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Apuntes sobre modelación de nichos ecológicos
Desktop GARP (Genetic Algorithm for Rule-set Production)
Desktop Garp es un software para predecir y analizar la distribución de especies, y
es la versión de “escritorio” del algoritmo GARP (Genetic Algorithm for Rule-set
Production, por sus siglas en inglés) o algoritmo genético basado en reglas. GARP
está desarrollado por David Stockwell en Australia (ERIN Unit of Environment) y
que posteriromente fue mejorado en EU en el “San Diego Supercomputer Center”.
¿Qué es el algoritmo GARP?
GARP es un algoritmo genético que crea un modelo de nicho ecológico para una
especie que representa las condiciones ambientales donde dicha especie sería
capaz de mantener su población. GARP utiliza como entrada un conjunto de
localidades en archivos con coordenadas decimales en formato delimitado por
comas (Comma delimited), en hoja de cálculo de Excel (Spreadsheets) o SHP
(Shapefiles) de ArcView , donde se sabe que la especie está presente y un grupo
de coberturas geográficas que representan los parámetros ambientales (que
pueden limitar la capacidad de supervivencia de la especie) que pueden ser las
capas de WorldClim que se transforman en formato RAW por medio de la
extensión Garp Dataset cargada previamente en ArcView.
En cuanto al uso del programa es muy sencillo, tiene una interfaz gráfica en donde
el usuario puede cargar todos los datos requeridos y que una vez terminado el
programa devuelve archivos de predicciones de tipo binario (adecuado-no
adecuado) en mapas con formato en grids más una hoja de resultados en *xls.
También tiene una sección par proyectar los análisis útiles en el análisis de
especies invasivas o en cambio climático (ver manual de Desktop GARP):
Laboratorio de Evolución Molecular y Experimental 31