24. Ulusal Biyokimya Kongresi - Türk Biyokimya Dergisi

XXIV. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES‹
25 - 28 Eylül 2012
Dedeman Otel - Konya
24. Ulusal Biyokimya Kongresi, Konya [24 th National Biochemistry Congress, Konya / TURKEY]
İÇİNDEKİLER
S09 - IN VİTRO GAMA RADYASYON TARAFINDAN
İNDÜKLENEN GENOMİK HASARDA XBP-1 VE GADD153
GENLERİNİN EKSPRESYONU
1
Emel SAĞLAR, 1 Sibel ÜNLÜ, 1 Hatice MERGEN
1
Hacettepe Üniversitesi, Biyoloji Bölümü, Ankara
S09 - EXPRESSION OF XBP-1 AND GADD153 GENES IN HUMAN
GENOME DAMAGE INDUCED BY GAMMA RADIATION IN VITRO
1
Emel SAĞLAR, 1 Sibel ÜNLÜ, 1 Hatice MERGEN
1
Ankara
CONTENTS
SÖZLÜ SUNUM ÖZETLERİ
Bu çalışmanın amacı insan periferal lenfositlerinde in vitro olarak farklı gama
radyasyon dozlarından meydana gelen DNA hasarının kantitafif real time
polimeraz zincir reaksiyonu ile (QRT-PCR) değerlendirilmesidir. Gen ekspresyon
değişiklikleri, B2M referans gen olarak kullanılarak otofaji ile ilişkili XBP-1
ve GADD153 genlerinde analiz edilmiştir. Genç, sağlıklı ve sigara içmeyen 10
kişiye ait kan örnekleri toplanmıştır. Tüm örnekler beşe bölünmüştür ve bir örnek
kontrol olarak kullanılırken diğer dört örnek sabit gama kaynağında (60Co) 0327
kGy/h doz hızında radyasyona maruz bırakılmıştır. Kan örnekleri 0.1 Gy, 0.5 Gy,
1Gy ve 3 Gy gama radyasyonuna maruz bırakılmıştır. Sonuçlar eşik değerinin
aşıldığı döngü değerlerine (CT) göre REST 2009 (Relative Expression Software
Tool V. 2.0.13 ) programında değerlendirilmiş, hedef genin ve referans genin
CT değerleri arasındaki farklılıklara göre hesaplanmıştır. QRT-PCR sonuçları,
XBP-1 ve GADD153 genlerinin radyasyona maruz kaldıktan sonra up-regüle
olduğunu göstermiştir. Otofaji ile ilişkili XBP-1 ve GADD153 genlerinin
radyasyon etkisini gözlemlemek için kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.
The aim of the study was to evaluate the application of quantitative real time
polymerase chain reaction (QRT PCR) for DNA damage caused by different gamma
radiation doses in peripheral human lymphocytes in vitro. Gene expression changes
were analyzed in autophagy related XBP-1 and GADD153 genes by using B2M
as a reference gene. Whole blood samples of ten young, healthy and non-smoking
donors were taken. All samples were divided in to five aliquotes and four of them
were irradiated using constant gamma irradiation source (60Co) giving the dose rate
of 0.0327 kGy/h while one sample used as control. Blood samples were exposed
to 0.1 Gy, 0.5 Gy, 1Gy and 3 Gy gamma rays. Results were expressed in terms of
the threshold cycle value (Ct) in REST 2009 (Relative Expression Software Tool
V. 2.0.13) program and the difference between the CT values of the target gene
and the reference gene was calculated. QRT PCR results showed that XBP-1 and
GADD153 genes were up-regulated after radiation exposure. Autophagy related
genes XBP-1 and GADD153 can be used for radiation exposure assessment.
ABSTRACTS OF ORAL PRESENTATIONS
Turk J Biochem, 2012; 37 (S1)
http://www.TurkJBiochem.com