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La tecnología Affymetrix - Sondas • Arrays de oligonucleótidos: síntesis in situ de oligonucleótidos de 25 bases sobre una superficie cuadrada de cristal (1.3 cm x 1.3 cm) mediante fotolitografía. • 11-20 parejas de sondas específicas para cada gen. • Sobrerepresentación extremos 3´de los mRNA. • Seleccionadas para maximizar las temperaturas de hibridación y la especificidad.
La tecnología Affymetrix - Sondas • Tamaño del lunar: ~150 µm (Ø). • Densidad: 10.000-250.000 oligonucleótidos/cm 2 . • Millones de copias de cada oligonucleótido específico (10 7 -10 8 copias). • Un array de oligonucleótidos puede contener 400.000 sondas (aproximadamente 20.000 genes). • El array de S. cerevisae contiene 6.000 oligos, que representan todos sus genes conocidos.
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