karty przedmiotów - WydziaŠChemiczny
karty przedmiotów - WydziaŠChemiczny
karty przedmiotów - WydziaŠChemiczny
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Wy3 Cwiczenia i test z zakresu konstrukcji modeli molekularnych 2<br />
Wy4<br />
Podstawowe pojęcia teorii oddziaływań międzycząsteczkowych.<br />
Rachunek zaburzeń. Charakterystyki głównych składowych energii 2<br />
oddziaływań międzycząsteczkowych.<br />
Wy5<br />
Wiązania wodorowe. Rozkład ładunku w cząsteczkach chemicznych<br />
i modele elektrostatyczne. Pola siłowe. Przewidywanie struktury 2<br />
agregatów molekularnych.<br />
Wy6<br />
Cwiczenia i test z zakresu przewidywania właściwości cząsteczek<br />
chemicznych oraz przewidywania struktury agregatów<br />
2<br />
molekularnych.<br />
Wy7<br />
Modelowanie oddziaływań w receptorach i centrach aktywnych<br />
enzymów. Projektowanie leków. Elementy dynamiki molekularnej. 2<br />
Modelowanie struktury białek przez homologię.<br />
Wy8<br />
Analiza aktywności katalitycznej enzymów i projektowanie<br />
biokatalizatorów.<br />
1<br />
Suma godzin 15<br />
Forma zajęć – laboratorium<br />
Liczba<br />
godzin<br />
La1<br />
Wprowadzenie do tematyki zajęć i organizacji pracy w laboratorium 2<br />
komputerowym.<br />
La2 Sposoby reprezentowania struktury cząsteczki. 2<br />
La3<br />
Opis struktury cząsteczki za pomocą macierzy Z - wprowadzenie do 2<br />
programu Molden.<br />
La4<br />
Wprowadzenie teoretyczne do metod stosowanych w kwantowochemicznych<br />
obliczeniach struktury i właściwości cząsteczek.<br />
2<br />
La5<br />
Optymalizacja geometrii i obliczenie podstawowych właściwości 2<br />
cząsteczek metodami kwantowo-chemicznymi.<br />
La6<br />
Analiza i wizualizacja wyników obliczeń kwantowo-chemicznych. 2<br />
Analiza częstości drgań normalnych.<br />
La7<br />
Oddziaływania niekowalencyjne - struktura kompleksu i obliczenia 2<br />
energii oddziaływania.<br />
La8 Zadanie obliczeniowe nr 1. 2<br />
La9 Zadanie obliczeniowe nr 2. 2<br />
La10<br />
Wizualizacja i analiza struktury biomolekuł i oddziaływań białkoligand.<br />
2<br />
La11 Zadanie obliczeniowe nr 3. 2<br />
La12<br />
Wprowadzenie do obliczeń opartych o pola siłowe. Przygotowanie 2<br />
symulacji dynamiki molekularnej.<br />
La13 Analiza trajektorii dynamiki molekularnej. 2<br />
La14 Zadanie obliczeniowe nr 4. 4<br />
Suma godzin 30<br />
Forma zajęć – seminarium<br />
Se1 Referaty uczestników dotyczące wybranych technik modelowania 2<br />
Liczba<br />
godzin<br />
1<br />
1<br />
5
Change language