Bioinformatik: Äpfel mit Birnen vergleichen - Science Communications

FORSCHEN
Licht, Luft, Kreativität: Seit Ende 2011 kann sich
die Sektion für Bioinformatik im neu errichteten
Biozentrum (Meduni Innsbruck) entfalten.
Absolut bekömmlich: Das Humangenomprojekt
weckte den Appetit auf Bioinformatik.
6 genosphären 11/12
Österreich, sondern im gesamten deutschsprachigen
Forschungsraum“, betont der Techniker. BIN ist
es auch geschuldet, dass sich Forschungsgruppen
vernetzten, die aus so andersartigen „Regionen“ wie
Protein-, RNA- und DNA-Analyse kamen.
„Eine besondere Herausforderung in der Bioinformatik
ist die Integration und die Analyse von
Was ist Bioinformatik?
Pfeiler der Biowissenschaften
Die Bioinformatik ist eine interdisziplinäre
Wissenschaft, die Probleme aus den Lebenswissenschaften
mit theoretischen computergestützten
Methoden löst. Sie hat zu grundlegenden
Erkenntnissen der modernen Biologie und Medizin
geführt. Bekanntheit in der Öffentlichkeit erreichte
die Bioinformatik in erster Linie in den Jahren
2000 und 2001 mit ihrem wesentlichen Beitrag zur
Sequenzierung des menschlichen Genoms.
Bioinformatik ist breit gefächert: Wesentliche
Gebiete sind die Verwaltung und Integration
biologischer Daten, die Sequenzanalyse, die Strukturbioinformatik
und die Analyse von Daten aus
Hochdurchsatzmethoden. Da die Bioinformatik
unentbehrlich ist, um Daten im großen Maßstab zu
analysieren, bildet sie einen wesentlichen Pfeiler
der Systembiologie.
Daten unterschiedlicher Herkunft“, erklärt Gerhard
Thallinger. So werden etwa Labordaten wie die Zusammensetzung
von Patientenproben mit klinischen
Daten über den Krankheitsverlauf zusammengebracht.
„Molekularbiologische Untersuchungsmethoden
von Proteinen, RNA-Molekülen oder
Stoffwechselprodukten liefern immer nur Teilas-
In der Bioinformatik gilt es, neben großen
Datenmengen auch Informationen aus unterschiedlichen
Quellen zu verarbeiten. Gerade in der
Integration besteht die große Herausforderung,
da es sich um verschiedenste Datensätze handelt.
Man muss sozusagen Äpfel und Birnen vergleichbar
machen und unter einen Hut bringen.
Zu den „Äpfeln“ und „Birnen“ zählen u. a.
Labordaten, Patientendaten, die nicht quantifizierbar
sind, sogar handschriftliche Aufzeichnungen
oder Zeichnungen von beobachteten Phänomenen.
Sind diese erst einmal integriert und ausgewertet,
können die Daten – über ein Netzwerk – anderen
zur Verfügung gestellt werden.
In den Biowissenschaften geht die Tendenz
immer mehr in Richtung kombinierter Methoden
aus Informatik und Labor. Mit ihrer Hilfe entwirft
man mathematische Modelle, um medizinische
Phänomene zu simulieren und diese dann im
Labor zu bestätigen oder zu verbessern.
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