Manual sobre Técnicas Moleculares - Centro Jardín Botánico de ...

continente muestran distintos haplotipos según el área geográfica en la que habitan como
consecuencia de su aislamiento en refugios templados durante los periodos glaciales.
Aunque el genoma cloroplástico se considera, en términos generales, re lativamente
conservado, existen también regiones altamente variables. Estas regiones corresponden a
fragmentos de ADN repetitivo -microsatélites cloroplásticos- cuyo estudio permite obtener
marcadores moleculares a nivel poblacional, e incluso, individual. El origen de los
microsatélites, relacionado con errores de replicación, por deslizamientos, de la ADN
polimerasa, permite acumular una serie diferente de unidades de repetición en distintos
individuos o poblaciones. Un ejemplo del empleo de los microsatélites cloroplásticos lo
tenemos en los estudios genético-poblacionales en Pinus (Provan et al., 1999).
El estudio del genoma cloroplástico, heredado en la mayoría de las plantas por vía materna,
puede causar errores de interpretación de las filogenias de grupos hibridógenos en los que
son frecuentes los fenómenos de reticulación. En la figura siguiente se muestra un ejemplo
de las distintas reconstrucciones evolutivas que se obtendrían de un hipotético grupo de
cinco especies (A, B, C, D, E), cuya filogenia real fuese la representada a la izquierda de la
figura, y donde el linaje A hubiese participado en el pasado como donante del genoma
cloroplástico de E. Mientras la reconstrucción basada en marcadores del genoma nuclear
(heredado biparentalmente) permitiría la obtención de la reconstrucción real, la
reconstrucción basada en marcadores cloroplásticos falsearía las relaciones, al aparecer la
especie E más proximamente emparentada a A.
Pese a ello, otros autores consideran que las filogenias basadas en el genoma cloroplástico
son más fiables que las reconstrucciones basadas en genes nucleares, ya que el genoma
cloroplástico es haploide, no recombinante, y se hereda unilinealmente, mientras que los
genes nucleares disponen de dos o más copias, han podido sufrir los efectos de la
recombinación, y se heredan por dos vías. La comparación entre las filogenias obtenidas
del genoma cloroplástico y las obtenidas del genoma nuclear permite distinguir en ciertos
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