polimerasa produce la elongación o síntesis de las nuevas cadenas complementarias al elevar de nuevo la temperatura de reacción a su óptimo, lográndose al final del ciclo la producción de dos copias de la región amplificada. En el segundo ciclo cada una de estas copias experimentará los mismos procesos en cada uno de los pasos de desnaturalización, apareamiento de cebadores, y elongación, por lo que al final del ciclo se dispondrá de cuatro copias de la región amplificada. Y así sucesivamente hasta el final del último ciclo. Al tratarse de una reacción exponencial, se obtendrán cientos de millones de copias de la región diana tras los 30-40 ciclos de la PCR. 58
Los protocolos de las reacciones de amplificación del ADN se adjuntan en el Anexo IV. Las reacciones de PCR deben prepararse en condiciones de esterilidad, para evitar problemas de contaminaciones de las muestras. En la mezcla de la reacción se deben agregar concentraciones precisas de ADN total, cebadores, nucleótidos, enzima ADN polimerasa, y tampón de reacción. La enzima polimerasa más comúnmente empleada en las reacciones de PCR es Taq polimerasa, denominada así por obtenerse a partir de la bacteria termófila Thermus aquaticus, resistente a las altas temperaturas de las fuentes termales donde vive. Taq polimerasa soporta temperaturas elevadas sin desnaturalizarse y su temperatura óptima de trabajo son 72C. Además de esta enzima, se han obtenido otras ADN polimerasas de otros organismos cuyo funcionamiento y características son similares a los de Taq. Entre los componentes del tampón de reacción se encuentra la sal cloruro de magnesio, que actúa como estabilizante de las cadenas bicatenarias que se están formando 59
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aparean, y se mantienen fuertemente unidos a su hebra complementaria por su extremo 3’, a<br />
partir <strong>de</strong> cual se producirá la reacción <strong>de</strong> polimerización o elongación. Las reacciones <strong>de</strong><br />
polimerización en el ADN siempre se producen en dirección 5’-3’.<br />
El <strong>de</strong>sarrollo <strong>de</strong> la reacción en ca<strong>de</strong>na <strong>de</strong> la polimerasa consiste en una serie <strong>de</strong> ciclos<br />
repetitivos (<strong>de</strong> 30 a 40) en los que se dan tres pasos: la <strong>de</strong>snaturalización <strong>de</strong> las dos hebras<br />
<strong>de</strong>l ADN (a una temperatura elevada, entre 92-95C), el apareamiento <strong>de</strong> los cebadores con<br />
sus respectivas hebras complementarias (a una temperatura menor, que <strong>de</strong>pen<strong>de</strong> <strong>de</strong> la<br />
longitud y naturaleza <strong>de</strong> los cebadores, y que suele oscilar entre 50-60C), y la elongación o<br />
síntesis <strong>de</strong> las nuevas ca<strong>de</strong>nas complementarias (a la temperatura óptima <strong>de</strong> actividad <strong>de</strong> la<br />
ADN polimerasa, que suele ser 72C). En el primer ciclo, y durante el primer paso <strong>de</strong><br />
<strong>de</strong>snaturalización, las dos hebras complementarias <strong>de</strong> ADN se separan al elevar la<br />
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polimerasa produce la elongación o síntesis <strong>de</strong> las nuevas ca<strong>de</strong>nas complementarias al<br />
elevar <strong>de</strong> nuevo la temperatura <strong>de</strong> reacción a su óptimo, lográndose al final <strong>de</strong>l ciclo la<br />
producción <strong>de</strong> dos copias <strong>de</strong> la región amplificada. En el segundo ciclo cada una <strong>de</strong> estas<br />
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apareamiento <strong>de</strong> cebadores, y elongación, por lo que al final <strong>de</strong>l ciclo se dispondrá <strong>de</strong><br />
cuatro copias <strong>de</strong> la región amplificada. Y así sucesivamente hasta el final <strong>de</strong>l último ciclo.<br />
Al tratarse <strong>de</strong> una reacción exponencial, se obtendrán cientos <strong>de</strong> millones <strong>de</strong> copias <strong>de</strong> la<br />
región diana tras los 30-40 ciclos <strong>de</strong> la PCR.<br />
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