Helmholtz-Gemeinschaft

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Material & Methoden Fluoreszenzphotometer Horiba Jobin Yvon (IBT) Flourog3-22 Perkin Elmer (IMET) LS-50B Flüssigchromatograph Amersham Bioscience Äkta basic Amersham Bioscience Äkta Purifier HPLC Agilent Technologies Agilent 1100 Dionex ASI 100 HPLC –Chromatographie-Säulen Agilent Eclipse XDB-C18 Crawford scientific Chiralcel OD-H Gefriertrockner Steris Lyovac GT2 Martin Christ Alpha 2-4 Heizschrank Memmert Magnetrührer IKA Labortechnik RCT basic Millipore Anlage Millipore Corporation Milli-Q pH-Elektrode Nordantec GmbH pH Electrode IJ44 Metrohm Solvotrode pH-Meter Knick pH Meter 766 Calimatric Metrohm pH Meter 691 Pipetten Eppendorf research Rotoren Beckmann JA-20 Beckmann JIA- 8.100 Rotationsverdampfer Büchi R114 Schüttelinkubator Infrons HAT Multitron Schüttler IKA Labortechnik KS 250 basic SDS-Stromgerät BioRad 1000/500 Power supply BioRad Power Pac 300 Sonotroden Dr. Hielscher GmbH S1, S3, SD14 Spektrophotometer Beckmann DU 650 Shimadzu UV1601 Sterilfiltrierer Sartorius Thermomixer Eppendorf Thermomixer comfort Ultraschallbad Bandelin Sonorex Ultraschallprozessor Dr. Hielscher GmbH UP 200S UV-Tisch Bio-Budget 40-ECX-20L Vortexer Heiporph Reax 2000 Vortex Genie 2 Zentrifugen Eppendorf Mini Spin Heraeus Biofuge pico Hettich Rotina 35R Beckmann Coulter GS15-R Dupont Sorvall RC-5B/RC-5B plus 3.1.3 Computerprogramme und Datenbanken Tabelle 4: Verwendete Computerprogramme und Datenbanken Bezeichnung ChemDraw 10.0 Clone Manager 7 FL WinLab Hersteller oder Referenz CambridgeSoft (Cambridge, USA) Scientific & Educational Software (Cary, USA) Perkin Elmer (Waltham, USA) 39
Material & Methoden FluorEssence 3.0 basiert auf Origin 8 ISI Web of Knowledge NCBI ORIGIN 7 und 8.0 PDBe PyMOL 0.99rc6 ROPKA 2.0 Unicorn 5.10 Inkl. Multigroup 1.0 von Horiba Jobin Yvon (Minami-ku Kyoto, Japan) http://apps.isiknowledge.com http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ Microcal Software Inc. (Northhampton, USA) http://www.ebi.ac.uk/pdbe/ De Lano Scientific LLC (Palo Alto, Kanada) http://propka.ki.ku.dk/ GE Healthcare (München, Deutschland) 3.1.4 Bakterienstämme Tabelle 5: Verwendete Bakterienstämme Stamm Genotyp Bezugsquelle E.coli DH5α F - , φ80dlacZΔM15, Δ(lacZYA-argF)U169, deoR, recA1, endA1, hsdR17(r - K , m + K ), phoA, supE44, thi-1, gyrA96, relA1, λ - Invitrogen E.coli SG13009 F - ompT, hsdS B (r - B m - B ) dcm, gal, (DE3) Qiagen 3.1.5 Plasmide Plasmid Merkmal Bezugsquelle pkk233_2 AmpR-Promotor, trc-Pomotor, pBR322-ori, Amp R Clontech (Mountain View, USA) BALHis/ pKK233_2 mit inseriertem Gen für BALwt mit pKK233_2 C-terminalem Hexahistidin-Tag Janzen 2006 BALHis mit C-terminaler Deletion (551-563 AS), N- HisBALΔ/ terminal verlagertem Hexahistidin-Tag und eingefügter pKK233_2 FaktorXa Erkennungssequenz Kocot 2010 BALΔHis/ pKK233_2 BALHis mit C-terminaler Deletion (551-563 AS) Kocot 2010 BFDH281AHis/ pKK233_2 mit inseriertem Gen für BFDH281A mit pKK233_2 C-terminalem Hexahistidin-Tag Polovnikova 2003 BAL K127A pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Alanin an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) BAL K127R pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Arginin an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) BAL K127N pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Asparagin an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) BAL K127E pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Glutamat an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) BAL K127Q pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Glutamin an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) BAL K127I pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Isoleucin an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) BAL K127L pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Leucin an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) BAL K127M pKK233_2 BALHis mit Mutation die zum Austausch der Aminosäure Lysin zu Methionin an der Position 127 führt Sloning Biotechnologie (Deutschland) 40
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Gesundheit / Health Band / Volume 3
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