Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren

C. Massfinder II
Die Hauptseite von Massfinder II ist in Abb. C.1 zu sehen. Der obere Bereich enthält das ESI-
MS-Spektrum und der untere Bereich enthält die Maximum-Entropie-Entfaltung des Spektrums.
Die Peakserien werden im ESI-Spektrum vom Programm durch farbige Linien markiert.
Dabei entspricht jede Farbe einer anderen Masse. Auf dieser Seite besteht die Möglichkeit,
das Spektrum auf vorhandene Massen zu analysieren. Hierzu kann man sich die von MaxEnt
berechneten Massen als Linien-Peakserien oder Isotopenverteilte-Peakserien anzeigen lassen
und verifizieren, ob diese auch tatsächlich im Spektrum vorkommen oder nicht. Des Weiteren
hat man hier die Möglichkeiten, das Spektrum zu Glätten, die Basislinie abzuziehen, Peaks für
die Quantifizierung zu selektieren usw.
Abb. C.1: Hauptseite von Massfinder II.
Die nächste Seite (vgl. Abb. C.2) ist für die qualitative Auswertung konzipiert. Hier werden
für eine Masse automatisch die wahrscheinlichsten Modifikationen aus einer gegebenen Modifikationsliste
gefunden. Bei der Suchmethode kann zwischen direkter Suche und genetischem
Algorithmus gewählt werden.
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