Diapositiva 1
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H 0: Beta distributed variable selective pressure (M7)<br />
H 1: Beta plus positive selection(M8)<br />
Likelihood ratio test (LRT)<br />
2Δl = 2 (l 1-l 0) χ 2 distribution<br />
SE:<br />
• IL MODELLO M8 SI ADATTA<br />
MEGLIO AI DATI<br />
• IL VALORE DI ω S STIMATO E’<br />
>1 PER LA CLASSE DI SITI<br />
p1<br />
UNA PROPORZIONE<br />
DI SITI PARI A p1 E’<br />
SOTTOPOSTA A<br />
SELEZIONE POSITIVA<br />
Quando i test suggeriscono la presenza di selezione positiva si utilizzano dei metodi Bayesiani<br />
(BEB) per calcolare la probabilità a posteriori che ciascun codone provenga dalla classe di<br />
siti sotto selezione positiva.
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