Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren
Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren
B. Quantifizierungsergebnisse empirischer Spektren Ergebnisse der Quantifizierung von 10 Antikörper-Spektren mit verschiedenen Methoden. Moleküle, die mittels der 4. Ableitung quantifiziert wurden, sind durch das Symbol * markiert. Bei AK4 und AK5 wurden manche Massen zusammengefasst, weil diese eine gemeinsame Glykosylierungsbasis haben. Molekül Massen Basislinie: nicht abgezogen QA1 QA2 QA3 Basislinie: Tal zu Tal QA1 QA2 QA3 AK1 50116 11,1% 11,1% 11,5% 8,3% 9,7% 8,7% 50278 20,0% 20,0% 22,2% 21,8% 25,7% 26,6% 50440 25,5% 25,5% 25,3% 30,7% 29,5% 30,5% 50601 14,9% 14,9% 14,0% 13,8% 11,7% 11,6% 50762 16,9% 16,9% 16,3% 16,8% 16,7% 16,4% 50909 11,7% 11,7% 10,9% 8,7% 6,8% 6,3% 92 Manuell / In-House MaxEnt QA1 Basislinie: Spline QA2 QA3 Basislinie: 4. Ableitung QA1 QA2 QA3 9,5% 12,7% 9,3% 9,3% 9,7% 9,6% 12,4% 9,5% 25,4% 24,2% 21,1% 21,1% 24,2% 22,8% 29,2% 29,6% 29,2% 30,7% 28,5% 28,5% 28,6% 31,5% 31,3% 34,2% 11,2% 13,9% 14,3% 14,3% 12,7% 12,5% 10,6% 11,0% 17,3% 12,7% 16,9% 16,9% 16,4% 17,1% 9,9% 10,8% 7,4% 5,8% 10,0% 10,0% 8,4% 6,5% 6,6% 4,9% Molekül Massen Basislinie: nicht abgezogen QA1 QA2 QA3 Basislinie: Tal zu Tal QA1 QA2 QA3 AK2 50602 46,7% 48,8% 50,3% 63,5% 63,6% 68,7% * 50764 23,6% 24,4% 23,7% 21,6% 23,2% 23,4% 50927 14,2% 13,1% 13,1% 7,5% 7,4% 5,5% 49157 15,5% 13,7% 12,9% 7,5% 5,9% 2,5% Manuell / In-House MaxEnt QA1 Basislinie: Spline QA2 QA3 Basislinie: 4. Ableitung QA1 QA2 QA3 69,5% 83,0% 54,4% 55,9% 62,8% 58,2% 60,2% 72,3% 25,5% 14,3% 23,2% 24,2% 24,8% 22,0% 23,5% 22,0% 3,1% 2,5% 10,4% 9,8% 5,9% 9,9% 8,0% 3,3% 2,0% 0,2% 12,1% 10,1% 6,5% 9,9% 8,3% 2,4% Molekül Massen Basislinie: nicht abgezogen QA1 QA2 QA3 Basislinie: Tal zu Tal QA1 QA2 QA3 AK3 50602 47,8% 50,0% 49,6% 63,8% 66,4% 70,6% * 50764 23,4% 24,3% 24,8% 22,3% 23,6% 24,5% 50927 13,9% 12,9% 13,3% 6,6% 5,3% 3,2% 49157 15,2% 12,9% 12,4% 7,3% 4,7% 1,7% Manuell / In-House MaxEnt QA1 Basislinie: Spline QA2 QA3 Basislinie: 4. Ableitung QA1 QA2 QA3 69,5% 83,0% 56,1% 58,9% 61,8% 64,6% 65,8% 74,3% 25,5% 14,3% 22,8% 24,2% 24,2% 20,7% 24,2% 23,7% 3,1% 2,5% 9,7% 8,7% 7,6% 6,2% 5,2% 0,9% 2,0% 0,2% 11,4% 8,2% 6,4% 8,6% 4,9% 1,1%
Molekül AK4 49813 50015 50182 Manuell / In-House 9,0% 34,0% 40,0% 17,0% Molekül 49901 49959 50089 50121 50063 50222 50282 AK5 49732 49813 50017 Manuell / In-House 9,3% 54,6% 29,9% Massen MaxEnt 10,1% 35,6% 37,2% 17,0% Massen 49960 50089 50121 50252 Basislinie: nicht abgezogen Basislinie: Tal zu Tal QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3 26,8% 29,8% 29,2% 18,4% 19,8% 19,1% Basislinie: Spline Basislinie: 4. Ableitung QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3 16,3% 15,4% 