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Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren

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B. Quantifizierungsergebnisse empirischer Spektren<br />

Ergebnisse der Quantifizierung <strong>von</strong> 10 Antikörper-Spektren mit verschiedenen Methoden.<br />

Moleküle, die mittels der 4. Ableitung quantifiziert wurden, sind durch das Symbol * markiert.<br />

Bei AK4 und AK5 wurden manche Massen zusammengefasst, weil diese eine gemeinsame<br />

Glykosylierungsbasis haben.<br />

Molekül Massen<br />

Basislinie: nicht abgezogen<br />

QA1 QA2 QA3<br />

Basislinie: Tal zu Tal<br />

QA1 QA2 QA3<br />

AK1 50116 11,1% 11,1% 11,5% 8,3% 9,7% 8,7%<br />

50278 20,0% 20,0% 22,2% 21,8% 25,7% 26,6%<br />

50440 25,5% 25,5% 25,3% 30,7% 29,5% 30,5%<br />

50601 14,9% 14,9% 14,0% 13,8% 11,7% 11,6%<br />

50762 16,9% 16,9% 16,3% 16,8% 16,7% 16,4%<br />

50909 11,7% 11,7% 10,9% 8,7% 6,8% 6,3%<br />

92<br />

Manuell /<br />

In-House<br />

MaxEnt<br />

QA1<br />

Basislinie: Spline<br />

QA2 QA3<br />

Basislinie: 4. Ableitung<br />

QA1 QA2 QA3<br />

9,5% 12,7% 9,3% 9,3% 9,7% 9,6% 12,4% 9,5%<br />

25,4% 24,2% 21,1% 21,1% 24,2% 22,8% 29,2% 29,6%<br />

29,2% 30,7% 28,5% 28,5% 28,6% 31,5% 31,3% 34,2%<br />

11,2% 13,9% 14,3% 14,3% 12,7% 12,5% 10,6% 11,0%<br />

17,3% 12,7% 16,9% 16,9% 16,4% 17,1% 9,9% 10,8%<br />

7,4% 5,8% 10,0% 10,0% 8,4% 6,5% 6,6% 4,9%<br />

Molekül Massen<br />

Basislinie: nicht abgezogen<br />

QA1 QA2 QA3<br />

Basislinie: Tal zu Tal<br />

QA1 QA2 QA3<br />

AK2 50602 46,7% 48,8% 50,3% 63,5% 63,6% 68,7%<br />

* 50764 23,6% 24,4% 23,7% 21,6% 23,2% 23,4%<br />

50927 14,2% 13,1% 13,1% 7,5% 7,4% 5,5%<br />

49157 15,5% 13,7% 12,9% 7,5% 5,9% 2,5%<br />

Manuell /<br />

In-House<br />

MaxEnt<br />

QA1<br />

Basislinie: Spline<br />

QA2 QA3<br />

Basislinie: 4. Ableitung<br />

QA1 QA2 QA3<br />

69,5% 83,0% 54,4% 55,9% 62,8% 58,2% 60,2% 72,3%<br />

25,5% 14,3% 23,2% 24,2% 24,8% 22,0% 23,5% 22,0%<br />

3,1% 2,5% 10,4% 9,8% 5,9% 9,9% 8,0% 3,3%<br />

2,0% 0,2% 12,1% 10,1% 6,5% 9,9% 8,3% 2,4%<br />

Molekül Massen<br />

Basislinie: nicht abgezogen<br />

QA1 QA2 QA3<br />

Basislinie: Tal zu Tal<br />

QA1 QA2 QA3<br />

AK3 50602 47,8% 50,0% 49,6% 63,8% 66,4% 70,6%<br />

* 50764 23,4% 24,3% 24,8% 22,3% 23,6% 24,5%<br />

50927 13,9% 12,9% 13,3% 6,6% 5,3% 3,2%<br />

49157 15,2% 12,9% 12,4% 7,3% 4,7% 1,7%<br />

Manuell /<br />

In-House<br />

MaxEnt<br />

QA1<br />

Basislinie: Spline<br />

QA2 QA3<br />

Basislinie: 4. Ableitung<br />

QA1 QA2 QA3<br />

69,5% 83,0% 56,1% 58,9% 61,8% 64,6% 65,8% 74,3%<br />

25,5% 14,3% 22,8% 24,2% 24,2% 20,7% 24,2% 23,7%<br />

3,1% 2,5% 9,7% 8,7% 7,6% 6,2% 5,2% 0,9%<br />

2,0% 0,2% 11,4% 8,2% 6,4% 8,6% 4,9% 1,1%

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