Studiehandboken 06/07 del 4 - KTH

KTH Studiehandbok 2006-2007
5A1587 Experimentell biomolekylär fysik, fk
Poäng/KTH Credits 4
ECTS-poäng/ECTS Credits 6
Kursnivå/Level
D
Betygsskala/Grading, KTH 3, 4, 5
ECTS-betygsskala/Grading, ECTS
A-F
Valfri för/Elective for
TBPHM1
Språk/Language
Svenska. On request given in English.
Kurssida/Course Page
Experimental Biomolecular
Physics, Advanced Course
Kursansvarig/Coordinator
Jerker Widengren,
jerker@biomolphysics.kth.se
Tel. 5537 8030
Kursuppläggning/Time Period 4
Föreläsningar 20 h
Seminarier 12 h
Ges under period 4 om tillräckligt intresse finnes.
Given in period 4 if there is a sufficient demand
Kortbeskrivning
Fluorescensspektroskopi är ett område som har utvecklats dramatiskt under de
senaste decenniet. Fluorescensdetektion och karakterisering med hjälp av
fluorescens har en utbredd användning inom biomedicinsk forskning, likväl
som för klinisk diagnostik och för läkemedelsutveckling inom bioteknologiska
företag och läkemedelsindustrin. Den här kursen behandlar fluorescensspektroskopiska
metoder som används för att studera biomolekyler och deras
interaktioner.
Mål
Kursen skall ge
• kunskaper om grundläggande fysikaliska principer för
fluorescensgeneration
• förståelse för hur växelverkan mellan biomolekyler och
elektromagnetisk strålning samt omgivningseffekter kan generera skillnader i
de uppmätta fluorescensparametrarna, samt hur dessa skillnader kan utnyttjas
för monitorering av biomolekyler och deras interaktioner.
• en genomgång av moderna fluorescensspektroskopiska tekniker som
används inom det biomedicinska forskningsområdet generellt.
• kunskap om de fysikaliska principer som styr teknikerna
• en översikt över hur dessa tekniker används inom biomedicinsk
forskning och läkemedelsutveckling.
Kursinnehåll
Föreläsningar/seminarier:
Introduktion till fluorescens, fysikalisk beskrivning av absorptions och
emissionsprocesser, omgivningseffekter/fluorescerande molekylära sensorer,
polarisation och molekylära rotationsmätningar, Resonance energy transfer
(FRET) och molekylära avståndsmätningar med fluorescens,
fluorescensmarkörer och deras karakteristika, avancerade
fluorescensspektroskopiska och fluorescensmikroskopiska tekniker I & II,
Applikationer inom biologi, medicin och läkemedelsutveckling.
Litteraturpresentationer
Förkunskaper
Matematik motsvarande F2. Experimentell biomolekylär fysik (5A1586) eller
motsvarande.
Kursfordringar
Inlämningsuppgifter (INL1; 1p).
Litteraturpresentationer (LAB1; 1p).
Skriftlig tentamen (TEN1; 2 p).
Kurslitteratur
JR Lakowicz ”Principles of fluorescence spectroscopy” Kluwer Academic.
Vetenskapliga artiklar.
Abstract
Fluorescence spectroscopy has
developed dramatically in the last
decade. Fluorescence detection and
characterization has found a wide use
within biomedical research, as well as
for clinical diagnostics, and for drug
development activities in
biotechnological and pharmaceutical
industries. This course covers the
principles and applications of
fluorescence spectroscopic techniques
for studies of biomolecules and their
interactions.
Aim
The course intends to provide
• Knowledge of fundamental
physical principles for generation of
fluorescence
• An understanding for how
the interaction between biomolecules
and electromagnetic radiation, in
combination with environmental
factors, can generate differences in the
recorded fluorescence parameters, and
how these differences can be used to
monitor biomolecules and their
interactions.
• A survey of modern
fluorescence spectroscopic techniques
used in the biomedical research field.
• Knowledge of the physical
principles behind the techniques.
• An overview of how these
techniques are used in biomedical
research, diagnostics, and drug
development
Syllabus
Lectures / seminars:
Introduction to fluorescence, physical
view of processes of absorption and
emission, environmental factors /
fluorescence-based molecular sensors,
polarisation & molecular rotation
measurements, resonance energy
transfer & molecular distance
measurements, fluorescence markers
and their characteristic features,
advanced fluorescence spectroscopic
techniques I & II, applications in
biology, medicine and drug
development
Literature presentations
Prerequisites
Mathematics corresponding to F2.
Experimental Biomolecular Physics
(5A1586) or the like.
5A Fysik 119