Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren

Die Daten aus Anhang A sind in Tabelle 5.2.2 zusammengefasst worden. Dabei sieht man,
dass die Quantifizierung per Hand, mit MaxEnt sowie mit QA3 über die 4. Ableitung die besten
Ergebnisse liefern. Die Tatsache, dass sich mit den hier entwickelten Methoden selbst
schwierige Spektren wie AK5 und AK6 quantifizieren lassen, spricht für die Robustheit von
Massfinder II.
MaxEnt hat durch seine Genauigkeit für diese Problemklasse überrascht, wo doch die allgemeine
Meinung kursiert, dass es für die Quantifizierung nicht geeignet ist. Die Tatsache, dass
es sich beim MaxEnt-Algorithmus um ein Black-Box-System handelt, spricht allerdings gegen
dessen Verwendung, denn man kann sich nie wirklich sicher sein, ob ein Fehler nun auftritt
oder nicht.
82
1000%
100%
10%
1%
Abb. 5.2.7: Quantifizierungsvarianz von MF II bei Abzug der Basislinie mit dem Tal zu Tal verfahren.
Basislinie:
nicht
abgezogen
Basislinie:
Tal zu Tal
Manuell
MaxEnt
In-House Lösung
1,4%
1,5%
5,2%
Basislinie: Tal zu Tal
0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 70% 80% 90%
QA1 5,1% QA1 4,8%
Basislinie:
QA2 3,8% QA2 3,9%
Spline
QA3 3,2% QA3 2,7%
QA1 2,5% QA1 2,7%
Basislinie: 4.
QA2 1,3% QA2 2,0%
Ableitung
QA3 1,6% QA3 1,3%
QA1
QA2
QA3
Tabelle 5.2.2: Zusammenfassung
der Validierung.
Es sind die durchschnittlichenStandardabweichungenangegeben.
Es sind nur diejenigen
Datensätze verwendet,
bei denen alle Methoden
ein Ergebnis geliefert
haben.