Zbornik - Društvo genetičara Srbije
Zbornik - Društvo genetičara Srbije
Zbornik - Društvo genetičara Srbije
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
IV-Usm-2 ZBORNIK ABSTRAKATA III KONGRESA GENETIÈARA SRBIJE 91<br />
Subotica, 30. novembar - 4. decembar 2004.<br />
KARAKTERIZACIJA REPETITIVNE SEKVENCE JEÈMA SA<br />
HROMOZOM SPECIFIÈNIM PCR PRODUKTIMA<br />
Gordana Šurlan-Momiroviæ 1 , D. Peroviæ 2 i A. Graner 2<br />
1<br />
Poljoprivredni fakultet, Katedra za genetiku i oplemenjivanje biljaka, Zemun<br />
2<br />
Institit za genetiku i oplemenjivanje biljaka (IPK), Odeljenje genbanke,<br />
AG MOM, Gatersleben, Nemaèka<br />
Transpozoni su samoreplicirajuæi elementi koji su odgovorni za veæi deo repetativne<br />
DNA u genomu biljaka. Oni se mogu klasifikovati u tri grupe: dugi terminalno ponovljivi<br />
(LTR) retrotranspozoni, ne-LTR retroranspozoni i minijaturni invertovano-ponovljivi<br />
transpozoni (MITE). Mada je veæina transpozona determinisana, još nije u potpunosti<br />
poznata njihova biološka funkcija i regulacija njihove aktivnosti. Meðutim, specifièni<br />
transpozoni se mogu koristiti za genetièku analizu, kao što su: u determinaciji genetièke<br />
raznovrsnosti i filogenije, kao molekularni markeri, itd. Velièina genoma jeèma<br />
(Horedum vulgare) iznosi 4800 Mb (Arumuganathan and Erle, 1991), od èega 80% DNA<br />
èine razlièite vrste transpozona. BARE-1 transpozon jeèma je nabolje prouèen i zauzima<br />
2,9% njegovog genoma (Vicient et al., 1999), dok su drugi tipovi retrotranspozona manje<br />
ispitani. Cilj ovog rada je bio da se izvrši karakterizacija repetativnnih sekvenci DNA<br />
jeèma, utvrdi njihva lokacija i sekvencionira 9 razlièitih klonova. Korišæena je RFLP I<br />
FISH tehnika da bi se utvrdio broj kopija retrotranspozona u genomu jeèma.<br />
CHARACTERIZATION OF BARLEY REPETITIVE SEQUENCE WITH<br />
CHROMOSOME SPECIFIC PCR PRODUCTS<br />
Transposable elements are self-propagating elements, which account for major repetitive<br />
DNAs in plant genome. They can be generally classified in three groups: long terminal<br />
repeat (LTR) retrotransposons, non-LTR retrotransposons and miniature inverted-repeated<br />
transposable elements (MITEs). Although many transposable elements have been<br />
reported, biological function and regulation of their activities remain unknown. However,<br />
unique properties of transposable elements can be exploited for genome analysis<br />
such as: determining genetic diversity and phylogeny, development of molecular markers,<br />
gene tagging etc. Barley, Hordeum vulgare contains 4800 Mb DNA (Arumuganathan<br />
and Erle, 1991) and more then 80% are different transposable elements. The<br />
barley transposable element BARE-1 (Vicient et al., 1999) accounts for 2.9% of the genome<br />
and is very well characterized; others have been reported and may be less-well described.<br />
The aim of this research was to characterize chromosome specific Hordeum<br />
vulgare repeats by determination of sequence redundancy, chromosomal localization and<br />
sequence analysis of nine cloned products. Two hybridization methods RFLP and FISH<br />
were applied in order to define the number of copies in the barley genome.