altlandkreis - Das Magazin für den westlichen Pfaffenwinkel - Ausgabe Mai/Juni 2021

Gewebeproben von Krebspatienten werden im Labor untersucht.
wurde, kommt per Express-Versand
in Penzberg an. Es handelt
sich oft um geringe Mengen, gerade
einmal wenige Millimeter
groß. Im Roche-Gebäude „433“,
wo sich die „Foundation Medicine“
niedergelassen hat, werden
nun die Patienten-Daten der jeweiligen
Probe erfasst. Anschließend
wird eine dünne Schicht von
dieser Gewebeprobe heruntergeschnitten,
deren Zellbestandteile
eingefärbt und von einem Pathologen
via Mikroskop genauer
untersucht. Der stellt dabei zwei
entscheidende Dinge fest: Ist die
Qualität der Gewebeprobe überhaupt
geeignet für eine umfassende
Datenanalyse? „Wir brauchen
dafür immer eine gewisse
Anzahl an Tumorzellen, damit der
Test zuverlässig funktioniert“, sagt
Thomas Wieland. Darüber hinaus
bestimmt der Pathologe die Art
der Krebserkrankung schon mal
genauer. Am Beispiel Lungenkrebs:
Es gibt einen kleinzelligen
und einen nicht-kleinzelligen, die
jeweils grundverschieden anzupacken
sind. Gibt der Pathologe
schließlich grünes Licht für eine
umfangreichere Datenanalyse, gelangt
die Gewebeprobe ins Labor,
wo vier größere Untersuchungs-
Schritte über drei bis vier Tage
hinweg unternommen werden.
Unter anderem wird dabei die
DNA aus dem jeweiligen Gewebe
extrahiert. „Das menschliche Genom
besitzt rund 20 000 Gene, wir
schauen uns aber nur die 324 an,
von denen wir wissen, dass sie etwas
mit Krebs-Entstehung zu tun
haben.“ Ist das „Herausfischen“
der DNA erfolgt, beginnt eine
sogenannte DNA-Sequenzierung,
womit der genetische Code des
jeweiligen Patienten ausgelesen
wird. „Dieser Vorgang dauert,
je nach Test, nochmals 24 bis 48
Stunden“, sagt Thomas Wieland,
dessen eigentliche Aufgabe als
Bioinformatiker erst jetzt beginnt:
Diese riesige Menge an Daten, die
aus dieser Sequenzierung gewonnen
wurde, auszuwerten.
Ist dieser Tumor
behandelbar?
„Wir reden hier von Rohdaten-
Mengen in Höhe von zwei bis 25
Gigabyte pro Patient, aufgelistet
in Milliarden von Buchstaben.“
Diese rund sechsstündige Auswertung
läuft dank eigens entwickelter
Software zwar automatisch
ab, trotzdem müssen Wieland
und seine Kollegen jedes einzelne
Datenprofil zusätzlich mit
eigenen Augen auf vollständige
Korrektheit und Auffälligkeiten
überprüfen. Zum Beispiel, ob die
Patienten-Angabe bei Einsendung
der Gewebeprobe mit der
Geschlechter-Bestimmung nach
der Datenanalyse noch übereinstimmt.
„So schließen wir aus,
dass Gewebeproben versehentlich
vertauscht wurden.“ Mindestens
so wichtig: Die Betrachtung unterschiedlicher
Tumor-Mu-
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