Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) - FBMC

Genómica Aplicada
Verano 2012
Observar el mapa y verficar si tiene el mismo patron que el de la figura 1.
Repetir el procedimiento para un mapa de dimensión 30 (NO PONER EL NRO CLICKEAR DIRECTAMENTE EN-
TER).
¿Es esta imagen de mapa igual a la anterior. ¿Por qué?
#7
10x10
Figura 1. Mapa SOM obtenidos con los perfiles transcripcionales y metabólicos de 21 IL. Los recuadros negros indican cluster con
meabolitos y transcriptos Los rojos con transcriptos. Los azules con metabolitos. Los blancos son vacíos. El tamaño del recuadro
del color indica la cantidad de componentes agrupados. A mayor tamaño mayor cantidad de componentes. Se indica con una flecha
la neurona 7
5) En la región superior de la pantalla clickear “select neuron”
5.1) Aparece un cursor en forma de cruz, direccionar el centro de la cruz
sobre la neurona 7 (indicada en la figura 1). Registrar de que color es la neurona, anotar el código de los transcriptos
y metabolitos que co-varian en esa neurona. (figura 2)
Patrón de variación global
Neurona integradora
Link a proyecto
genoma
30x30
Patrón de
variación
particular
Figura 2. Arriba a la derecha: Perfil de intensidad o expresión de metabolitos y transcriptos. En el eje x se muestran los códigos de
las ILs en el eje y el nivel de cada componente relativo al control (S. lycopersicum cultivado). El recuadro de la derecha indica el
código de colores de la curva de cada transcripto (LE) o metabolito graficado. INV: los valores fueron tomados invertidos respecto
a los datos originales. Abajo a la derecha: Pefil de expresión del transcripto LE9H17. Se muestran los niveles desnormalizados
(eje y) y las ILs (eje x). Los círculos rojos indican inconsistencia entre los valores de las réplicas, los círculos verdes indican valores
aumentados o disminuidos respecto a la media +/- 3 SD de ese cluster.
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