Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren
Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren
Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren
Erfolgreiche ePaper selbst erstellen
Machen Sie aus Ihren PDF Publikationen ein blätterbares Flipbook mit unserer einzigartigen Google optimierten e-Paper Software.
Auf die Abbildung der dritten Seite wird verzichtet. Sie enthält eine Gesamtübersicht aller<br />
Massen, derer Strukturen und derer Quantitäten. Der Report kann für die weitere Protokollierung<br />
im ASCII-Format exportiert werden.<br />
Die letzte Seite ist für die Bestimmung der Hüllkurve zuständig (vgl. Abb. C.3). Für jede<br />
Masse kann hier die Hüllkurve im Diagramm dargestellt werden. Ein Algorithmus filtert im<br />
Hintergrund automatisch diejenigen Peaks heraus, welche wahrscheinlich Ausreißer sind<br />
(blaue Kreise). Das Fitting erfolgt dann auf die übrig gebliebenen (roten) Punkte. Die angepasste<br />
Hüllkurve ist rot dargestellt. Die Basisfunktionen der Hüllkurve sind in grau dargestellt.<br />
Um die Güte des Fittings zu beurteilen, werden <strong>von</strong> allen Parametern die Vertrauensintervalle<br />
sowie der R² Wert angegeben. Sollte ein Fitting misslingen, besteht die Möglichkeit,<br />
die Startparameter manuell festzulegen und durch Drücken <strong>von</strong> „Find & Update“ das Fitting<br />
erneut zu starten. Beim Drücken des Knopfes „Autofit & Update“ hingegen wird versucht<br />
die besten Startparameter automatisch zu ermitteln. Sollte die Ursache eines schlechten Fittings<br />
nicht an den Startparametern liegen, sondern an der Anzahl verwendeter Basisfunktionen,<br />
so kann diese angepasst werden. Standardmäßig werden zwei Basisfunktionen verwendet.<br />
Die Anzahl kann jedoch zwischen 1 und 4 variiert werden. Sobald das Fitting ein akzep-<br />
98<br />
Abb. C.2: Zuweisung <strong>von</strong> Strukturen.