19.05.2013 Views

2010 apuntes sobre modelación de nichos ecológicos - Instituto de ...

2010 apuntes sobre modelación de nichos ecológicos - Instituto de ...

2010 apuntes sobre modelación de nichos ecológicos - Instituto de ...

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Apuntes <strong>sobre</strong> <strong>mo<strong>de</strong>lación</strong> <strong>de</strong> <strong>nichos</strong> <strong>ecológicos</strong><br />

A<strong>de</strong>más <strong>de</strong>l principio <strong>de</strong> máxima entropía, Maxent necesita <strong>de</strong> un algoritmo que le<br />

permita encontrar las distribuciones con mayor entropía. Este algoritmo (sequential<br />

update algorithm (Dudik et al., 2004). Utiliza iteraciones en don<strong>de</strong> va dando<br />

distintos pesos a las variables utilizadas y va ajustándolas. Es un algoritmo<br />

<strong>de</strong>terminístico que según los autores y distintas pruebas empíricas garantiza que<br />

convergerá en la distribución <strong>de</strong> probabilida<strong>de</strong>s Maxent. Al terminar el proceso <strong>de</strong><br />

iteración Maxente asigna una probabilidad negativa cada pixel <strong>de</strong>l área total <strong>de</strong><br />

estudio, que al final <strong>de</strong>ben sumar 1, por lo que se aplica un valor <strong>de</strong> corrección<br />

para hacerlos positivos y que sumen entre todos 100%. Pero como cada pixel<br />

presenta valores muy pequeños, Maxent los presenta con un valor que es el<br />

resultado <strong>de</strong> la suma <strong>de</strong>l valor <strong>de</strong> ese pixel y <strong>de</strong> todos los <strong>de</strong>más pixeles con un<br />

valor <strong>de</strong> probabilidad igual. Esos valores pue<strong>de</strong>n ir <strong>de</strong> 0 a 100 e indican<br />

probabilidad <strong>de</strong> ocurrencia <strong>de</strong> la especie.<br />

El programa se carga con variables o capas bioclimáticas en formato ASCII (Que<br />

se pue<strong>de</strong>n bajar <strong>de</strong> la página <strong>de</strong> WorldClim o ser generadas por el usuario) y con<br />

datos <strong>de</strong> presencia con nombre le la especie y coor<strong>de</strong>nadas <strong>de</strong>cimales guardados<br />

en archivos <strong>de</strong> formato CSV (disponible en Excel). Se pue<strong>de</strong>n mantener los<br />

valores <strong>de</strong>fault como el umbral <strong>de</strong> convergencia = 10 -5 e iteraciones <strong>de</strong> 500. Que<br />

empíricamente se han observado que funcionan bien, y que son conservativos<br />

pero que permiten al algoritmo llegar cerca <strong>de</strong> la convergencia, más a<strong>de</strong>lante<br />

tocaremos el tema <strong>de</strong> los umbrales. El resultado son mapas <strong>de</strong> probabilidad <strong>de</strong><br />

distribución en Ascii y una hoja <strong>de</strong> resultados en Html con imágenes <strong>de</strong> los<br />

mismos mapas en (*png) y una serie <strong>de</strong> estadísticos <strong>de</strong> validación que tocaremos<br />

más a<strong>de</strong>lante. Los datos se cargan fácilmente por medio <strong>de</strong> una interfaz gráfica<br />

como la que se muestra a continuación (<strong>de</strong>l manual Maxent):<br />

Laboratorio <strong>de</strong> Evolución Molecular y Experimental 25

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!