8,2% 5,5% 41,5% 39,2% 39,4% Basislinie: nicht abgezogen Basislinie: Tal zu Tal QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3 28,9% 24,3% 31,4% 29,4% 13,9% 31,5% 31,1% 37,8% 38,4% 40,2% 27,4% 28,0% 25,4% 10,3% 9,2% 51,3% 59,1% 60,9% 26,9% 26,3% 50279 8,7% 10,0% 9,2% 3,6% 3,6% 3,6% MaxEnt 14,5% 53,8% 21,4% 33,5% 18,8% 34,5% 28,8% 17,9% 19,4% 24,6% 22,7% Basislinie: Spline Basislinie: 4. Ableitung QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3 26,2% 19,0% 15,2% 41,9% 43,6% 47,6% 25,3% 24,5% 28,4% 19,0% 22,3% 32,9% 34,8% 20,2% 29,8% 12,2% 5,5% 39,4% 36,6% 33,6% 14,8% 39,2% 14,8% 19,8% 42,6% 15,3% 15,0% 4,3% 36,1% 44,8% 14,7% 14,7% 30,3% 11,4% 8,8% 45,7% 53,0% 59,3% 17,9% 37,5% 27,4% 40,5% 28,3% 6,2% 6,5% 7,5% 9,0% 7,4% 6,0% 8,3% 3,6% 93
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Molekül<br />
AK4 49813<br />
50015<br />
50182<br />
Manuell /<br />
In-House<br />
9,0%<br />
34,0%<br />
40,0%<br />
17,0%<br />
Molekül<br />
49901<br />
49959<br />
50089<br />
50121<br />
50063<br />
50222<br />
50282<br />
AK5 49732<br />
49813<br />
50017<br />
Manuell /<br />
In-House<br />
9,3%<br />
54,6%<br />
29,9%<br />
Massen<br />
MaxEnt<br />
10,1%<br />
35,6%<br />
37,2%<br />
17,0%<br />
Massen<br />
49960<br />
50089<br />
50121<br />
50252<br />
Basislinie: nicht abgezogen<br />
Basislinie: Tal zu Tal<br />
QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3<br />
26,8% 29,8% 29,2%<br />
18,4% 19,8% 19,1%<br />
Basislinie: Spline Basislinie: 4. Ableitung<br />
QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3<br />
16,3%<br />
15,4% 8,2% 5,5%<br />
41,5% 39,2% 39,4%<br />
Basislinie: nicht abgezogen<br />
Basislinie: Tal zu Tal<br />
QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3<br />
28,9% 24,3%<br />
31,4% 29,4%<br />
13,9%<br />
31,5% 31,1%<br />
37,8% 38,4% 40,2%<br />
27,4% 28,0%<br />
25,4% 10,3% 9,2%<br />
51,3%<br />
59,1% 60,9%<br />
26,9% 26,3%<br />
50279 8,7% 10,0% 9,2% 3,6% 3,6% 3,6%<br />
MaxEnt<br />
14,5%<br />
53,8%<br />
21,4%<br />
33,5%<br />
18,8%<br />
34,5%<br />
28,8%<br />
17,9% 19,4%<br />
24,6%<br />
22,7%<br />
Basislinie: Spline Basislinie: 4. Ableitung<br />
QA1 QA2 QA3 QA1 QA2 QA3<br />
26,2% 19,0% 15,2%<br />
41,9% 43,6% 47,6%<br />
25,3% 24,5% 28,4%<br />
19,0% 22,3%<br />
32,9% 34,8%<br />
20,2%<br />
29,8%<br />
12,2% 5,5%<br />
39,4% 36,6%<br />
33,6%<br />
14,8%<br />
39,2%<br />
14,8%<br />
19,8%<br />
42,6%<br />
15,3%<br />
15,0%<br />
4,3%<br />
36,1%<br />
44,8%<br />
14,7%<br />
14,7%<br />
30,3% 11,4% 8,8%<br />
45,7% 53,0% 59,3%<br />
17,9%<br />
37,5%<br />
27,4%<br />
40,5%<br />
28,3%<br />
6,2% 6,5% 7,5% 9,0% 7,4% 6,0% 8,3% 3,6%<br />
93
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