Zbornik - Društvo genetičara Srbije

IV-Usm-2 ZBORNIK ABSTRAKATA III KONGRESA GENETIÈARA SRBIJE 91
Subotica, 30. novembar - 4. decembar 2004.
KARAKTERIZACIJA REPETITIVNE SEKVENCE JEÈMA SA
HROMOZOM SPECIFIÈNIM PCR PRODUKTIMA
Gordana Šurlan-Momiroviæ 1 , D. Peroviæ 2 i A. Graner 2
1
Poljoprivredni fakultet, Katedra za genetiku i oplemenjivanje biljaka, Zemun
2
Institit za genetiku i oplemenjivanje biljaka (IPK), Odeljenje genbanke,
AG MOM, Gatersleben, Nemaèka
Transpozoni su samoreplicirajuæi elementi koji su odgovorni za veæi deo repetativne
DNA u genomu biljaka. Oni se mogu klasifikovati u tri grupe: dugi terminalno ponovljivi
(LTR) retrotranspozoni, ne-LTR retroranspozoni i minijaturni invertovano-ponovljivi
transpozoni (MITE). Mada je veæina transpozona determinisana, još nije u potpunosti
poznata njihova biološka funkcija i regulacija njihove aktivnosti. Meðutim, specifièni
transpozoni se mogu koristiti za genetièku analizu, kao što su: u determinaciji genetièke
raznovrsnosti i filogenije, kao molekularni markeri, itd. Velièina genoma jeèma
(Horedum vulgare) iznosi 4800 Mb (Arumuganathan and Erle, 1991), od èega 80% DNA
èine razlièite vrste transpozona. BARE-1 transpozon jeèma je nabolje prouèen i zauzima
2,9% njegovog genoma (Vicient et al., 1999), dok su drugi tipovi retrotranspozona manje
ispitani. Cilj ovog rada je bio da se izvrši karakterizacija repetativnnih sekvenci DNA
jeèma, utvrdi njihva lokacija i sekvencionira 9 razlièitih klonova. Korišæena je RFLP I
FISH tehnika da bi se utvrdio broj kopija retrotranspozona u genomu jeèma.
CHARACTERIZATION OF BARLEY REPETITIVE SEQUENCE WITH
CHROMOSOME SPECIFIC PCR PRODUCTS
Transposable elements are self-propagating elements, which account for major repetitive
DNAs in plant genome. They can be generally classified in three groups: long terminal
repeat (LTR) retrotransposons, non-LTR retrotransposons and miniature inverted-repeated
transposable elements (MITEs). Although many transposable elements have been
reported, biological function and regulation of their activities remain unknown. However,
unique properties of transposable elements can be exploited for genome analysis
such as: determining genetic diversity and phylogeny, development of molecular markers,
gene tagging etc. Barley, Hordeum vulgare contains 4800 Mb DNA (Arumuganathan
and Erle, 1991) and more then 80% are different transposable elements. The
barley transposable element BARE-1 (Vicient et al., 1999) accounts for 2.9% of the genome
and is very well characterized; others have been reported and may be less-well described.
The aim of this research was to characterize chromosome specific Hordeum
vulgare repeats by determination of sequence redundancy, chromosomal localization and
sequence analysis of nine cloned products. Two hybridization methods RFLP and FISH
were applied in order to define the number of copies in the barley genome.