Biologia oral 6-Parte 1 - Facultad de Odontología
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Proteínas que carecen de estructura. Dra. Nuria Sánchez Cambios en el pH inducen el plegamiento parcial de las proteínas intrínsecamente desordenadas debido a la minimización de su alta carga neta a pH neutro, lo que disminuye la repulsión carga-carga y facilita el plegamiento mediado por colapso hidrofóbico. Los dominios C-terminal de la proteína Par-4 [44] y el factor de transcripción por choque térmico-1 (HSF1) [45] pertenecen a esta categoría. En forma similar al efecto que tiene el pH en las proteínas intrínsecamente desordenadas, los iones metálicos también son capaces de inducir cambios conformacionales mediante la disminución de la repulsión electrostática. Plegamientos parciales inducidos por los iones Zn 2+ , Ca 2+ y Co 2+ han sido descritos para el dominio N-terminal de la integrasa HIV-1, la peptidilarginin-deiminasa (PAD4) y la apo-metalotioneina respectivamente [46-48]. El agua es un componente esencial para la vida y cambios en la actividad acuosa puede ser fatal para los organismos. Sin embargo, las semillas de las plantas han desarrollado mecanismos que les permiten sobrevivir a la desecación, dentro de estos mecanismos se encuentran la acumulación de proteínas abundantes durante la embriogénesis tardía conocidas como proteínas LEA (late embriogénesis abundant). Este tipo de proteínas carecen de estructura en disolución pero en ausencia de agua forman -hélices o hasta espirales entrelazadas [49, 50]. Existen también, proteínas que en disolución acuosa carecen de estructura pero adquieren estructura secundaria en presencia de fosfolípidos o ácidos grasos. Ejemplos de esto lo constituyen la -sinucleína que adopta un plegamiento rico en hélices- en presencia del ácido graso ácido docohexanoíco (DHA) y el ácido araquidónico (AA) 38
Proteínas que carecen de estructura. Dra. Nuria Sánchez [51, 52], o el dominio C-terminal de la lipoproteína CI que en presencia de lisofosfolípidos también adopta una conformación con alto contenido de hélices- (Figura 8) [53]. Figura 8. Espectros de dicroísmo circular en el ultra-violeta lejano del dominio C-terminal de la apolipoproteína CI en presencia de diferentes cantidades de 1-lauril-2-hidroxi-sn-glicero-3- fosfocolina (reimpreso con permiso del autor [53]). Por otro lado, osmolitos orgánicos como la trimetilamina N-oxido (TMAO) y los alcoholes trifluoroetanol (TFE) y tricloroetanol tienen la habilidad de inducir la formación de estructura secundaria en las proteínas intrínsecamente desordenadas. En el caso del TFE se ha observado que independientemente de la estructura secundaria que pueda adoptar la proteína en su conformación biológica, favorece la formación hélices por lo que la interpretación de los resultados observados de experimentar con estos compuestos debe ser tomada con precaución. En la Figura 9 39
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Proteínas que carecen <strong>de</strong> estructura. Dra. Nuria Sánchez<br />
Cambios en el pH inducen el plegamiento parcial <strong>de</strong> las proteínas<br />
intrínsecamente <strong>de</strong>sor<strong>de</strong>nadas <strong>de</strong>bido a la minimización <strong>de</strong> su alta carga neta a pH<br />
neutro, lo que disminuye la repulsión carga-carga y facilita el plegamiento mediado<br />
por colapso hidrofóbico. Los dominios C-terminal <strong>de</strong> la proteína Par-4 [44] y el factor<br />
<strong>de</strong> transcripción por choque térmico-1 (HSF1) [45] pertenecen a esta categoría.<br />
En forma similar al efecto que tiene el pH en las proteínas intrínsecamente<br />
<strong>de</strong>sor<strong>de</strong>nadas, los iones metálicos también son capaces <strong>de</strong> inducir cambios<br />
conformacionales mediante la disminución <strong>de</strong> la repulsión electrostática.<br />
Plegamientos parciales inducidos por los iones Zn 2+ , Ca 2+ y Co 2+ han sido <strong>de</strong>scritos<br />
para el dominio N-terminal <strong>de</strong> la integrasa HIV-1, la peptidilarginin-<strong>de</strong>iminasa<br />
(PAD4) y la apo-metalotioneina respectivamente [46-48].<br />
El agua es un componente esencial para la vida y cambios en la actividad<br />
acuosa pue<strong>de</strong> ser fatal para los organismos. Sin embargo, las semillas <strong>de</strong> las plantas<br />
han <strong>de</strong>sarrollado mecanismos que les permiten sobrevivir a la <strong>de</strong>secación, <strong>de</strong>ntro <strong>de</strong><br />
estos mecanismos se encuentran la acumulación <strong>de</strong> proteínas abundantes durante<br />
la embriogénesis tardía conocidas como proteínas LEA (late embriogénesis<br />
abundant). Este tipo <strong>de</strong> proteínas carecen <strong>de</strong> estructura en disolución pero en<br />
ausencia <strong>de</strong> agua forman -hélices o hasta espirales entrelazadas [49, 50]. Existen<br />
también, proteínas que en disolución acuosa carecen <strong>de</strong> estructura pero adquieren<br />
estructura secundaria en presencia <strong>de</strong> fosfolípidos o ácidos grasos. Ejemplos <strong>de</strong> esto<br />
lo constituyen la -sinucleína que adopta un plegamiento rico en hélices- en<br />
presencia <strong>de</strong>l ácido graso ácido docohexanoíco (DHA) y el ácido araquidónico (AA)<br />
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