Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren

chen Modifikationen, so sieht man, dass nur Addukt-Signale in Frage kommen. Wie sich herausstellt,
ist die gesuchte Masse, welche mit M1 im Spektrum überlappt, M3=24222,21D, eine
Na-Addukt Variante von MLK. Im Spektrum wurde sie wahrscheinlich übersehen, weil es
für jeden z-Wert in die Peaks von M1 reinfällt. Nachdem diese Addukt-Variante erfasst und im
Programm eingetragen wird, verschwindet jeder zweite Punkt und ein Fitting der Hüllkurve
ist möglich (vgl. Abb. 3.6.4.2).
Abb. 3.6.4.2:
Links: Gefittete Hüllkurve der Masse 48454,71D nach
Erkennung der Ausreißer.
Unten: Ausschnitt aus dem Spektrum von CD22. Die
grüne Peakserie entspricht einer Varianten der schweren
Kette mit einer Masse von 48454,71D. Die blaue
Peakserie entspricht dem Na-Addukt der leichten Kette
und hat eine Masse von 24222,21D. Man sieht wie
in jedem zweiten Signal die beiden Massen überlagern.
Nicht immer sind die Fälle so extrem wie der hier vorgestellte. Es kann durchaus vorkommen,
dass es nur ein oder zwei Ausreißer gibt. Ebenso kann es sein, dass die Intensitätsunterschiede
nicht so stark sind wie die hier gezeigten. Dies ist z.B. der Fall, wenn Addukt-Varianten der
schweren Kette verantwortlich sind. Diese haben ja eine geringere Intensität im Spektrum und
fallen dementsprechend nicht so stark auf bei Überlappungen.
Da solche Addukt-Signale immer wieder vorkommen und nicht immer annotiert werden, ist
eine Methode wünschenswert, welche automatisch erkennt, ob es sich bei den Punkten um
Ausreißer handelt oder nicht:
Von allen Massen werden die Addukt-Varianten simuliert. Da es bis zu einer n-fachen Anlagerung
von Na + oder K + Ionen an ein Molekül kommen kann, wird die Zahl auf maximal zwei
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