Biologia oral 6-Parte 1 - Facultad de Odontología

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10.05.2013 Views

Proteínas que carecen de estructura. Dra. Nuria Sánchez Figura 4. Espectros de NMR unidimensional de protón en donde se ejemplifican las señales correspondientes a los grupos amida (A) y los grupos metilo (B) de proteínas carentes de estructura secundaria (panel superior) y proteínas globulares (panel inferior). Los espectros bidimensionales tipo HSQC (espectro heteronuclear de coherencia cuántica simple) son únicos para cada proteína y se puede decir que son su huella digital. Estos espectros, presentan una señal por cada aminoácido que conforma la proteína pero en el caso de las proteínas intrínsecamente desordenadas se observan menos señales debido a el traslape de muchos de sus desplazamientos químicos y al igual que en los espectros de protón la mayoría de las señales presentan poca dispersión en esta dimensión (Figura 5). Finalmente, estudios para determinar el Efecto Nuclear Overhauser (NOEs) o la relajación del spin nuclear 32

Proteínas que carecen de estructura. Dra. Nuria Sánchez proveen información de la dinámica intra-molecular, mientras que estudios de acoplamiento dipolar residual arroja información de topología global del esqueleto de la proteína [40]. Figura 5. Espectros HSQC característicos de una proteína que carece de estructura (A) y una proteína globular (B). Existen diversas técnicas hidrodinámicas como la cromatografía de exclusión molecular, sedimentación por ultracentrifugación analítica, SAXS (dispersión de rayos X de ángulo bajo) y DLS (dispersión dinámica de la luz) que son muy usadas para evaluar el grado de globularidad y el nivel de compactación de una proteína. 33

Proteínas que carecen <strong>de</strong> estructura. Dra. Nuria Sánchez<br />

Figura 4. Espectros <strong>de</strong> NMR unidimensional <strong>de</strong> protón en don<strong>de</strong> se ejemplifican las señales<br />

correspondientes a los grupos amida (A) y los grupos metilo (B) <strong>de</strong> proteínas carentes <strong>de</strong> estructura<br />

secundaria (panel superior) y proteínas globulares (panel inferior).<br />

Los espectros bidimensionales tipo HSQC (espectro heteronuclear <strong>de</strong><br />

coherencia cuántica simple) son únicos para cada proteína y se pue<strong>de</strong> <strong>de</strong>cir que son<br />

su huella digital. Estos espectros, presentan una señal por cada aminoácido que<br />

conforma la proteína pero en el caso <strong>de</strong> las proteínas intrínsecamente <strong>de</strong>sor<strong>de</strong>nadas<br />

se observan menos señales <strong>de</strong>bido a el traslape <strong>de</strong> muchos <strong>de</strong> sus <strong>de</strong>splazamientos<br />

químicos y al igual que en los espectros <strong>de</strong> protón la mayoría <strong>de</strong> las señales<br />

presentan poca dispersión en esta dimensión (Figura 5). Finalmente, estudios para<br />

<strong>de</strong>terminar el Efecto Nuclear Overhauser (NOEs) o la relajación <strong>de</strong>l spin nuclear<br />

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