Biologia oral 6-Parte 1 - Facultad de Odontología

Proteínas que carecen de estructura. Dra. Nuria Sánchez
Utilizando el algoritmo denominado PONDR® (Predictor of Natural Disordered
Regions), Dunker y colaboradores encontraron que más de 15,000 proteínas
depositadas en el Swiss Protein Database se predice contienen regiones
desordenadas de más de 40 aminoácidos consecutivos [20]. Más aún, estas regiones
desordenadas son abundantes en proteínas que participan en el desarrollo de
cáncer o aquellas involucradas en la señalización celular [26]. Estudios similares
encontraron que los genomas de eucariontes son los que contienen más proteínas
con regiones desordenadas (25-41%) mientras que los de bacterias y arquea
contienen 1-8% y 21% respectivamente [27]. Sin embargo, el uso de un subconjunto
de aminoácidos no es el único parámetro que caracteriza a las proteínas
intrínsicamente desordenadas. La combinación de una baja hidrofobicidad media
y una alta carga neta son también un indicio de la ausencia de estructura
compacta en las proteínas [28-30]. Las proteínas globulares y las proteínas
intrínsecamente desordenadas se pueden distinguir fácilmente ya que ocupan áreas
diferentes en un gráfica de carga-hidropatía (Figura 1).
Figura 1. Comparación de la carga neta y la hidrofobicidad media para proteínas estructuradas (cuadrados
azules) y proteínas intrínsecamente desordenadas (círculos rosas). La línea negra representa la frontera
entre ambos tipos de proteínas (adaptada de [30]).
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